More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0038 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_0038  IstB domain protein ATP-binding protein  100 
 
 
246 aa  505  9.999999999999999e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0053  IstB domain protein ATP-binding protein  55.51 
 
 
246 aa  285  7e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1545  IstB domain protein ATP-binding protein  55.51 
 
 
246 aa  285  7e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.138616  normal  0.0723168 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1428  IstB ATP binding domain-containing protein  51.84 
 
 
248 aa  282  4.0000000000000003e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1483  IstB ATP binding domain-containing protein  51.84 
 
 
248 aa  282  4.0000000000000003e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1926  IstB ATP binding domain-containing protein  51.84 
 
 
248 aa  282  4.0000000000000003e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.39918  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2240  IstB ATP binding domain-containing protein  51.84 
 
 
248 aa  282  4.0000000000000003e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1549  IstB domain protein ATP-binding protein  53.11 
 
 
250 aa  280  2e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1595  IstB domain protein ATP-binding protein  53.11 
 
 
250 aa  280  2e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0526328  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1831  ATPase  49.8 
 
 
246 aa  275  4e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00675411  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0849  IstB domain protein ATP-binding protein  50.83 
 
 
247 aa  263  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.343949  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2119  IstB domain protein ATP-binding protein  50.83 
 
 
247 aa  263  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132197  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4852  IstB domain protein ATP-binding protein  50.83 
 
 
247 aa  263  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.552048  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4303  IstB domain protein ATP-binding protein  50.83 
 
 
247 aa  263  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00287796 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3789  IstB domain protein ATP-binding protein  50.83 
 
 
247 aa  263  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0641169 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4233  IstB domain protein ATP-binding protein  50.83 
 
 
247 aa  263  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0581118  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6804  IstB domain protein ATP-binding protein  50.83 
 
 
247 aa  263  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6979  IstB domain protein ATP-binding protein  50.83 
 
 
247 aa  263  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2153  IstB domain protein ATP-binding protein  50.83 
 
 
247 aa  263  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.207547  normal  0.27673 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5320  IstB domain protein ATP-binding protein  50.83 
 
 
247 aa  263  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.506413 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6472  IstB domain protein ATP-binding protein  50.83 
 
 
247 aa  263  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6164  IstB domain protein ATP-binding protein  50.83 
 
 
247 aa  263  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5581  IstB domain protein ATP-binding protein  50.83 
 
 
247 aa  263  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2962  IstB domain protein ATP-binding protein  50.83 
 
 
247 aa  263  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2787  IstB domain protein ATP-binding protein  50.83 
 
 
247 aa  263  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.127122  normal  0.026191 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3693  IstB domain protein ATP-binding protein  50.83 
 
 
247 aa  263  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00207193  hitchhiker  0.0014284 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3091  IstB domain protein ATP-binding protein  50.83 
 
 
247 aa  263  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.660064  normal  0.664681 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3294  IstB domain protein ATP-binding protein  50.83 
 
 
247 aa  263  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.76847 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1251  IstB ATP binding domain-containing protein  45.75 
 
 
251 aa  219  3e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2842  ISPsy14, transposition helper protein  44.58 
 
 
251 aa  209  5e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00133865  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1939  IstB-like ATP-binding protein  43.51 
 
 
245 aa  206  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.149636  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1733  IstB ATP binding domain-containing protein  44.72 
 
 
245 aa  205  5e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0984336 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1854  IstB ATP binding domain-containing protein  44.72 
 
 
245 aa  205  5e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0848182  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3593  IstB ATP binding domain-containing protein  44.72 
 
 
245 aa  205  5e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0411  IstB ATP binding domain-containing protein  41.87 
 
 
251 aa  204  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.101177  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0597  IstB ATP binding domain-containing protein  41.87 
 
 
251 aa  204  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1853  IstB ATP binding domain-containing protein  41.87 
 
 
251 aa  204  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.262764  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2255  IstB ATP binding domain-containing protein  41.87 
 
 
251 aa  204  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152335  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2397  IstB ATP binding domain-containing protein  41.87 
 
 
251 aa  204  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0127781  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3179  IstB ATP binding domain-containing protein  41.87 
 
 
251 aa  204  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4228  IstB ATP binding domain-containing protein  41.87 
 
 
251 aa  202  3e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0998  IstB ATP binding domain-containing protein  42.28 
 
 
251 aa  202  3e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0192  IstB ATP binding domain-containing protein  41.87 
 
 
251 aa  202  4e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1629  IstB ATP binding domain-containing protein  41.87 
 
 
251 aa  202  4e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2981  IstB ATP binding domain-containing protein  41.46 
 
 
251 aa  199  3e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0623611  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1373  transposition helper protein  43.22 
 
 
252 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0960565  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1225  IstB ATP binding domain-containing protein  43.46 
 
 
251 aa  199  3.9999999999999996e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2661  IstB ATP binding domain-containing protein  43.46 
 
 
251 aa  199  3.9999999999999996e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3188  IstB ATP binding domain-containing protein  43.28 
 
 
243 aa  199  3.9999999999999996e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3709  IstB ATP binding domain-containing protein  43.28 
 
 
243 aa  199  3.9999999999999996e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.543229  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0987  IstB ATP binding domain-containing protein  43.46 
 
 
251 aa  199  5e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.114335  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1076  IstB ATP binding domain-containing protein  43.46 
 
 
251 aa  199  5e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.664237  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1298  IstB ATP binding domain-containing protein  43.46 
 
 
251 aa  199  5e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1794  putative transposase-related ATP-binding subunit  40.33 
 
 
249 aa  198  6e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.537102  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5412  IstB ATP binding domain-containing protein  43.33 
 
 
252 aa  198  6e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.687138 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0891  IstB ATP binding domain-containing protein  43.04 
 
 
251 aa  198  7e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0613  IstB ATP binding domain-containing protein  42.62 
 
 
254 aa  197  9e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.328728  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5453  IstB ATP binding domain-containing protein  43.16 
 
 
252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9836  transposase  42.56 
 
 
258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1327  IstB ATP binding domain-containing protein  43.72 
 
 
246 aa  196  3e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2290  IstB ATP binding domain-containing protein  40.08 
 
 
249 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4731  IstB ATP binding domain-containing protein  39.83 
 
 
249 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5782  IstB ATP binding domain-containing protein  39.83 
 
 
249 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6207  IstB ATP binding domain-containing protein  39.83 
 
 
249 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5629  IstB ATP binding domain-containing protein  39.83 
 
 
249 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4797  IstB ATP binding domain-containing protein  40.08 
 
 
249 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4289  IstB ATP binding domain-containing protein  42.55 
 
 
243 aa  195  7e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.991819  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4397  IstB ATP binding domain-containing protein  42.55 
 
 
243 aa  195  7e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.101635  normal  0.403377 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4787  IstB ATP binding domain-containing protein  42.55 
 
 
243 aa  195  7e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2786  IstB-like ATP-binding protein  41.15 
 
 
250 aa  194  8.000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0707  IstB ATP binding domain-containing protein  39.34 
 
 
258 aa  194  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.164792  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4129  IstB ATP binding domain-containing protein  42.62 
 
 
251 aa  194  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0135  IstB domain protein ATP-binding protein  38.56 
 
 
245 aa  192  3e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.474509 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1364  IstB domain protein ATP-binding protein  38.56 
 
 
245 aa  192  3e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.670148 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4137  IstB ATP binding domain-containing protein  41.08 
 
 
246 aa  192  4e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6464  IstB ATP binding domain-containing protein  42.26 
 
 
245 aa  192  5e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.390646  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1477  putative insertion sequence ATP-binding protein y4pL  42.51 
 
 
247 aa  191  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1462  putative insertion sequence ATP-binding protein y4pL  42.51 
 
 
247 aa  191  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.844305  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6259  IstB-like ATP-binding protein  39.58 
 
 
251 aa  190  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111969  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3715  IstB domain protein ATP-binding protein  38.24 
 
 
253 aa  190  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.0923789 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1555  IstB ATP binding domain-containing protein  41.91 
 
 
252 aa  187  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2054  IstB ATP binding domain-containing protein  41.91 
 
 
252 aa  187  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3415  IstB ATP binding domain-containing protein  41.91 
 
 
252 aa  187  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.237509  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5655  IstB domain protein ATP-binding protein  39.34 
 
 
247 aa  186  4e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3739  hypothetical protein  39.75 
 
 
256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3594  IstB ATP binding domain-containing protein  39.42 
 
 
250 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.687759  normal  0.527092 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3484  IstB ATP binding domain-containing protein  38.98 
 
 
248 aa  181  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.837438  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2302  IstB ATP binding domain-containing protein  38.98 
 
 
248 aa  181  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0282  IstB ATP binding domain-containing protein  38.98 
 
 
248 aa  181  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.624966  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4858  IstB ATP binding domain-containing protein  40.93 
 
 
252 aa  180  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149382  normal  0.323765 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3400  IstB ATP binding domain-containing protein  38.56 
 
 
248 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5195  IstB-like ATP-binding protein  39 
 
 
262 aa  179  4e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.673267 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0558  IstB ATP binding domain-containing protein  38.72 
 
 
246 aa  177  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3434  IstB ATP binding domain-containing protein  44.06 
 
 
224 aa  176  4e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1810  IstB ATP binding domain-containing protein  38.17 
 
 
243 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1946  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7670  IstB ATP binding domain-containing protein  38.49 
 
 
252 aa  170  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.957844  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7435  IstB ATP binding domain-containing protein  38.49 
 
 
252 aa  170  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.277043  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3288  IstB ATP binding domain-containing protein  41.46 
 
 
219 aa  169  3e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00183  transposase  41.81 
 
 
246 aa  168  7e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5849  IstB domain protein ATP-binding protein  37.92 
 
 
249 aa  168  7e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>