36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0016 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0016  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  100 
 
 		 288 aa  606  9.999999999999999e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0716  hypothetical protein  41.9 
 
 		 277 aa  211  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.267055  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1229  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  40.07 
 
 		 302 aa  192  6e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1486  hypothetical protein  39.46 
 
 		 297 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.537433 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3184  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.56 
 
 		 343 aa  184  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000598949 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2085  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  39.04 
 
 		 562 aa  176  5e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.11018  normal  0.0186751 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0798  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.94 
 
 		 612 aa  161  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3429  hypothetical protein  34.59 
 
 		 609 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3074  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.59 
 
 		 612 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0393435  normal  0.650719 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3617  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  36.72 
 
 		 278 aa  102  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.114842  hitchhiker  0.000813771 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1203  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.57 
 
 		 979 aa  82  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0815381  normal  0.647955 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1884  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.85 
 
 		 907 aa  75.5  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2725  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.09 
 
 		 275 aa  65.9  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.297841  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54872  metacaspase  33.33 
 
 		 322 aa  65.1  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2795  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.46 
 
 		 1316 aa  65.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.45059  normal  0.111858 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4190  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.6 
 
 		 265 aa  64.7  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_51953  metacaspase  32.53 
 
 		 292 aa  62.8  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1383  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.03 
 
 		 615 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.224094  hitchhiker  0.00154114 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1658  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.17 
 
 		 615 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0826255  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0891  metacaspase  33.98 
 
 		 293 aa  57  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83452  predicted protein  24.49 
 
 		 403 aa  55.5  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3436  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.93 
 
 		 654 aa  52.4  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0303831  normal  0.42881 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63918  predicted protein  23.65 
 
 		 378 aa  51.2  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1374  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.08 
 
 		 301 aa  51.2  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.285765  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1193  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.86 
 
 		 275 aa  49.7  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48151  metacaspase  26.58 
 
 		 369 aa  49.3  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6571  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.08 
 
 		 633 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0867  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.85 
 
 		 491 aa  47.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0144143  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1607  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.7 
 
 		 276 aa  47.4  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.547133  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0825  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.1 
 
 		 298 aa  45.8  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6471  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.06 
 
 		 1274 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.707662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1254  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.25 
 
 		 270 aa  44.3  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2371  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.53 
 
 		 561 aa  43.9  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0175028 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32992  metacaspase  27.35 
 
 		 633 aa  42.7  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.696617  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1553  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.85 
 
 		 285 aa  43.1  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.356891  normal  0.142673 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0287  polysaccharide deacetylase  23.93 
 
 		 871 aa  42.4  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>