17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0007 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0007  hypothetical protein  100 
 
 		 271 aa  543  1e-154  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2737  hypothetical protein  31.34 
 
 		 262 aa  90.9  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0444966  normal  0.0153273 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0120  hypothetical protein  30.5 
 
 		 313 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0283  hypothetical protein  30.73 
 
 		 290 aa  82  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03699  hypothetical protein  26.27 
 
 		 287 aa  75.9  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532956  normal  0.882809 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0495  hypothetical protein  25.39 
 
 		 284 aa  73.9  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4795  hypothetical protein  29.66 
 
 		 301 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0124929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1647  hypothetical protein  29.66 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1622  hypothetical protein  29.66 
 
 		 301 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00407724 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1591  hypothetical protein  27.4 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.196287  normal  0.0406623 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1548  hypothetical protein  29.08 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268009  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1567  hypothetical protein  29.85 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.335992  normal  0.17582 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1829  hypothetical protein  29.1 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23030  hypothetical protein  30.94 
 
 		 241 aa  51.6  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.340517  normal  0.0165029 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10854  hypothetical protein  28.57 
 
 		 248 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.52115e-35  decreased coverage  0.00000000784145 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1167  hypothetical protein  30.19 
 
 		 250 aa  49.3  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0440  hypothetical protein  27.08 
 
 		 263 aa  48.1  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>