234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0006 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_0006  Alkaline phosphatase  100 
 
 
610 aa  1263    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.50499  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1383  Alkaline phosphatase  51.32 
 
 
608 aa  604  1.0000000000000001e-171  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.882146 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3249  alkaline phosphatase  51.32 
 
 
607 aa  590  1e-167  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.565022  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4822  alkaline phosphatase  42.63 
 
 
261 aa  217  5e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0870  Alkaline phosphatase  37.15 
 
 
381 aa  207  3e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0770  alkaline phosphatase  33.83 
 
 
434 aa  201  3.9999999999999996e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0793  alkaline phosphatase  34.09 
 
 
434 aa  199  2.0000000000000003e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1137  alkaline phosphatase  41.24 
 
 
436 aa  192  1e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0754  alkaline phosphatase  37.37 
 
 
433 aa  174  3.9999999999999995e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2306  Alkaline phosphatase  31.92 
 
 
450 aa  164  5.0000000000000005e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2889  alkaline phosphatase  33.81 
 
 
388 aa  161  4e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2650  alkaline phosphatase  36.9 
 
 
474 aa  160  6e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2208  alkaline phosphatase family protein  36.27 
 
 
489 aa  160  6e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.463635  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2706  alkaline phosphatase  36.9 
 
 
474 aa  160  6e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4244  alkaline phosphatase  39.06 
 
 
461 aa  159  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00456064  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4574  alkaline phosphatase  39.06 
 
 
461 aa  159  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4478  alkaline phosphatase  39.06 
 
 
461 aa  159  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4426  alkaline phosphatase  39.06 
 
 
461 aa  159  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4082  alkaline phosphatase  38.72 
 
 
461 aa  158  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000108141  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4093  alkaline phosphatase  39.06 
 
 
461 aa  158  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000430815  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002902  alkaline phosphatase  32.46 
 
 
525 aa  157  4e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1241  Alkaline phosphatase  35.12 
 
 
455 aa  157  4e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4427  alkaline phosphatase  37.83 
 
 
461 aa  156  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000511978  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4466  alkaline phosphatase  38.38 
 
 
461 aa  156  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4194  alkaline phosphatase  37.5 
 
 
461 aa  155  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2754  Alkaline phosphatase  34.97 
 
 
547 aa  155  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0771  alkaline phosphatase  37.46 
 
 
461 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000868006  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3069  alkaline phosphatase  36.67 
 
 
461 aa  152  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.13276  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03057  alkaline phosphatase  32.81 
 
 
525 aa  150  9e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0502  alkaline phosphatase  32.34 
 
 
554 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.7219 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4547  alkaline phosphatase  34.2 
 
 
464 aa  148  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.19358  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1480  Alkaline phosphatase  31.96 
 
 
548 aa  147  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3038  alkaline phosphatase  32.9 
 
 
553 aa  145  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.146632  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3533  hypothetical protein  33.61 
 
 
323 aa  145  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.822199  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2129  secreted protein  30.26 
 
 
288 aa  144  5e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.330008 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2719  alkaline phosphatase  32.48 
 
 
557 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.719962  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0524  Alkaline phosphatase  35.35 
 
 
537 aa  143  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1231  alkaline phosphatase  33.01 
 
 
589 aa  141  3e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21484  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1220  alkaline phosphatase  32.67 
 
 
454 aa  141  3.9999999999999997e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.199561 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2238  alkaline phosphatase  32.17 
 
 
557 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177606  hitchhiker  0.000000857533 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2738  alkaline phosphatase  31.85 
 
 
557 aa  139  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.133398  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3003  alkaline phosphatase  31.85 
 
 
557 aa  139  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3057  alkaline phosphatase  31.85 
 
 
557 aa  139  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.290343  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1253  alkaline phosphatase  38.19 
 
 
335 aa  139  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0410  alkaline phosphatase  29.28 
 
 
471 aa  139  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2999  alkaline phosphatase  31.86 
 
 
557 aa  139  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000886968 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0457  alkaline phosphatase  29.28 
 
 
471 aa  139  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2789  alkaline phosphatase  31.86 
 
 
557 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.670968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3001  alkaline phosphatase  31.86 
 
 
557 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00980111  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0413  alkaline phosphatase  29.03 
 
 
471 aa  138  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00330  bacterial alkaline phosphatase  29.53 
 
 
471 aa  137  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.744596  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3225  Alkaline phosphatase  29.03 
 
 
471 aa  137  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3036  alkaline phosphatase  31.53 
 
 
557 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000723096  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00334  hypothetical protein  29.53 
 
 
471 aa  137  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.644931  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1200  alkaline phosphatase  30.73 
 
 
481 aa  137  8e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0451  alkaline phosphatase  29.03 
 
 
471 aa  136  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3249  alkaline phosphatase  28.78 
 
 
471 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0984857 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2371  alkaline phosphatase  32.62 
 
 
559 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2693  alkaline phosphatase  34.33 
 
 
501 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1163  alkaline phosphatase  30.73 
 
 
454 aa  131  3e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4257  secreted protein  31.33 
 
 
311 aa  132  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.256358 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3513  hypothetical protein  34.62 
 
 
646 aa  131  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0854  alkaline phosphatase  29.64 
 
 
471 aa  132  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0691432 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1528  alkaline phosphatase  30.65 
 
 
475 aa  131  4.0000000000000003e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0989  alkaline phosphatase  34.03 
 
 
480 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.544846  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0198  Alkaline phosphatase  30.23 
 
 
541 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3829  Alkaline phosphatase  29.51 
 
 
536 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2292  Alkaline phosphatase  31.6 
 
 
487 aa  127  6e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3027  alkaline phosphatase  32.01 
 
 
501 aa  126  9e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0541  alkaline phosphatase  34.17 
 
 
506 aa  126  1e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.208558  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82654  vacuolar alkaline phosphatase  31.05 
 
 
560 aa  126  1e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.134835 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0541  alkaline phosphatase  31.34 
 
 
455 aa  125  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0573  alkaline phosphatase  33.45 
 
 
492 aa  125  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.949232  normal  0.22493 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3331  Alkaline phosphatase  30.41 
 
 
485 aa  125  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.971304  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2627  alkaline phosphatase  29.91 
 
 
530 aa  124  4e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3654  Alkaline phosphatase  30.09 
 
 
485 aa  124  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2976  alkaline phosphatase  32.65 
 
 
461 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3974  alkaline phosphatase  32.16 
 
 
457 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3163  alkaline phosphatase  32.04 
 
 
440 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116431  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43722  vacuolar alkaline phosphatase  31.55 
 
 
501 aa  120  4.9999999999999996e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.563768  normal  0.0682876 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0839  alkaline phosphatase  32.3 
 
 
439 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.029758  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1207  alkaline phosphatase  34.62 
 
 
464 aa  120  6e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0124836  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0192  alkaline phosphatase  32.87 
 
 
400 aa  120  6e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.282333  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4084  alkaline phosphatase  29.38 
 
 
486 aa  120  6e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0795005  normal  0.541541 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1530  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.71 
 
 
672 aa  120  6e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0816  Alkaline phosphatase  31.25 
 
 
426 aa  120  7e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3529  alkaline phosphatase  32.42 
 
 
425 aa  120  7e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3226  alkaline phosphatase  30.96 
 
 
543 aa  120  7e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0832  Alkaline phosphatase  32.42 
 
 
439 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.201361  hitchhiker  0.000000624309 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0807  alkaline phosphatase  32.42 
 
 
439 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.157907  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5568  alkaline phosphatase  28.16 
 
 
470 aa  120  7.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0485487  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4136  alkaline phosphatase  32.86 
 
 
476 aa  120  9e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.11383 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0830  alkaline phosphatase  31.83 
 
 
454 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1376  alkaline phosphatase  29.45 
 
 
558 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0116315  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0097  putative alkaline phosphatase lipoprotein transmembrane  29.63 
 
 
483 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1206  alkaline phosphatase  30.38 
 
 
505 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.43523  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3809  alkaline phosphatase  30.05 
 
 
467 aa  117  5e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.227259  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1372  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.94 
 
 
252 aa  117  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0780489  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21410  alkaline phosphatase  29.38 
 
 
476 aa  117  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0022288  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3334  alkaline phosphatase  31.96 
 
 
464 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.460032  normal  0.338767 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>