271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3946 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3946  50S ribosomal protein L34  100 
 
 		 44 aa  86.3  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5639  50S ribosomal protein L34  79.55 
 
 		 44 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105533  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5341  50S ribosomal protein L34  79.55 
 
 		 44 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000589989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5185  50S ribosomal protein L34  79.55 
 
 		 44 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165607  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5598  50S ribosomal protein L34  79.55 
 
 		 44 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5738  50S ribosomal protein L34  79.55 
 
 		 44 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0731881  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4028  50S ribosomal protein L34  79.55 
 
 		 44 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.105181  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5320  50S ribosomal protein L34  79.55 
 
 		 44 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5281  50S ribosomal protein L34  79.55 
 
 		 44 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130444  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5675  50S ribosomal protein L34  79.55 
 
 		 44 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5615  50S ribosomal protein L34  79.55 
 
 		 44 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.106423  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1944  50S ribosomal protein L34  81.82 
 
 		 44 aa  68.2  0.00000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00370795  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2065  50S ribosomal protein L34  79.55 
 
 		 44 aa  67.4  0.00000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000217746  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0134  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 52 aa  64.3  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf883  ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 48 aa  63.9  0.0000000006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3434  50S ribosomal protein L34  75 
 
 		 44 aa  63.9  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002542  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0709  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 48 aa  63.2  0.000000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2924  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 53 aa  63.2  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000916972  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3562  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1055  ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 51 aa  62.4  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1864  50S ribosomal protein L34P  72.73 
 
 		 44 aa  62  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.670126  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2132  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 53 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000189497  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2033  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 51 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.778923  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2743  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 53 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3921  ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 55 aa  61.2  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250811  normal  0.369762 
 
 
-
 
NC_002950  PG0656  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 50 aa  61.2  0.000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.244963 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2038  ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  60.8  0.000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0096  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 52 aa  61.2  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605951 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28540  LSU ribosomal protein L34P  69.77 
 
 		 44 aa  61.2  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000649644  hitchhiker  0.00109369 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2524  ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 53 aa  60.8  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.480913  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0279  ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 52 aa  60.5  0.000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000148872  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl682.1  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  60.5  0.000000008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2338  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 53 aa  60.5  0.000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.13668 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2199  ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 44 aa  60.5  0.000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000155667  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2414  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  60.1  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000429596  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0870  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  59.7  0.00000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2793  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 45 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.202877  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0001  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 45 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000166725  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12828  hypothetical protein  70.45 
 
 		 52 aa  59.3  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.142353  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1568  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 47 aa  59.3  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0660974  normal  0.976418 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3898  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  59.3  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.035137  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1543  ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 52 aa  58.5  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.185024 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0132  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  58.2  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1898  ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 54 aa  58.5  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000611674  hitchhiker  3.5180100000000004e-26 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3852  ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 52 aa  58.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.699914 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6371  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0097  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0575  50S ribosomal protein L34P  68.18 
 
 		 44 aa  57.4  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4017  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  57.4  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00224916  normal  0.155192 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2138  ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  57.8  0.00000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0100  50S ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 53 aa  57.4  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0081  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  56.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27040  LSU ribosomal protein L34P  67.44 
 
 		 45 aa  56.2  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2564  50S ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 53 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4315  ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  56.6  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000480274  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0135a  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  56.2  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000390368  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2577  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  56.6  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4370  ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  56.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.09492  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52480  50S ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 44 aa  56.2  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4225  ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 45 aa  55.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0070  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1540  ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 44 aa  56.2  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000041199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002013  LSU ribosomal protein L34p  65.12 
 
 		 44 aa  55.8  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000014236  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1021  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  55.8  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.797032  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3614  50S ribosomal protein L34P  68.18 
 
 		 44 aa  55.5  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1059  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.202626  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2632  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.150747 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2512  50S ribosomal protein L34  66.67 
 
 		 45 aa  55.5  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000197783  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2603  ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 46 aa  56.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.15416  normal  0.859083 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2119  50S ribosomal protein L34  59.09 
 
 		 44 aa  55.8  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0082  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.376077 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0962  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  55.8  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2884  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 44 aa  55.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715219  normal  0.406653 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2353  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.15509 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3760  50S ribosomal protein L34P  69.05 
 
 		 44 aa  55.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0551  50S ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 44 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1923  ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 44 aa  55.5  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.360923  normal  0.510099 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3608  ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  55.8  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00438  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  55.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2310  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.093766 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2720  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.054761 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3034  ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  55.5  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.3489  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2147  50S ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 44 aa  55.1  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  2.00251e-17  unclonable  0.00000111229 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9056  ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 45 aa  55.1  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00101546  normal  0.317071 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4513  ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 45 aa  55.1  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334556 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4623  50S ribosomal protein L34P  61.36 
 
 		 44 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0521  ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 44 aa  55.1  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.907647  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0001  50S ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 44 aa  55.1  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000283755  hitchhiker  0.00000000552795 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38060  LSU ribosomal protein L34P  67.44 
 
 		 49 aa  55.1  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0002  50S ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 44 aa  55.1  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000727123  unclonable  0.0000468434 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2243  50S ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 44 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.914999  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0009  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 44 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002417 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1363  50S ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 44 aa  54.7  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1793  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  54.7  0.0000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000343039  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5137  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 44 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0357  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  54.7  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.145521  normal  0.0448083 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4618  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 46 aa  54.7  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0184645  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0002  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 44 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1046  ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 44 aa  54.7  0.0000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0456047  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3321  50S ribosomal protein L34P  65.12 
 
 		 44 aa  54.7  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>