More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3935 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3935  cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
284 aa  577  1e-164  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000549335  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  59 
 
 
258 aa  324  1e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  62.89 
 
 
255 aa  320  9.999999999999999e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2146  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  57.77 
 
 
254 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  60.16 
 
 
255 aa  317  2e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.96 
 
 
257 aa  316  3e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  57.54 
 
 
253 aa  312  3.9999999999999997e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  57.14 
 
 
253 aa  310  2e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23520  chromosome segregation ATPase  57.96 
 
 
249 aa  306  3e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.502901  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5631  sporulation initiation inhibitor protein Soj  57.2 
 
 
253 aa  305  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5333  sporulation initiation inhibitor protein Soj  57.2 
 
 
253 aa  305  4.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  57.2 
 
 
253 aa  305  4.0000000000000004e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5177  sporulation initiation inhibitor  57.2 
 
 
253 aa  305  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5667  sporulation initiation inhibitor protein Soj  57.2 
 
 
253 aa  305  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5730  sporulation initiation inhibitor protein Soj  57.2 
 
 
253 aa  305  4.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5590  sporulation initiation inhibitor protein Soj  57.2 
 
 
253 aa  305  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114742 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5607  sporulation initiation inhibitor protein Soj  57.2 
 
 
253 aa  305  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3321  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  56.4 
 
 
253 aa  305  4.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5328  sporulation initiation inhibitor protein Soj  57.2 
 
 
253 aa  305  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106044 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5273  cobyrinic acid ac-diamide synthase  57.2 
 
 
253 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2988  sporulation initiation inhibitor protein soj  58.98 
 
 
257 aa  304  9.000000000000001e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2666  sporulation initiation inhibitor protein soj  58.98 
 
 
257 aa  304  9.000000000000001e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4362  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  57.6 
 
 
253 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  56 
 
 
253 aa  303  3.0000000000000004e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.4 
 
 
253 aa  302  5.000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2568  sporulation initiation inhibitor protein  56.75 
 
 
260 aa  300  2e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0143069  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4954  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.76 
 
 
253 aa  297  1e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024691  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.98 
 
 
253 aa  291  6e-78  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4042  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.36 
 
 
257 aa  290  2e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3957  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.73 
 
 
257 aa  290  2e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000240615  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1363  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.44 
 
 
266 aa  288  7e-77  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2056  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.54 
 
 
265 aa  288  8e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2230  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.78 
 
 
254 aa  286  2e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3139  partition protein, Par-like  53.6 
 
 
254 aa  286  2e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2752  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  57.14 
 
 
262 aa  286  2e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2097  chromosome segregation ATPase  51.54 
 
 
265 aa  286  2e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2926  chromosome segregation ATPase  55.2 
 
 
253 aa  286  4e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1803  ParaA family ATPase  52.33 
 
 
265 aa  284  1.0000000000000001e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.833868  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2439  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.77 
 
 
265 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0928  chromosome segregation ATPase  51.38 
 
 
255 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1888  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.77 
 
 
265 aa  283  3.0000000000000004e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0322  ParaA family ATPase  50.77 
 
 
265 aa  282  4.0000000000000003e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0112363 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1156  ParA family chromosome partitioning ATPase  51.38 
 
 
256 aa  281  9e-75  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.523363  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2087  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.38 
 
 
265 aa  281  9e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0106  soj protein  52.76 
 
 
257 aa  280  2e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0206  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.78 
 
 
262 aa  280  2e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0134114  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  53.2 
 
 
256 aa  279  4e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3413  chromosome segregation ATPase  52.57 
 
 
257 aa  278  5e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4256  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.36 
 
 
257 aa  278  7e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000382453  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3928  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.79 
 
 
264 aa  277  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436902  normal  0.478463 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  49.8 
 
 
276 aa  277  2e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.17 
 
 
254 aa  276  2e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.2767899999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  52.59 
 
 
257 aa  276  3e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0452  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.96 
 
 
295 aa  276  4e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402264  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3469  chromosome segregation ATPase  49.41 
 
 
264 aa  275  5e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0583  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  53.12 
 
 
257 aa  275  5e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0607  ParA family ATPase  51.19 
 
 
251 aa  275  6e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3202  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50 
 
 
264 aa  275  7e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.61 
 
 
256 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0307  hypothetical protein  52.38 
 
 
262 aa  274  1.0000000000000001e-72  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.285877 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4254  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.4 
 
 
264 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.645482 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0006  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.38 
 
 
258 aa  274  1.0000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2590  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.23 
 
 
282 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.15195 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5026  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.58 
 
 
270 aa  273  3e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1631  cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.37 
 
 
263 aa  273  3e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.423414  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0861  cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.22 
 
 
262 aa  272  5.000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4495  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.78 
 
 
262 aa  271  6e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0475444  hitchhiker  0.00000632397 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4386  chromosome partitioning protein  49.6 
 
 
264 aa  272  6e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.4 
 
 
294 aa  271  7e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4809  cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.4 
 
 
257 aa  271  8.000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2560  chromosome segregation ATPase  50.8 
 
 
258 aa  271  9e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00888291  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5045  parA family protein  53.36 
 
 
268 aa  271  1e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.337287  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2806  chromosome segregation ATPase  50 
 
 
261 aa  269  2.9999999999999997e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0253232  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0241  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.2 
 
 
300 aa  269  2.9999999999999997e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.811562  normal  0.0256625 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4319  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.57 
 
 
262 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  hitchhiker  0.000000000127935 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4375  cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.57 
 
 
262 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000180218  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4907  cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.38 
 
 
263 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000134549  normal  0.16741 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4374  cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.57 
 
 
262 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0660919  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4516  cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.57 
 
 
262 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.518316  hitchhiker  0.00306238 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0134  chromosome segregation ATPase  50.2 
 
 
258 aa  269  4e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2867  chromosome segregation ATPase  50.6 
 
 
270 aa  268  5e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136674  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14150  chromosome segregation ATPase  50.8 
 
 
294 aa  269  5e-71  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2059  chromosome partitioning protein ParA  48.44 
 
 
265 aa  268  7e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1979  chromosome partitioning protein ParA  48.44 
 
 
265 aa  268  7e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4756  ParA family protein  52.33 
 
 
262 aa  267  1e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28490  chromosome segregation ATPase  51.2 
 
 
348 aa  268  1e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.150947  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_002950  PG0142  SpoOJ regulator protein  48.81 
 
 
258 aa  266  2e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  50.2 
 
 
253 aa  267  2e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1654  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50 
 
 
286 aa  267  2e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0980496  normal  0.386611 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3761  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.38 
 
 
261 aa  267  2e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.242844  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4054  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.78 
 
 
262 aa  267  2e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2961  chromosome segregation ATPase  48.84 
 
 
285 aa  266  2e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4139  chromosome segregation ATPase  53.17 
 
 
262 aa  266  2e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.422385  hitchhiker  0.000125967 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4249  cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.17 
 
 
262 aa  267  2e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.261107  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0013  chromosome partitioning protein ParA  51.97 
 
 
265 aa  267  2e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0075806  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3532  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.68 
 
 
267 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.440443  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1864  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.19 
 
 
286 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.238573  normal  0.0904624 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1585  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.19 
 
 
286 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0495676 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3934  chromosome segregation ATPase  53.17 
 
 
262 aa  266  4e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0378841  hitchhiker  0.00270556 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4026  chromosome segregation ATPase  53.17 
 
 
262 aa  266  4e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270121  normal  0.883102 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>