More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3919 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3919  thioredoxin  100 
 
 		 103 aa  213  5.9999999999999996e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.566246  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  57.43 
 
 		 115 aa  135  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  54 
 
 		 108 aa  130  7.999999999999999e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  55.34 
 
 		 105 aa  128  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  52.94 
 
 		 106 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  57.28 
 
 		 105 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0404  thioredoxin  53.61 
 
 		 109 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  54.64 
 
 		 107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0363  thioredoxin  53.54 
 
 		 109 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000145924  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2340  thioredoxin  56.52 
 
 		 108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0697906  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0404  thioredoxin  52.58 
 
 		 109 aa  124  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000190247  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  52.58 
 
 		 150 aa  124  5e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1476  thioredoxin  58.7 
 
 		 223 aa  124  6e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00459132  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  52.48 
 
 		 107 aa  124  6e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  53.61 
 
 		 107 aa  124  6e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  53.61 
 
 		 107 aa  124  6e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  54.55 
 
 		 109 aa  124  6e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  53.61 
 
 		 107 aa  124  6e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  52.48 
 
 		 107 aa  124  6e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  52.94 
 
 		 106 aa  124  6e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  55.67 
 
 		 108 aa  124  6e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0156  thioredoxin  52.53 
 
 		 108 aa  123  7e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1837  thioredoxin  54.08 
 
 		 110 aa  123  8.000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  53.77 
 
 		 107 aa  122  1e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  53.77 
 
 		 107 aa  122  1e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  51.49 
 
 		 148 aa  122  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0505  thioredoxin  50.51 
 
 		 109 aa  122  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000129794  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  53.92 
 
 		 107 aa  122  2e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1513  thioredoxin  54 
 
 		 109 aa  121  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429326  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  50 
 
 		 105 aa  121  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  50.5 
 
 		 107 aa  121  4e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  49.02 
 
 		 107 aa  121  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0127  thioredoxin  53.06 
 
 		 108 aa  121  4e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000655412  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  48.51 
 
 		 107 aa  121  4e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  49.5 
 
 		 108 aa  120  5e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3230  thioredoxin  48.48 
 
 		 109 aa  120  5e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000930614  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  51.02 
 
 		 109 aa  120  6e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  49.5 
 
 		 107 aa  120  7e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  50 
 
 		 107 aa  120  9e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  50 
 
 		 107 aa  120  9e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  50 
 
 		 107 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000534537  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  51.04 
 
 		 107 aa  119  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  49.49 
 
 		 108 aa  119  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  51 
 
 		 110 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  49.5 
 
 		 124 aa  119  9.999999999999999e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  50.52 
 
 		 123 aa  119  9.999999999999999e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0984  thioredoxin  51.02 
 
 		 110 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3281  thioredoxin  48 
 
 		 109 aa  118  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2698  thioredoxin  50.5 
 
 		 108 aa  118  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0171911  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0147  thioredoxin 1  51.49 
 
 		 108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000169587  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  51.04 
 
 		 107 aa  118  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002097  thioredoxin  51.49 
 
 		 108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00313258  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  51.96 
 
 		 107 aa  118  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  52.08 
 
 		 107 aa  118  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00337  thioredoxin  51.49 
 
 		 108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0475  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03659  thioredoxin  47.47 
 
 		 109 aa  118  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000771604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  47.47 
 
 		 109 aa  118  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  47.47 
 
 		 109 aa  118  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  49.5 
 
 		 107 aa  118  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03608  hypothetical protein  47.47 
 
 		 109 aa  118  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000236523  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  47.47 
 
 		 109 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  47.47 
 
 		 109 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  47.47 
 
 		 109 aa  118  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  47.47 
 
 		 109 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  47.47 
 
 		 109 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  47.47 
 
 		 109 aa  118  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  47.47 
 
 		 109 aa  118  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  47.47 
 
 		 109 aa  118  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  47.47 
 
 		 109 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  47.47 
 
 		 109 aa  118  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  50 
 
 		 109 aa  118  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3655  thioredoxin  52.04 
 
 		 108 aa  117  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000417679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  50.52 
 
 		 120 aa  117  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  50.52 
 
 		 108 aa  117  4.9999999999999996e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  53.92 
 
 		 110 aa  117  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  52.04 
 
 		 106 aa  117  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0398  thioredoxin  51.52 
 
 		 108 aa  117  6e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  51.04 
 
 		 108 aa  117  7e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5839  thioredoxin  56.25 
 
 		 109 aa  117  7e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  47.47 
 
 		 109 aa  117  7e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0360  thioredoxin  48 
 
 		 109 aa  116  7.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  50.51 
 
 		 106 aa  117  7.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1708  thioredoxin  52.17 
 
 		 110 aa  116  7.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00102285  normal  0.772138 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3952  thioredoxin  47.52 
 
 		 108 aa  116  9e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4070  thioredoxin  47.52 
 
 		 108 aa  116  9e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3877  thioredoxin  47.52 
 
 		 108 aa  116  9e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000866569 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3929  thioredoxin  47.52 
 
 		 108 aa  116  9e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  48.45 
 
 		 109 aa  116  9e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1206  thioredoxin  51.02 
 
 		 109 aa  116  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.232039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0301  thioredoxin  48.54 
 
 		 106 aa  116  9.999999999999999e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  47.92 
 
 		 107 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4222  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0161465  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0691  thioredoxin  50 
 
 		 105 aa  115  9.999999999999999e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  51.52 
 
 		 109 aa  116  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  53.26 
 
 		 108 aa  115  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  47.96 
 
 		 108 aa  116  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  51.02 
 
 		 106 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  47 
 
 		 107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3216  thioredoxin  46.53 
 
 		 108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.604019  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>