More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3901 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3901  1-phosphofructokinase  100 
 
 		 300 aa  608  1e-173  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000128039  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0551  1-phosphofructokinase  49.34 
 
 		 306 aa  263  2e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3564  1-phosphofructokinase  45.07 
 
 		 303 aa  261  1e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0892785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3727  1-phosphofructokinase  45.07 
 
 		 303 aa  261  1e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5453300000000002e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3847  1-phosphofructokinase  45.07 
 
 		 303 aa  261  1e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000858241  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3768  1-phosphofructokinase  45.72 
 
 		 303 aa  260  2e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3463  1-phosphofructokinase  44.74 
 
 		 303 aa  260  2e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00127204  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3745  1-phosphofructokinase  45.72 
 
 		 303 aa  259  3e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0550156  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3817  1-phosphofructokinase  45.07 
 
 		 303 aa  258  7e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00128432  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1485  1-phosphofructokinase  45.7 
 
 		 303 aa  257  1e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.211736  normal  0.0136163 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0565  1-phosphofructokinase  48.36 
 
 		 306 aa  258  1e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3477  1-phosphofructokinase  45.39 
 
 		 303 aa  257  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000168948  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3483  1-phosphofructokinase  44.41 
 
 		 303 aa  257  2e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2395  1-phosphofructokinase  44.67 
 
 		 303 aa  251  1e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378006  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1511  1-phosphofructokinase  43.92 
 
 		 303 aa  239  4e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000166616  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1727  tagatose-6-phosphate kinase  39.33 
 
 		 304 aa  235  5.0000000000000005e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.209721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1032  tagatose-6-phosphate kinase  40.27 
 
 		 305 aa  235  6e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.104168  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0445  fructose-1-phosphate kinase  40.13 
 
 		 303 aa  232  4.0000000000000004e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00359315  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13290  1-phosphofructokinase  39.68 
 
 		 318 aa  230  2e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2650  1-phosphofructokinase  43.64 
 
 		 303 aa  228  7e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0382  1-phosphofructokinase  40.74 
 
 		 302 aa  225  5.0000000000000005e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000931152  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1347  1-phosphofructokinase  40.74 
 
 		 303 aa  225  8e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.50692  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0739  1-phosphofructokinase  38.59 
 
 		 306 aa  220  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0723  1-phosphofructokinase  38.59 
 
 		 306 aa  220  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0358  1-phosphofructokinase  36.82 
 
 		 306 aa  218  7.999999999999999e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0599  1-phosphofructokinase  40.49 
 
 		 338 aa  214  1.9999999999999998e-54  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0298214  normal  0.491276 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3759  1-phosphofructokinase  40.94 
 
 		 304 aa  208  1e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0589  1-phosphofructokinase  39.18 
 
 		 305 aa  206  5e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1776  1-phosphofructokinase  38.57 
 
 		 308 aa  201  9.999999999999999e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0109  1-phosphofructokinase  39.2 
 
 		 302 aa  198  9e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0619  1-phosphofructokinase  37.7 
 
 		 313 aa  186  3e-46  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.502151  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0650  1-phosphofructokinase  35.22 
 
 		 307 aa  183  3e-45  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0435  1-phosphofructokinase  34.34 
 
 		 310 aa  176  3e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0175  1-phosphofructokinase  36.14 
 
 		 306 aa  175  9.999999999999999e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0147  1-phosphofructokinase  36.3 
 
 		 315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110184  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1268  1-phosphofructokinase  37.22 
 
 		 314 aa  163  3e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.955109  normal  0.500032 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0148  fructose-1-phosphate kinase-like protein  39.16 
 
 		 308 aa  162  5.0000000000000005e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000234171 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0576  1-phosphofructokinase  38.2 
 
 		 310 aa  159  7e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000336585  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1715  1-phosphofructokinase  32.87 
 
 		 324 aa  159  7e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0852  1-phosphofructokinase, putative  32.89 
 
 		 311 aa  158  9e-38  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.810869  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1965  1-phosphofructokinase  32.28 
 
 		 306 aa  157  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.261569  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl180  1-phosphofructokinase  36.03 
 
 		 311 aa  157  2e-37  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0641  1-phosphofructokinase  34.15 
 
 		 311 aa  155  9e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.021814  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3382  1-phosphofructokinase  33.67 
 
 		 308 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000263995  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1252  1-phosphofructokinase  35.31 
 
 		 312 aa  152  5.9999999999999996e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0794  1-phosphofructokinase  32.95 
 
 		 315 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0702264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1788  1-phosphofructokinase  32.41 
 
 		 311 aa  146  3e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.468548  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05959  1-phosphofructokinase  33.58 
 
 		 324 aa  147  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0686  1-phosphofructokinase  32.37 
 
 		 316 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020594  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0322  1-phosphofructokinase  31.12 
 
 		 305 aa  145  6e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000799963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5272  1-phosphofructokinase  32.85 
 
 		 325 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0817  1-phosphofructokinase  32.58 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2744  1-phosphofructokinase  33.45 
 
 		 318 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1157  1-phosphofructokinase  31.35 
 
 		 310 aa  144  3e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1128  carbohydrate kinase, PfkB family  30.69 
 
 		 310 aa  142  6e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1642  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  33.8 
 
 		 307 aa  142  7e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1735  1-phosphofructokinase  33.56 
 
 		 313 aa  142  7e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3109  1-phosphofructokinase  33.81 
 
 		 318 aa  142  7e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1907  tagatose-6-phosphate kinase  34.15 
 
 		 307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.961969  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1346  carbohydrate kinase  30.36 
 
 		 310 aa  140  3e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3552  1-phosphofructokinase  33.45 
 
 		 313 aa  140  3e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000223  1-phosphofructokinase  32.45 
 
 		 323 aa  140  3.9999999999999997e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2760  1-phosphofructokinase  35.09 
 
 		 302 aa  137  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2862  1-phosphofructokinase protein  32.03 
 
 		 316 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.558464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1351  ribokinase-like domain-containing protein  31.71 
 
 		 309 aa  137  2e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0828  1-phosphofructokinase  32.08 
 
 		 315 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.904747 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1807  carbohydrate kinase, PfkB family  31.13 
 
 		 319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.917848  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1482  1-phosphofructokinase  31.13 
 
 		 319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.132343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0650  1-phosphofructokinase  32.67 
 
 		 303 aa  136  5e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.934038  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0091  1-phosphofructokinase  34.58 
 
 		 325 aa  135  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.720236  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4399  1-phosphofructokinase  30.8 
 
 		 315 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1069  1-phosphofructokinase  29.45 
 
 		 311 aa  134  9.999999999999999e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2142  1-phosphofructokinase  35.55 
 
 		 313 aa  135  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.954856 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4713  1-phosphofructokinase  30.16 
 
 		 330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12200  1-phosphofructokinase  32.16 
 
 		 308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0794  PfkB  31.58 
 
 		 313 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0909395  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1834  ribokinase-like domain-containing protein  32.68 
 
 		 306 aa  133  5e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0138  1-phosphofructokinase  33.56 
 
 		 318 aa  133  5e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0450  1-phosphofructokinase  30.92 
 
 		 317 aa  132  6e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1956  tagatose-6-phosphate kinase  30.8 
 
 		 310 aa  132  6.999999999999999e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247641  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4226  1-phosphofructokinase  34.6 
 
 		 313 aa  132  7.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7074  ribokinase-like domain-containing protein  32.06 
 
 		 316 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0787  1-phosphofructokinase  32.96 
 
 		 306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1873  1-phosphofructokinase  30.9 
 
 		 320 aa  130  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00509321 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0866  1-phosphofructokinase  29.49 
 
 		 310 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00871601  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1060  1-phosphofructokinase  32.04 
 
 		 308 aa  130  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1103  1-phosphofructokinase  32.37 
 
 		 303 aa  130  3e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0012  1-phosphofructokinase  35.09 
 
 		 308 aa  129  4.0000000000000003e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00179205  unclonable  0.0000000067569 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2174  1-phosphofructokinase  33.33 
 
 		 326 aa  129  7.000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0415  6-phosphofructokinase  29.61 
 
 		 350 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0891  1-phosphofructokinase  31.92 
 
 		 314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.619432  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2328  1-phosphofructokinase  30.68 
 
 		 312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1188  1-phosphofructokinase  32.35 
 
 		 315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.95293  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2465  1-phosphofructokinase  31.06 
 
 		 312 aa  127  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000474355  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0188  1-phosphofructokinase  33.71 
 
 		 317 aa  127  3e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28610  1-phosphofructokinase  33.45 
 
 		 333 aa  127  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0750785  normal  0.0817952 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4850  ribokinase-like domain-containing protein  32.44 
 
 		 336 aa  127  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2555  1-phosphofructokinase  31.44 
 
 		 312 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0672567  hitchhiker  0.000484792 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2444  1-phosphofructokinase  31.44 
 
 		 312 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00105747  normal  0.37193 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2397  1-phosphofructokinase  31.44 
 
 		 312 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.296088  hitchhiker  0.000165824 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>