More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3886 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3886  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 580 aa  1196    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000303887  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1227  histidine kinase  40.92 
 
 		 488 aa  228  2e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2008  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 		 585 aa  216  9e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0495  histidine kinase internal region  38.31 
 
 		 604 aa  216  9.999999999999999e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2122  histidine kinase internal region  41.67 
 
 		 516 aa  207  4e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190674  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2252  histidine kinase internal region  36.68 
 
 		 569 aa  195  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0994  putative sensor with HAMP domain  34.29 
 
 		 603 aa  193  6e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19850  histidine kinase internal region  37.01 
 
 		 595 aa  183  7e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0554  sensor histidine kinase  33.74 
 
 		 583 aa  182  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0398  histidine kinase internal region  35.78 
 
 		 567 aa  181  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1137  putative sensor with HAMP domain  36.57 
 
 		 597 aa  182  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0538  sensor histidine kinase  33.44 
 
 		 583 aa  181  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4590  putative sensor with HAMP domain  35.81 
 
 		 577 aa  178  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0199  putative sensor with HAMP domain  36.2 
 
 		 589 aa  177  5e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0945  histidine kinase  35.29 
 
 		 600 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2056  putative sensor with HAMP domain  34.06 
 
 		 587 aa  172  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0578  histidine kinase internal region  34.6 
 
 		 604 aa  169  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2114  putative sensor with HAMP domain  31.64 
 
 		 627 aa  169  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.28006  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0599  putative sensor with HAMP domain  31.49 
 
 		 623 aa  168  2.9999999999999998e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.396658  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1983  putative sensor with HAMP domain  32.84 
 
 		 597 aa  166  6.9999999999999995e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.24245  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2345  sensor histidine kinase  30.58 
 
 		 578 aa  165  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0123193  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2551  signal transduction histidine kinase, LytS  29.75 
 
 		 600 aa  164  6e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2057  sensor histidine kinase  30.58 
 
 		 578 aa  162  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3406  histidine kinase internal region  32.92 
 
 		 603 aa  160  7e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.264135  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3248  putative sensor with HAMP domain  31.21 
 
 		 600 aa  158  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2719  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 		 576 aa  156  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0526  histidine kinase internal region  33.46 
 
 		 594 aa  154  5e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000253378  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  39.45 
 
 		 578 aa  154  5.9999999999999996e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014237  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3281  signal transduction histidine kinase, LytS  32.41 
 
 		 335 aa  150  7e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1762  signal transduction histidine kinase, LytS  37.26 
 
 		 465 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.513767  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1959  histidine kinase  36.1 
 
 		 414 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3033  histidine kinase internal region  25.06 
 
 		 633 aa  147  6e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0284117  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3306  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 483 aa  145  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0772  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.63 
 
 		 640 aa  145  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000785951  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0852  putative sensor with HAMP domain  34.06 
 
 		 610 aa  143  7e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1112  sensor histidine kinase  25.74 
 
 		 574 aa  143  9e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0193784  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2453  histidine kinase  30.67 
 
 		 612 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000429093  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3857  signal transduction histidine kinase, LytS  30.28 
 
 		 581 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000136608  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2698  histidine kinase internal region  35.61 
 
 		 576 aa  141  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0148  putative sensor with HAMP domain  28.11 
 
 		 594 aa  141  3.9999999999999997e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2114  histidine kinase  34.22 
 
 		 607 aa  137  4e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.156393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0223  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 		 502 aa  137  7.000000000000001e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0292  signal transduction histidine kinase, LytS  34.55 
 
 		 506 aa  136  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1339  signal transduction histidine kinase, LytS  34.98 
 
 		 426 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0617  signal transduction histidine kinase, LytS  26.52 
 
 		 601 aa  134  3e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000118268  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3212  histidine kinase internal region  30.03 
 
 		 596 aa  134  5e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1585  signal transduction histidine kinase, LytS  35.17 
 
 		 574 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2140  histidine kinase internal region  32.67 
 
 		 564 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2134  signal transduction histidine kinase LytS  35.47 
 
 		 394 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1646  putative sensor with HAMP domain  28.11 
 
 		 617 aa  130  7.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.177984  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0863  histidine kinase internal region  28.35 
 
 		 599 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0103  signal transduction histidine kinase, LytS  30.52 
 
 		 495 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3774  signal transduction histidine kinase, LytS  34.47 
 
 		 446 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.469079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3263  histidine kinase internal region  31.6 
 
 		 397 aa  126  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3543  signal transduction histidine kinase, LytS  33.18 
 
 		 403 aa  125  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00838652  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1250  signal transduction histidine kinase, LytS  30.11 
 
 		 574 aa  125  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.888178  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2372  histidine kinase internal region  27.89 
 
 		 595 aa  124  4e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1582  signal transduction histidine kinase, LytS  25.89 
 
 		 498 aa  124  4e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0045193  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0160  ATP-binding region, ATPase-like  33.5 
 
 		 567 aa  124  6e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2355  signal transduction histidine kinase, LytS  32.11 
 
 		 580 aa  124  6e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.461368  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0069  signal transduction histidine kinase, LytS  37.07 
 
 		 400 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0746502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0468  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 450 aa  122  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1965  histidine kinase internal region  30.96 
 
 		 576 aa  122  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1171  sensor histidine kinase  34.5 
 
 		 410 aa  121  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.400646  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2761  signal transduction histidine kinase, LytS  33.17 
 
 		 394 aa  121  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2792  signal transduction histidine kinase, LytS  31.75 
 
 		 564 aa  121  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000275265  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1721  histidine kinase internal region  30.37 
 
 		 573 aa  121  3.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0059  signal transduction histidine kinase, LytS  33.19 
 
 		 557 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.996795  hitchhiker  0.000632462 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5281  signal transduction histidine kinase, LytS  31.34 
 
 		 391 aa  120  7.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.119621  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0058  signal transduction histidine kinase, LytS  33.19 
 
 		 557 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3173  signal transduction histidine kinase, LytS  33.65 
 
 		 411 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0466454  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0899  signal transduction histidine kinase, LytS  34.6 
 
 		 572 aa  119  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144133  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  33.19 
 
 		 557 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4300  signal transduction histidine kinase, LytS  33.19 
 
 		 557 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0131803  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6326  signal transduction histidine kinase, LytS  33.17 
 
 		 398 aa  119  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.521722 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0056  signal transduction histidine kinase, LytS  34.34 
 
 		 557 aa  118  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0698199  decreased coverage  0.000000126428 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  34.34 
 
 		 557 aa  118  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0736236  hitchhiker  0.000664675 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1002  sensor histidine kinase  34.78 
 
 		 410 aa  118  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3404  signal transduction histidine kinase, LytS  33.66 
 
 		 563 aa  117  6e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.823402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4117  sensor histidine kinase  33.5 
 
 		 565 aa  117  7.999999999999999e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.645201 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00850  putative regulator of cell autolysis  30.04 
 
 		 428 aa  115  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.432322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0494  signal transduction histidine kinase, LytS  32.76 
 
 		 645 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000248497  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2398  signal transduction histidine kinase, LytS  30.13 
 
 		 568 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2857  ATP-binding region, ATPase-like  30.94 
 
 		 363 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2444  signal transduction histidine kinase, LytS  34.9 
 
 		 566 aa  114  5e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.221441  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0146  signal transduction histidine kinase, LytS  33 
 
 		 565 aa  114  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.889074  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1329  signal transduction histidine kinase LytS  32.56 
 
 		 432 aa  114  7.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.268235  normal  0.0194209 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2171  ATP-binding region, ATPase-like  31.6 
 
 		 455 aa  113  8.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346246  normal  0.0306612 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3292  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 		 388 aa  113  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1393  histidine kinase internal region  29.34 
 
 		 586 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000217072  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4007  sensor histidine kinase  32.51 
 
 		 565 aa  113  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4128  signal transduction histidine kinase, LytS  32.49 
 
 		 338 aa  113  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2405  sensor histidine kinase  27.57 
 
 		 512 aa  112  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3593  signal transduction histidine kinase, LytS  32.11 
 
 		 491 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0532594 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1394  signal transduction histidine kinase, LytS  30.5 
 
 		 393 aa  112  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000264266 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1376  signal transduction histidine kinase, LytS  30 
 
 		 405 aa  112  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0411  signal transduction histidine kinase, LytS  34.16 
 
 		 1018 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000411039  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4493  histidine kinase internal region  28.41 
 
 		 408 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555212  normal  0.320157 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1277  signal transduction histidine kinase, LytS  33.78 
 
 		 565 aa  111  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2670  sensor histidine kinase  33.78 
 
 		 559 aa  111  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>