75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3864 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3864  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1188  hypothetical protein  37.89 
 
 		 260 aa  186  4e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09031  membrane protein, multidrug efflux associated  27.38 
 
 		 262 aa  95.9  5e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000238459 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0236  membrane protein, multidrug efflux associated  27.38 
 
 		 262 aa  95.9  5e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0945293  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0428  protein of unknown function DUF990  28.88 
 
 		 262 aa  92.4  7e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.502451  n/a   
 
 
-
 
NC_013516  Smon_1505  protein of unknown function DUF990  26.62 
 
 		 262 aa  89.7  5e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  hitchhiker  0.00000124255  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3771  protein of unknown function DUF990  27.92 
 
 		 260 aa  89  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.616684 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0429  protein of unknown function DUF990  28.95 
 
 		 262 aa  88.6  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0436  hypothetical protein  26.24 
 
 		 262 aa  87.8  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0803  hypothetical protein  31.4 
 
 		 260 aa  88.2  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.386631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0170  hypothetical protein  27.78 
 
 		 263 aa  88.2  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0173  hypothetical protein  27.34 
 
 		 263 aa  86.7  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.109206  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0400  hypothetical protein  28.51 
 
 		 262 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1964  protein of unknown function DUF990  26.34 
 
 		 262 aa  82  0.000000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000269589  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0060  protein of unknown function DUF990  26.69 
 
 		 262 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0058  protein of unknown function DUF990  26.69 
 
 		 262 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0285838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2209  membrane protein, multidrug efflux associated  26.2 
 
 		 262 aa  79.3  0.00000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2321  protein of unknown function DUF990  27.86 
 
 		 262 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2653  hypothetical protein  28.03 
 
 		 257 aa  77  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1498  hypothetical protein  26.72 
 
 		 260 aa  76.3  0.0000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0636384  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1946  hypothetical protein  26.99 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1443  protein of unknown function DUF990  24.12 
 
 		 261 aa  75.5  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3778  hypothetical protein  24.52 
 
 		 258 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000127963  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0456  hypothetical protein  24.44 
 
 		 261 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0488  protein of unknown function DUF990  23.97 
 
 		 261 aa  72.8  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29101  membrane protein, multidrug efflux associated  24.23 
 
 		 262 aa  72.8  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0538  protein of unknown function DUF990  23.42 
 
 		 265 aa  72.4  0.000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0552  hypothetical protein  23.42 
 
 		 265 aa  72.4  0.000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.268475 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0983  membrane protein, multidrug efflux associated  22.37 
 
 		 264 aa  71.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.594121  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4171  hypothetical protein  25.66 
 
 		 262 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.068951 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0539  putative ABC transporter, permease protein  23.51 
 
 		 261 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0859  hypothetical protein  26.5 
 
 		 260 aa  70.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.487071  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0886  hypothetical protein  25.59 
 
 		 259 aa  70.9  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0866325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10541  membrane protein, multidrug efflux associated  21.27 
 
 		 264 aa  70.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.826681  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0445  ABC transporter permease  25.28 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0658  protein of unknown function DUF990  27.03 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000260667 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0441  ABC transporter permease  25.28 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6486  protein of unknown function DUF990  24.53 
 
 		 265 aa  69.7  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117974  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0534  ABC transporter permease  24.62 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.184437  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0502  ABC transporter permease  24.62 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0517  putative ABC transporter, permease protein  24.62 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000033063 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0450  hypothetical protein  23.86 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4787  putative ABC transporter, permease protein  23.57 
 
 		 261 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.14133  hitchhiker  0.000205366 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0661  hypothetical protein  24.24 
 
 		 261 aa  68.2  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.788347  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10531  membrane protein, multidrug efflux associated  20.15 
 
 		 277 aa  68.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1285  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  25.4 
 
 		 263 aa  67.4  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2555  membrane protein, multidrug efflux associated  26.75 
 
 		 262 aa  67.8  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0524  hypothetical protein  26.52 
 
 		 267 aa  67  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0980  hypothetical protein  24.64 
 
 		 270 aa  67  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0589  ABC transporter, permease protein, putative  24.24 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0590  putative ABC transporter, permease protein  24.24 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.70299  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4243  protein of unknown function DUF990  26.74 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000148209  hitchhiker  0.000000472555 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10541  membrane protein, multidrug efflux associated  20.22 
 
 		 264 aa  65.1  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1360  protein of unknown function DUF990  20.91 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3098  protein of unknown function DUF990  23.75 
 
 		 262 aa  63.9  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.817104  normal  0.988604 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2675  hypothetical protein  27.31 
 
 		 249 aa  62  0.000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.187559  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2816  protein of unknown function DUF990  27.32 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0376428 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0442  protein of unknown function DUF990  23.68 
 
 		 258 aa  60.5  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0572285 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2348  protein of unknown function DUF990  25.28 
 
 		 270 aa  58.5  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.671406  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1921  hypothetical protein  19.77 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0485  hypothetical protein  23.96 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0184092  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2521  protein of unknown function DUF990  22.51 
 
 		 267 aa  52.8  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.808685  normal  0.519052 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2071  hypothetical protein  25.54 
 
 		 267 aa  51.6  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.151381  normal  0.644656 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4780  protein of unknown function DUF990  22.51 
 
 		 278 aa  51.6  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.723474 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1830  hypothetical protein  23.26 
 
 		 265 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2222  protein of unknown function DUF990  30.69 
 
 		 267 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3537  hypothetical protein  23.05 
 
 		 262 aa  47.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0865051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1130  hypothetical protein  21.09 
 
 		 264 aa  45.4  0.0009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00941975  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1067  hypothetical protein  25 
 
 		 267 aa  45.4  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0545  protein of unknown function DUF990  20.97 
 
 		 265 aa  45.4  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.931228  normal  0.935473 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3393  conserved membrane protein, putative multidrug efflux associated  21.88 
 
 		 261 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.120768  hitchhiker  0.0000000768591 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2550  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like  29.29 
 
 		 165 aa  43.9  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.256481  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2520  protein of unknown function DUF990  22.22 
 
 		 279 aa  43.9  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3437  hypothetical protein  22.56 
 
 		 262 aa  43.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.434658  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3918  protein of unknown function DUF990  25.09 
 
 		 281 aa  43.1  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.373392  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>