More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3855 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3855  phosphomannomutase  100 
 
 
474 aa  979    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03432  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  55.11 
 
 
470 aa  541  9.999999999999999e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002577  GlcNAc phosphomutase  54.26 
 
 
470 aa  533  1e-150  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0140  putative phosphoglucomutase/phosphomannomutase  54.68 
 
 
470 aa  528  1e-148  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2585  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  54.26 
 
 
470 aa  525  1e-148  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28260  phosphomannomutase  51.91 
 
 
473 aa  518  1e-146  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1054  Glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase., Phosphoglucomutase  41.06 
 
 
733 aa  370  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.691488  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3100  phosphoglucomutase  39.12 
 
 
486 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2089  phosphomannomutase  37.97 
 
 
467 aa  335  7e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.631588  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1967  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  37.47 
 
 
466 aa  330  3e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4110  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  38.17 
 
 
470 aa  330  3e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00036282 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1132  Phosphoglucomutase  37.53 
 
 
470 aa  320  5e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.301327  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0221  phosphoglucomutase  37.5 
 
 
471 aa  317  3e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1311  phosphomannomutase ManB  35.82 
 
 
473 aa  312  5.999999999999999e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.81653e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2017  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  35.74 
 
 
472 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000060131  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3319  Phosphoglucomutase  37.03 
 
 
468 aa  303  6.000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2649  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  35.18 
 
 
474 aa  301  1e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000128846 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1567  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  36.38 
 
 
474 aa  301  1e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000749576  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3418  phosphoglucomutase  34.25 
 
 
478 aa  301  1e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0135  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  34.61 
 
 
469 aa  298  1e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000226581  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2013  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  36.78 
 
 
472 aa  297  3e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0108375  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1605  Phosphoglucomutase  37.04 
 
 
472 aa  296  5e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000165819  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2040  Phosphomannomutase  34.33 
 
 
467 aa  295  9e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0022355  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1737  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  36.09 
 
 
475 aa  294  2e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.148942  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1831  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  35.73 
 
 
472 aa  293  5e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000124706  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1751  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  36.2 
 
 
467 aa  291  2e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4381  phosphoglucomutase  36.36 
 
 
469 aa  291  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000631194  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1767  phosphoglucosamine mutase  35.97 
 
 
475 aa  291  2e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3321  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  33.97 
 
 
469 aa  289  8e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0510  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  34.48 
 
 
475 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0372  Phosphoglucosamine mutase  34.59 
 
 
474 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0990  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  34.86 
 
 
472 aa  278  2e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000661724  normal  0.0347081 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3964  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  36.14 
 
 
469 aa  277  3e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000701668  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4823  phosphoglucomutase  34.2 
 
 
471 aa  276  7e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2567  phosphoglucosamine mutase  33.19 
 
 
488 aa  275  1.0000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.6066  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4050  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  35.03 
 
 
469 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0794  Phosphomannomutase  33.99 
 
 
474 aa  262  1e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1752  Phosphoglucomutase  33.98 
 
 
463 aa  260  4e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0991  Phosphomannomutase  33.77 
 
 
458 aa  254  2.0000000000000002e-66  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.160254  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0474  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  32.03 
 
 
460 aa  248  1e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0411  Phosphomannomutase  31.61 
 
 
460 aa  248  1e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.606567 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0077  Phosphomannomutase  32.75 
 
 
460 aa  245  9.999999999999999e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.133339  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1740  phosphoglucomutase  33.62 
 
 
460 aa  245  9.999999999999999e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0251978 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0486  phosphomannomutase  34.43 
 
 
414 aa  239  8e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.504312  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0341  Phosphoglucomutase  32.47 
 
 
460 aa  239  1e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03111  phosphotransferase superclass  32.98 
 
 
486 aa  239  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.309336  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1486  Phosphoglucomutase  31.68 
 
 
457 aa  237  3e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000122855  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0352  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  32.08 
 
 
475 aa  235  1.0000000000000001e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.345655 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_451  phosphomannomutase  34.44 
 
 
409 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0496363  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0442  Phosphoglucomutase  32.03 
 
 
460 aa  233  8.000000000000001e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03581  phosphotransferase superclass  32.33 
 
 
486 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.37944  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1140  Phosphomannomutase  31.09 
 
 
482 aa  230  4e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.188407  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1796  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  29.53 
 
 
480 aa  229  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.238511  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1768  Phosphomannomutase  29.53 
 
 
480 aa  229  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2223  Phosphoglucomutase  30.82 
 
 
490 aa  227  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0282699 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0369  phosphomannomutase  30.83 
 
 
501 aa  228  3e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.391348  hitchhiker  0.00000119855 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1936  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  31.41 
 
 
463 aa  225  2e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2655  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  31.57 
 
 
484 aa  224  2e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0410  phosphomannomutase  31.82 
 
 
460 aa  224  3e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.158132  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1644  phosphomannomutase  31.69 
 
 
486 aa  223  4.9999999999999996e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0280  phosphomannomutase  30.95 
 
 
484 aa  223  4.9999999999999996e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0138376  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0447  Phosphoglucomutase  32.38 
 
 
460 aa  223  6e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000142951  normal  0.775368 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0970  phosphoglucomutase  28.42 
 
 
479 aa  221  1.9999999999999999e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0168511  normal  0.552873 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1268  phosphoglucomutase  30.29 
 
 
484 aa  220  3.9999999999999997e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.43258  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0571  phosphoglucosamine mutase  30.32 
 
 
472 aa  219  6e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.217924 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03011  phosphotransferase superclass  30.52 
 
 
484 aa  219  6e-56  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0959823  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3749  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  30.34 
 
 
464 aa  219  1e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03021  phosphotransferase superclass  30.52 
 
 
484 aa  218  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3078  Phosphoglucosamine mutase  32.01 
 
 
470 aa  213  4.9999999999999996e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0114  phosphomannomutase  30.79 
 
 
467 aa  212  1e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.154128  hitchhiker  0.0000359682 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0228  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  29.38 
 
 
487 aa  208  1e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0257  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  28.33 
 
 
487 aa  207  4e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2367  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  29.38 
 
 
478 aa  206  7e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000518249  normal  0.780869 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4933  Phosphoglucomutase  29.19 
 
 
477 aa  204  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0612098 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1899  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  32.99 
 
 
473 aa  201  3e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00145231 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0038  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  27.78 
 
 
480 aa  201  3e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03051  phosphotransferase superclass  30.97 
 
 
485 aa  200  5e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1955  Phosphoglucosamine mutase  29.66 
 
 
503 aa  198  2.0000000000000003e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.404155  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1893  phosphoglucomutase  28.23 
 
 
465 aa  196  7e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.576391  normal  0.489627 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0721  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  32.26 
 
 
452 aa  196  8.000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0831033  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24991  phosphotransferase superclass  29.83 
 
 
487 aa  195  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3839  Phosphoglucosamine mutase  30.28 
 
 
468 aa  192  9e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2225  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  30.6 
 
 
458 aa  186  7e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.161781  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1292  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  25.87 
 
 
471 aa  184  3e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1269  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  29.64 
 
 
518 aa  179  8e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000278301  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1538  Phosphoglucosamine mutase  30.21 
 
 
450 aa  176  9.999999999999999e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0505376  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2115  phosphoglucosamine mutase  28.76 
 
 
448 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0496  Phosphoglucosamine mutase  29.36 
 
 
480 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0852  Phosphoglucosamine mutase  27.27 
 
 
454 aa  164  3e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.198816  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0224  phosphoglucosamine mutase  27.7 
 
 
449 aa  161  2e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1857  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  30.1 
 
 
559 aa  161  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.938246  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2908  phosphoglucomutase  28.34 
 
 
548 aa  160  4e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.161814 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0879  phosphoglucomutase  28.6 
 
 
550 aa  158  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0178981  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2670  phosphoglucomutase  27.1 
 
 
548 aa  157  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.860236  normal  0.232567 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6650  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate- specific  26.82 
 
 
545 aa  157  4e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0760474 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0902  phosphoglucomutase  28.51 
 
 
547 aa  156  8e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2668  Phosphoglucosamine mutase  26.47 
 
 
478 aa  154  2e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000530484  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1145  phosphoglucomutase  27.52 
 
 
559 aa  155  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.328189  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1417  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  28.88 
 
 
576 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1409  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate- specific  29.01 
 
 
548 aa  154  4e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.517286  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>