85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3854 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_03431  hypothetical protein  59.08 
 
 		 802 aa  1010    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1053  glycosyltransferase 36  51.71 
 
 		 829 aa  903    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.753195  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002578  chitobiose phosphorylase  59.2 
 
 		 802 aa  1015    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0141  cellulose degradation product phosphorylase  59.03 
 
 		 801 aa  1018    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2584  chitobiose phosphorylase (glycosyl transferase)  59.58 
 
 		 762 aa  965    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3854  glycosyltransferase 36  100 
 
 		 797 aa  1676    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0459  glycosyltransferase 36  42.82 
 
 		 790 aa  688    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1439  glycosyltransferase 36  37.53 
 
 		 784 aa  561  1e-158  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2310  glycosyltransferase 36  38.34 
 
 		 794 aa  557  1e-157  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.587423  normal  0.417099 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2312  glycosyltransferase 36  38.13 
 
 		 797 aa  548  1e-154  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26995 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1744  glycosyltransferase 36  36.82 
 
 		 823 aa  544  1e-153  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0737514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1364  glycosyltransferase 36  36.72 
 
 		 785 aa  539  9.999999999999999e-153  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2354  glycosyltransferase 36  36.77 
 
 		 796 aa  537  1e-151  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1929  glycosyltransferase 36  36 
 
 		 797 aa  521  1e-146  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19760  glycosyltransferase 36  36.96 
 
 		 784 aa  521  1e-146  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0648  glycosyl transferase 36  36.11 
 
 		 809 aa  519  1e-146  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000072507  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3412  glycosyltransferase 36  34.57 
 
 		 824 aa  508  9.999999999999999e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0460  glycosyltransferase 36  34.09 
 
 		 811 aa  498  1e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0968  glycosyltransferase 36  33.81 
 
 		 813 aa  495  9.999999999999999e-139  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.547767  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0951  glycosyltransferase 36  33.81 
 
 		 813 aa  495  9.999999999999999e-139  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0220582  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3274  glycosyltransferase 36  34.56 
 
 		 822 aa  492  1e-137  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19750  glycosyltransferase 36  32.58 
 
 		 819 aa  486  1e-136  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0275  cellobiose phosphorylase  32.66 
 
 		 811 aa  486  1e-136  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1363  glycosyltransferase 36  33.89 
 
 		 815 aa  489  1e-136  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1318  cellobiose phosphorylase  33.21 
 
 		 811 aa  472  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0462617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0649  glycosyl transferase 36  32.78 
 
 		 811 aa  466  9.999999999999999e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0225062  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1745  glycosyltransferase 36  31.86 
 
 		 815 aa  462  1e-129  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.414629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0430  glycosyltransferase 36  31.74 
 
 		 831 aa  449  1.0000000000000001e-124  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.948087  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0148  glycosyltransferase 36  31.13 
 
 		 822 aa  435  1e-120  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0233043 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2109  glycosyltransferase 36  31.63 
 
 		 811 aa  434  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2616  glycosyltransferase 36  29.43 
 
 		 827 aa  384  1e-105  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.294292  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0953  glycosyltransferase 36  28.41 
 
 		 786 aa  381  1e-104  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.862285  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0091  glycosyltransferase 36  31.06 
 
 		 849 aa  379  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00140222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1221  glycosyltransferase 36  27.65 
 
 		 2922 aa  316  9.999999999999999e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0980  putative carbohydrate binding  27.02 
 
 		 2887 aa  312  1e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2993  glycosyltransferase 36  25.6 
 
 		 1303 aa  294  4e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1675  glycosyltransferase 36  25.88 
 
 		 2786 aa  284  4.0000000000000003e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4026  glycosyltransferase 36  25.78 
 
 		 2748 aa  283  1e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.301518 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2577  putative carbohydrate binding  26.51 
 
 		 2823 aa  276  1.0000000000000001e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1517  putative cyclic beta 1-2 glucan synthetase  26 
 
 		 2901 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302513  normal  0.43916 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2133  glycosyltransferase 36  26.84 
 
 		 2881 aa  270  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.150749 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3888  glycosyltransferase 36  25.92 
 
 		 2875 aa  268  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0623  glycosyltransferase 36  25.72 
 
 		 2929 aa  267  5.999999999999999e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1304  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  25.06 
 
 		 2859 aa  267  5.999999999999999e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3296  glycosyltransferase 36  26.23 
 
 		 2747 aa  266  8.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4340  glycosyltransferase 36  24.73 
 
 		 3021 aa  265  2e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5592  glycosyltransferase 36  26.16 
 
 		 2831 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0124  glycosyltransferase 36  25.51 
 
 		 2888 aa  263  8e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2531  glycosyltransferase 36  25.89 
 
 		 2845 aa  263  8.999999999999999e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3285  glycosyltransferase 36  25.78 
 
 		 2880 aa  262  1e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2737  glycosyltransferase 36  25.57 
 
 		 2864 aa  262  2e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5267  glycosyltransferase 36  26.37 
 
 		 2868 aa  262  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4245  glycosyltransferase 36  25.93 
 
 		 2860 aa  261  3e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2046  putative carbohydrate binding:glycosyltransferase 36:glycosyltransferase 36 associated  26.14 
 
 		 2932 aa  261  5.0000000000000005e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0111  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  24.62 
 
 		 2732 aa  258  3e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.888748  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0108  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  24.62 
 
 		 2864 aa  257  6e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.602283  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3184  glycosyltransferase 36  26.48 
 
 		 2748 aa  255  3e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1711  glycosyltransferase 36  26.17 
 
 		 2874 aa  255  3e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1346  putative cyclic beta 1-2 glucan synthetase  25.76 
 
 		 2868 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3379  putative carbohydrate binding  26.46 
 
 		 2758 aa  254  5.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1870  glycosyltransferase 36  25.57 
 
 		 2864 aa  252  2e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3489  hypothetical protein  25.79 
 
 		 2761 aa  248  4e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1183  glycosyltransferase 36  25.38 
 
 		 2905 aa  247  6e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3139  glycosyltransferase 36  25.8 
 
 		 2842 aa  245  1.9999999999999999e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2188  glycosyltransferase 36  25.27 
 
 		 2916 aa  245  1.9999999999999999e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3613  glycosyltransferase  24.94 
 
 		 2769 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0791  putative carbohydrate binding  24.67 
 
 		 2716 aa  238  3e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4173  glycosyltransferase 36  25 
 
 		 2839 aa  234  7.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3845  glycosyltransferase 36  24.68 
 
 		 2839 aa  232  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0906  NdvB protein  23.87 
 
 		 788 aa  228  4e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000016442 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4370  beta (1-->2) glucan biosynthesis protein  24.47 
 
 		 2833 aa  225  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02749  NdvB protein  23.84 
 
 		 801 aa  224  6e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3155  glycosyltransferase 36  23.96 
 
 		 2870 aa  223  9e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3696  cyclic beta 1-2 glucan synthetase domain-containing protein  26.05 
 
 		 802 aa  223  9.999999999999999e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1306  cyclic beta 1-2 glucan synthase  24.2 
 
 		 2884 aa  220  7.999999999999999e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3648  glycosyltransferase 36 associated  25.85 
 
 		 624 aa  219  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3667  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  24.07 
 
 		 2793 aa  218  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3093  glycosyltransferase 36  23.22 
 
 		 2731 aa  187  8e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5841  putative carbohydrate binding  23.11 
 
 		 2730 aa  186  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4755  putative carbohydrate binding  25.66 
 
 		 2779 aa  183  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2989  glycosyltransferase 36  23.33 
 
 		 984 aa  102  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.684465  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3706  glycosyltransferase 36  30.06 
 
 		 2453 aa  81.3  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0857  cellobiose phosphorylase-like protein  20.9 
 
 		 900 aa  52.8  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04170  Cellobiose phosphorylase  19.84 
 
 		 904 aa  52.4  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2456  hypothetical protein  22.53 
 
 		 1076 aa  48.1  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>