More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3815 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3815  ferric uptake regulator family protein  100 
 
 		 132 aa  277  4e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000025471  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0135  ferric uptake regulator, Fur family  41.41 
 
 		 139 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000000297915  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08960  ferric uptake regulator, Fur family  40.94 
 
 		 134 aa  115  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0101  ferric uptake regulator, Fur family  39.69 
 
 		 139 aa  114  3e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.133113  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0754  ferric uptake regulator family protein  39.84 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.354602  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0543  ferric uptake regulator, Fur family  38.89 
 
 		 139 aa  110  9e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.70942 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1354  ferric uptake regulator, Fur family  42.74 
 
 		 133 aa  109  1.0000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000236384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4078  ferric uptake regulator, Fur family  40.94 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000739269  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0822  ferric uptake regulator family protein  40.16 
 
 		 126 aa  107  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000300093  normal  0.0104511 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0153  ferric uptake regulator, Fur family  39.37 
 
 		 139 aa  106  9.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000104646  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0498  ferric uptake regulator, Fur family  38.71 
 
 		 150 aa  103  8e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2005  ferric uptake regulator, Fur family  36.8 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0149  ferric uptake regulator, Fur family  37.8 
 
 		 139 aa  101  4e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000946287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3674  ferric uptake regulator family protein  41.22 
 
 		 129 aa  100  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 142 aa  99.4  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0141  ferric uptake regulator, Fur family  39.84 
 
 		 133 aa  99.8  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.896296  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0593  transcriptional regulator, Fur family  37.7 
 
 		 142 aa  99  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000040057  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0505  FUR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 144 aa  98.6  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0448  ferric uptake regulator  37.7 
 
 		 144 aa  98.6  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0444  ferric uptake regulator  37.7 
 
 		 144 aa  98.6  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  37.7 
 
 		 143 aa  99  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0537  FUR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 144 aa  98.6  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00799734  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0453  ferric uptake regulator family protein  37.7 
 
 		 142 aa  99  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.964373  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4784  transcriptional regulator, Fur family  37.7 
 
 		 142 aa  99  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  hitchhiker  0.00000172777 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2366  ferric uptake regulator, Fur family  38.93 
 
 		 131 aa  99  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.437919 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  39.32 
 
 		 150 aa  98.2  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  37.7 
 
 		 142 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000515951 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1230  FUR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 139 aa  98.2  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0757057  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  37.7 
 
 		 142 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1420  FUR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 139 aa  95.5  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0522352  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1915  ferric uptake regulator family protein  38.33 
 
 		 148 aa  92  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1398  FUR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 150 aa  92  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1949  ferric-uptake regulator  38.33 
 
 		 148 aa  92  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.869616  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2524  ferric uptake regulator, Fur family  34.88 
 
 		 138 aa  90.9  6e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.568134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0284  ferric uptake regulator family protein  37.69 
 
 		 128 aa  89  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0246387 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1388  ferric uptake regulator, Fur family  33.59 
 
 		 136 aa  87.8  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00327608  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1301  ferric uptake regulator family protein  34.68 
 
 		 166 aa  87.4  6e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0281675  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2513  ferric uptake regulator, Fur family  38.4 
 
 		 137 aa  86.7  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.275348  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1143  ferric uptake regulation protein  34.88 
 
 		 154 aa  86.3  1e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0587945  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1792  ferric uptake regulator, Fur family  32.79 
 
 		 150 aa  85.9  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000306351  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0487  ferric uptake regulation protein  33.07 
 
 		 151 aa  85.5  2e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1061  FUR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 149 aa  84.7  4e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.304588  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1037  ferric uptake regulator family protein  44.83 
 
 		 133 aa  84.7  4e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0953137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1722  ferric uptake regulator family protein  35.25 
 
 		 146 aa  84.3  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.907916 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1966  ferric uptake regulator family protein  33.06 
 
 		 149 aa  84.3  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00359557  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0365  ferric uptake regulator, Fur family  34.11 
 
 		 150 aa  84  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1472  ferric uptake regulator, Fur family  35.77 
 
 		 131 aa  83.6  8e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000290418  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0615  ferric uptake regulator, Fur family  34.65 
 
 		 139 aa  83.6  9e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.12884  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2147  ferric uptake regulation protein  36 
 
 		 155 aa  83.2  0.000000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000154091  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25080  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  35.71 
 
 		 130 aa  82.8  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0884067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2790  ferric uptake regulator family protein  32.33 
 
 		 151 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000512773  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3922  ferric uptake regulator family protein  31.58 
 
 		 151 aa  82  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000572819  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4201  transcriptional regulator, Fur family  31.58 
 
 		 151 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0217905  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0224  putative iron-regulated membrane protein  35.2 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1557  ferric uptake regulation protein  31.78 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.754844  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1036  transcriptional regulator, Fur family  31.58 
 
 		 151 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0163253  normal  0.210334 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0423  ferric uptake regulation protein  31.78 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00356258  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0449  ferric uptake regulation protein  32.28 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.270092  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1555  ferric uptake regulator family protein  34.11 
 
 		 149 aa  81.3  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4160  FUR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 151 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4001  FUR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 151 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000832394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3832  FUR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 151 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3848  FUR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 151 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000844204  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4224  transcriptional regulator, Fur family  31.58 
 
 		 151 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00546613  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4313  FUR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 151 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1586  ferric-uptake regulator  34.11 
 
 		 149 aa  81.3  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.501887  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4115  transcriptional regulator, Fur family  31.58 
 
 		 151 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5116299999999997e-20 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0352  ferric uptake regulator, Fur family  29.6 
 
 		 131 aa  80.9  0.000000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.541343 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2141  ferric uptake regulator family protein  33.59 
 
 		 137 aa  80.5  0.000000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0105  ferric uptake regulator family protein  32.48 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.013681  normal  0.263297 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3251  ferric uptake regulator family protein  33.06 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1300  ferric uptake regulator family protein  30.23 
 
 		 151 aa  78.2  0.00000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01120  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  32.58 
 
 		 137 aa  77.8  0.00000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1806  ferric uptake regulator family protein  33.06 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.696064  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2668  ferric uptake regulator family protein  31.45 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1073  ferric uptake regulator, Fur family  31.06 
 
 		 133 aa  77.4  0.00000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  29.27 
 
 		 153 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  29.13 
 
 		 146 aa  77  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1536  ferric uptake regulator, Fur family  30.83 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.514576  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2259  ferric uptake regulator, Fur family  33.33 
 
 		 154 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0391  FUR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 159 aa  74.3  0.0000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  29.69 
 
 		 143 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3112  ferric uptake regulator family protein  31.25 
 
 		 146 aa  74.3  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.966736  normal  0.35423 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2644  ferric uptake regulator family protein  32.28 
 
 		 146 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1241  ferric uptake regulator, Fur family  31.15 
 
 		 170 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00903138 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4185  ferric uptake regulator, Fur family  30.08 
 
 		 139 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.421488  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2809  FUR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 152 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.110848  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1147  ferric uptake regulator family protein  33.59 
 
 		 155 aa  72.8  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1415  ferric uptake regulator family protein  31.97 
 
 		 140 aa  73.2  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000000163802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1564  ferric uptake regulator family protein  29.27 
 
 		 167 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0495536  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  28.46 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2300  ferric uptake regulator, Fur family  29.27 
 
 		 167 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  29.46 
 
 		 143 aa  72  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2388  ferric uptake regulator, Fur family  29.27 
 
 		 167 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1279  transcriptional regulator, Fur family  40.45 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000471651  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  31.2 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2401  ferric uptake regulator, Fur family  34.11 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1295  ferric uptake regulator family protein  33.87 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000494544  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1224  ferric uptake regulator family protein  28.21 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.293203  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1645  ferric uptake regulation protein (ferric uptake regulator)  30.71 
 
 		 155 aa  70.9  0.000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>