203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3740 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3740  ATP synthase F0, B subunit  100 
 
 
194 aa  385  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  35.62 
 
 
166 aa  94  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  32.65 
 
 
181 aa  84  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1428  ATP synthase F0, B subunit  29.58 
 
 
163 aa  80.9  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.221942  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0859  F0F1 ATP synthase subunit B  25.49 
 
 
165 aa  74.3  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0732161  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  30.38 
 
 
162 aa  74.3  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4169  ATP synthase F0, B subunit  25.52 
 
 
165 aa  69.3  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0813106  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0268  ATP synthase F0, B subunit  29.53 
 
 
161 aa  68.9  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0661  F0F1-type ATP synthase, subunit b  29.49 
 
 
176 aa  68.6  0.00000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.300947  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2143  F0F1 ATP synthase subunit B  27.63 
 
 
173 aa  68.2  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.631434  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2181  F0F1 ATP synthase subunit B  27.63 
 
 
173 aa  68.2  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.273543  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  30.34 
 
 
175 aa  65.5  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06108  ATP synthase B chain  29.87 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4068  F0F1 ATP synthase subunit B  22.36 
 
 
164 aa  65.1  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0525312  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3288  F0F1 ATP synthase subunit B  25.17 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.160099  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1713  F0F1 ATP synthase subunit B  26.8 
 
 
171 aa  63.9  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1242  F0F1 ATP synthase subunit B  25.74 
 
 
166 aa  64.3  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  31.08 
 
 
175 aa  64.3  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  25.93 
 
 
164 aa  63.9  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  25.71 
 
 
164 aa  63.5  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1302  ATP synthase F0, B subunit  25.34 
 
 
203 aa  63.5  0.000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0209065  normal  0.277498 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2386  F0F1-type ATP synthase subunit b-like protein  27.59 
 
 
173 aa  62.4  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  30.07 
 
 
174 aa  61.6  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2456  F0F1 ATP synthase subunit B  28.89 
 
 
159 aa  61.6  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3307  F0F1 ATP synthase subunit B  27.82 
 
 
179 aa  61.6  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000544388  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  27.59 
 
 
168 aa  60.8  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4543  F0F1 ATP synthase subunit B  29.11 
 
 
156 aa  61.2  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000204898  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4206  F0F1 ATP synthase subunit B  29.75 
 
 
156 aa  60.1  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000301032  normal  0.110777 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2166  F0F1 ATP synthase subunit B  28.15 
 
 
154 aa  60.5  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0517  F0F1 ATP synthase subunit B  26.03 
 
 
165 aa  60.1  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0641052  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4222  F0F1 ATP synthase subunit B  29.75 
 
 
156 aa  60.1  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000120045  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3154  ATP synthase F0, B subunit  28.28 
 
 
189 aa  60.1  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  24.19 
 
 
194 aa  60.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4180  F0F1 ATP synthase subunit B  29.75 
 
 
156 aa  60.1  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000186765  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl111  ATP synthase subunit B  28.97 
 
 
177 aa  58.9  0.00000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03620  F0F1 ATP synthase subunit B  28.48 
 
 
156 aa  58.2  0.00000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00121932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4231  ATP synthase F0, B subunit  28.48 
 
 
156 aa  58.2  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00770304  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03564  hypothetical protein  28.48 
 
 
156 aa  58.2  0.00000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000629937  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4258  F0F1 ATP synthase subunit B  28.48 
 
 
156 aa  58.2  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00109237  normal  0.0337156 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5172  F0F1 ATP synthase subunit B  28.48 
 
 
156 aa  58.2  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000636069  hitchhiker  0.00809624 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4185  F0F1 ATP synthase subunit B  28.48 
 
 
156 aa  58.2  0.00000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709577  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4104  F0F1 ATP synthase subunit B  28.48 
 
 
156 aa  58.2  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000546623  normal  0.0856146 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3952  F0F1 ATP synthase subunit B  28.48 
 
 
156 aa  58.2  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000175461  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4252  F0F1 ATP synthase subunit B  28.48 
 
 
156 aa  58.2  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515942  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  25.87 
 
 
178 aa  58.2  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0004  F0F1 ATP synthase subunit B  29.11 
 
 
156 aa  57.8  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000383011  hitchhiker  0.00333744 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1312  ATP synthase F0 subunit B  24.39 
 
 
181 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.541533  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73290  F0F1 ATP synthase subunit B  27.46 
 
 
156 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4128  F0F1 ATP synthase subunit B  27.85 
 
 
156 aa  57.4  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00062325  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0144  ATP synthase F0, B subunit  26.97 
 
 
180 aa  56.6  0.0000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5435  F0F1 ATP synthase subunit B  28.47 
 
 
156 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5204  F0F1 ATP synthase subunit B  28.47 
 
 
156 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.228088  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0463  ATP synthase F0, B subunit  22.5 
 
 
172 aa  56.6  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.018727  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4474  ATP synthase F0, B subunit  23.29 
 
 
179 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4150  F0F1 ATP synthase subunit B  27.85 
 
 
156 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.039629  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2883  F0F1 ATP synthase subunit B  30.41 
 
 
175 aa  56.2  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126633  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4079  F0F1 ATP synthase subunit B  27.85 
 
 
156 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0615149  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4259  F0F1 ATP synthase subunit B  27.85 
 
 
156 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0777142  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2873  F0F1 ATP synthase subunit B  25 
 
 
146 aa  56.2  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.405678  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4094  F0F1 ATP synthase subunit B  27.85 
 
 
156 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000422543  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1177  ATP synthase F0, B subunit  28.12 
 
 
164 aa  55.8  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.937871  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4200  F0F1 ATP synthase subunit B  27.85 
 
 
156 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.109353  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1277  ATP synthase F0, B subunit  28.12 
 
 
164 aa  55.8  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.279271  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5417  F0F1 ATP synthase subunit B  27.74 
 
 
156 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.496413  hitchhiker  0.000678034 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3989  F0F1 ATP synthase subunit B  26.62 
 
 
156 aa  55.8  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  31.72 
 
 
175 aa  55.5  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4338  ATP synthase F0, B subunit  23.29 
 
 
179 aa  55.8  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209021  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0067  ATP synthase F0, B subunit  26.85 
 
 
175 aa  55.8  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6360  F0F1 ATP synthase subunit B  26.76 
 
 
156 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5125  F0F1 ATP synthase subunit B  25.87 
 
 
156 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0727464  normal  0.577364 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3515  F0F1 ATP synthase subunit B  27.33 
 
 
156 aa  55.5  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  22.45 
 
 
206 aa  55.5  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0080  ATP synthase F0, B subunit  26.9 
 
 
181 aa  55.1  0.0000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18240  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  27.27 
 
 
192 aa  55.1  0.0000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.539535  normal  0.298541 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5299  F0F1 ATP synthase subunit B  27.74 
 
 
156 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.329705  normal  0.143004 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5603  ATP synthase F0, B subunit  25.87 
 
 
156 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1700  F0F1 ATP synthase subunit B  30.14 
 
 
156 aa  55.1  0.0000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.169268  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1029  ATP synthase F0, B subunit  24.84 
 
 
167 aa  55.1  0.0000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2489  F0F1 ATP synthase subunit B  28.19 
 
 
175 aa  54.7  0.0000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305387  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0008  ATP synthase F0, B subunit  28.97 
 
 
157 aa  53.9  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.320711  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  27.07 
 
 
175 aa  54.3  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3063  F0F1 ATP synthase subunit B  26.9 
 
 
156 aa  54.3  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4493  ATP synthase F0, B subunit  23.29 
 
 
179 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2591  ATP synthase F0, B subunit  26.53 
 
 
156 aa  53.9  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.165312  normal  0.0791897 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4611  ATP synthase F0, B subunit  27.59 
 
 
156 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4244  F0F1 ATP synthase subunit B  24.38 
 
 
156 aa  53.5  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00033508  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0079  ATP synthase F0, B subunit  31.3 
 
 
162 aa  53.5  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0896  ATP synthase F0 subunit B  23.76 
 
 
181 aa  53.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3849  F0F1 ATP synthase subunit B  26.71 
 
 
156 aa  53.5  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.28383  hitchhiker  0.0000250407 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2524  F0F1 ATP synthase subunit B  26.9 
 
 
156 aa  53.1  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00056725  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3829  F0F1 ATP synthase subunit B  25.68 
 
 
168 aa  53.5  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.242608  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5434  F0F1 ATP synthase subunit B  25.68 
 
 
168 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5159  F0F1 ATP synthase subunit B  25.68 
 
 
168 aa  52.8  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4992  F0F1 ATP synthase subunit B  25.68 
 
 
168 aa  52.8  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.416511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5009  F0F1 ATP synthase subunit B  25.68 
 
 
168 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5734  F0F1 ATP synthase subunit B  23.78 
 
 
156 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0047382  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5551  F0F1 ATP synthase subunit B  25.68 
 
 
168 aa  52.8  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0100473  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5107  F0F1 ATP synthase subunit B  25.68 
 
 
168 aa  53.1  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.164846  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5431  F0F1 ATP synthase subunit B  25.68 
 
 
168 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0030165  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5400  F0F1 ATP synthase subunit B  25.68 
 
 
168 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.95382e-52 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>