More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3697 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3697  two component AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 517 aa  1055    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000611836  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1583  two component AraC family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 533 aa  173  7.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.160886  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  27.08 
 
 		 513 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3156  two component transcriptional regulator, AraC family  23.96 
 
 		 515 aa  163  8.000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.949308  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  26.53 
 
 		 537 aa  159  8e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2113  two component AraC family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 548 aa  142  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0944  two component transcriptional regulator, AraC family  24.31 
 
 		 539 aa  113  8.000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1982  two component transcriptional regulator, AraC family  25.65 
 
 		 544 aa  106  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.184696  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2113  two component transcriptional regulator, AraC family  23.33 
 
 		 538 aa  105  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.141697  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1228  two component transcriptional regulator, AraC family  24.52 
 
 		 532 aa  103  9e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  41.9 
 
 		 530 aa  101  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0937  transcriptional regulator, AraC family  43.4 
 
 		 291 aa  101  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.440102  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0995  two component transcriptional regulator, AraC family  23.81 
 
 		 542 aa  100  8e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  42.86 
 
 		 519 aa  100  8e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2007  two component AraC family transcriptional regulator  23.32 
 
 		 529 aa  99.4  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0525  two component AraC family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 522 aa  98.6  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3164  two component AraC family transcriptional regulator  21.7 
 
 		 544 aa  97.4  6e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0633186  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2123  two component AraC family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 414 aa  95.5  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.331776  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3657  AraC family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 430 aa  95.5  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0771  two component AraC family transcriptional regulator  48.91 
 
 		 355 aa  95.1  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000862622  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2786  AraC family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 411 aa  92  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.173826  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1627  transcriptional regulator, AraC family  40.38 
 
 		 273 aa  92  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000116038  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1003  DNA-binding response regulator  39.32 
 
 		 250 aa  90.9  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4578  AraC family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 409 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0591899  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0919  two component AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 356 aa  88.6  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1172  AraC family DNA-binding response regulator  41.35 
 
 		 250 aa  86.7  8e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409048  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  37.11 
 
 		 1201 aa  86.7  9e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2253  two component AraC family transcriptional regulator  23.45 
 
 		 532 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2708  transcriptional activator MltR  33.64 
 
 		 301 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.215541  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4562  AraC family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 409 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00627934  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4320  transcriptional regulator, AraC family  28.23 
 
 		 427 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4969  transcriptional regulator, AraC family  26.52 
 
 		 409 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0583  AraC family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 312 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.98908  normal  0.54842 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 204 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2718  two component transcriptional regulator, AraC family  37.14 
 
 		 259 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2441  helix-turn-helix, AraC type  33.64 
 
 		 307 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0002572  decreased coverage  0.000290212 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1459  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  36.08 
 
 		 198 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000164097 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2926  transcriptional regulator MtlR  33.91 
 
 		 287 aa  84  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795893  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34440  transcriptional regulator MtlR  33.91 
 
 		 301 aa  83.6  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000688741  normal  0.560291 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15370  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  29.82 
 
 		 415 aa  83.6  0.000000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 299 aa  82.8  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2277  regulatory protein PocR  36.7 
 
 		 304 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000774305  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2212  AraC family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 302 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0410  two component transcriptional regulator, AraC family  37.86 
 
 		 233 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4467  AraC family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 301 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0399  response regulator receiver protein  36.23 
 
 		 365 aa  83.2  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2372  regulatory protein PocR  37.11 
 
 		 303 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.740068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1509  transcriptional regulator, AraC family  38.3 
 
 		 272 aa  82  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3497  AraC family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 198 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.27794  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2259  regulatory protein PocR  37.11 
 
 		 303 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.746184  normal  0.221956 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2641  AraC family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 301 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1602  transcriptional regulator  43.02 
 
 		 330 aa  82  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2213  regulatory protein PocR  37.11 
 
 		 303 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.639643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2607  AraC family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 303 aa  82  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.334421  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2159  regulatory protein PocR  37.11 
 
 		 303 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.385139  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3282  two component AraC family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 535 aa  82.4  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2461  AraC family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 277 aa  82  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2329  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 773 aa  82.4  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2206  regulatory protein PocR  33.07 
 
 		 303 aa  82.4  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3840  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  35.05 
 
 		 198 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3986  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  40 
 
 		 289 aa  81.6  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.542106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1179  two component AraC family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 359 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3104  response regulator receiver protein  31.58 
 
 		 266 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3327  AraC family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 146 aa  80.9  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000116444  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3751  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  35.05 
 
 		 198 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000128468 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3182  AraC family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 315 aa  80.9  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000265571 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3788  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  36.08 
 
 		 198 aa  80.9  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  34 
 
 		 304 aa  80.9  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2042  AraC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 301 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0618  two component AraC family transcriptional regulator  46.59 
 
 		 258 aa  80.5  0.00000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000605397  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1891  transcriptional regulator, AraC family  40.21 
 
 		 291 aa  80.5  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3436  AraC family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 279 aa  80.5  0.00000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3550  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 313 aa  80.1  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2508  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 336 aa  80.1  0.00000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.207874  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0692  transcriptional regulator, AraC family  38.46 
 
 		 287 aa  80.1  0.00000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1189  AraC family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 550 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.459992  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0013  AraC family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 485 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.344073  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1596  transcriptional regulator, AraC family  32.17 
 
 		 287 aa  79.7  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  38 
 
 		 286 aa  80.1  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0149  AraC family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 331 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.511163  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0427  AraC family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 331 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.459699  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1497  AraC family transcription regulator  35.58 
 
 		 337 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.141505  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1411  AraC family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 337 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.439169  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5603  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 409 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3740  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 301 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1089  helix-turn-helix domain-containing protein  36.08 
 
 		 298 aa  79.7  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99301  hitchhiker  0.00294409 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0600  two component transcriptional regulator, AraC family  25.75 
 
 		 546 aa  79.7  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3585  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  34.02 
 
 		 198 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3485  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 198 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.781082  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1280  two component transcriptional regulator, AraC family  31.67 
 
 		 492 aa  79  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3869  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  34.02 
 
 		 198 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4074  AraC family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 290 aa  79  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.63505 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1003  transcriptional regulator, AraC family  38.32 
 
 		 289 aa  79  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1151  AraC family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 342 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0648007  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0876  transcriptional regulator, AraC family  36.63 
 
 		 405 aa  79.3  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3129  AraC family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 299 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0853  two component transcriptional regulator, AraC family  32.74 
 
 		 509 aa  78.6  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27420  transcriptional regulator MtlR (AraC family)  35.05 
 
 		 299 aa  78.6  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467419  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1111  AraC family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 506 aa  78.2  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000128485  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1750  AraC family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 359 aa  78.2  0.0000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>