More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3694 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3694  NusG antitermination factor  100 
 
 		 172 aa  347  4e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000043421  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2719  transcription antitermination protein nusG  61.08 
 
 		 177 aa  218  3e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00403072  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0307  NusG antitermination factor  57.49 
 
 		 172 aa  211  3.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000155754  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0854  transcription antitermination protein NusG  58.93 
 
 		 174 aa  211  4.9999999999999996e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000907525  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2727  transcription antitermination protein NusG  59.17 
 
 		 173 aa  206  2e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000231541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2413  transcription antitermination protein NusG  59.17 
 
 		 173 aa  206  2e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000134964  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0405  NusG antitermination factor  52.38 
 
 		 175 aa  186  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000272103  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1930  NusG antitermination factor  49.42 
 
 		 175 aa  181  3e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000062864  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1532  NusG antitermination factor  53.8 
 
 		 174 aa  181  4.0000000000000006e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000537782  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2347  NusG antitermination factor  48.82 
 
 		 203 aa  179  1e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00861255  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0093  transcription antitermination protein NusG  52.6 
 
 		 177 aa  178  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0273  NusG antitermination factor  54.71 
 
 		 175 aa  178  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000233733  hitchhiker  0.00819689 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2725  NusG antitermination factor  49.13 
 
 		 181 aa  177  4.999999999999999e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0672465  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0202  NusG antitermination factor  55.03 
 
 		 175 aa  174  5e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000100106  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2473  transcription antitermination protein nusG  47.65 
 
 		 175 aa  172  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147395  decreased coverage  0.00105272 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0180  transcription antitermination protein nusG  47.06 
 
 		 174 aa  170  6.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000727534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4321  NusG antitermination factor  47.65 
 
 		 194 aa  169  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0895327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3325  NusG antitermination factor  48.24 
 
 		 194 aa  169  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0701558  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01040  NusG antitermination factor  50.88 
 
 		 176 aa  169  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.9624500000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0121  NusG antitermination factor  47.62 
 
 		 188 aa  167  5e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.978934  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0210  NusG antitermination factor  48.54 
 
 		 178 aa  166  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000666853  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0177  transcription termination/antitermination factor NusG  49.12 
 
 		 182 aa  166  2e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0856403  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1477  NusG antitermination factor  45.88 
 
 		 187 aa  165  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0560518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0573  transcription antitermination protein  48.54 
 
 		 182 aa  164  8e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000169093  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0559  transcription antitermination protein  48.54 
 
 		 182 aa  164  8e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00288108  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6641  NusG antitermination factor  44.51 
 
 		 266 aa  161  5.0000000000000005e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0097  transcription antitermination protein NusG  50.87 
 
 		 177 aa  159  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000931665  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0090  transcription antitermination protein NusG  52.02 
 
 		 177 aa  157  5e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000996375  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0096  transcription antitermination protein NusG  51.45 
 
 		 177 aa  157  9e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000261698  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0096  transcription antitermination protein NusG  51.45 
 
 		 177 aa  157  9e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132326  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0092  transcription antitermination protein NusG  51.45 
 
 		 177 aa  157  9e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  6.07687e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0090  transcription antitermination protein NusG  51.45 
 
 		 177 aa  157  9e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176433  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5210  transcription antitermination protein NusG  51.45 
 
 		 177 aa  157  9e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000809778  unclonable  4.0608300000000004e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0096  transcription antitermination protein NusG  51.45 
 
 		 177 aa  157  9e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000457799  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0116  transcription antitermination protein NusG  51.45 
 
 		 177 aa  157  9e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0126  transcription antitermination protein NusG  51.45 
 
 		 177 aa  157  9e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0922  transcription antitermination protein NusG  38.34 
 
 		 270 aa  156  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0939  transcription antitermination protein NusG  38.34 
 
 		 270 aa  156  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1512  NusG antitermination factor  46.78 
 
 		 181 aa  155  2e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000324122  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0950  transcription antitermination protein NusG  38.34 
 
 		 271 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0386  NusG antitermination factor  42.86 
 
 		 243 aa  155  3e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4525  NusG antitermination factor  40.54 
 
 		 272 aa  155  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0091  transcription antitermination protein NusG  50.87 
 
 		 177 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481772  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1148  NusG antitermination factor  44.38 
 
 		 207 aa  154  5.0000000000000005e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000795097  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5117  transcription antitermination protein NusG  39.58 
 
 		 272 aa  154  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0268  transcription antitermination protein nusG  43.89 
 
 		 192 aa  154  6e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000582831  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4356  NusG antitermination factor  41.99 
 
 		 238 aa  154  8e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1234  transcription antitermination protein NusG  39.69 
 
 		 266 aa  154  8e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329815 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0355  transcription antiterminator  45.71 
 
 		 183 aa  153  1e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000436573 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1111  transcription termination/antitermination factor NusG  40.1 
 
 		 299 aa  152  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.106729  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29880  transcription antitermination protein nusG  42.46 
 
 		 273 aa  152  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.574847  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03630  transcription antitermination protein nusG  42.7 
 
 		 267 aa  152  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0307  transcription antitermination protein nusG  43.93 
 
 		 180 aa  152  2e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000733893  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2167  transcription antitermination protein nusG  45.88 
 
 		 176 aa  152  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3938  transcription termination/antitermination factor NusG  42.94 
 
 		 242 aa  151  4e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0741  NusG antitermination factor  39.29 
 
 		 276 aa  151  4e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4330  NusG antitermination factor  42.37 
 
 		 242 aa  150  5.9999999999999996e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1013  NusG antitermination factor  41.44 
 
 		 306 aa  150  7e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1824  NusG antitermination factor  44.05 
 
 		 201 aa  149  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1068  Transcription antiterminator-like protein  40.57 
 
 		 266 aa  150  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10652  transcription antitermination protein NusG  39.36 
 
 		 238 aa  148  4e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0333893 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2659  transcription antitermination protein NusG  39.33 
 
 		 250 aa  148  4e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0611  NusG antitermination factor  41.85 
 
 		 265 aa  148  4e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.837872  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5109  NusG antitermination factor  38.8 
 
 		 280 aa  147  7e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210055  normal  0.503084 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2954  NusG antitermination factor  40.43 
 
 		 198 aa  147  8e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000249386  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0575  NusG antitermination factor  40.56 
 
 		 273 aa  146  1.0000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.603721  hitchhiker  0.00747859 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1422  transcription antitermination protein nusG  47.98 
 
 		 185 aa  146  1.0000000000000001e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.002098  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09670  transcription antitermination protein nusG  43.27 
 
 		 178 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00365981  hitchhiker  0.0000231337 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0695  transcription termination/antitermination factor NusG  40 
 
 		 317 aa  144  7.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23990  transcription antitermination protein nusG  40.33 
 
 		 301 aa  144  8.000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.160343  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5965  NusG antitermination factor  38.66 
 
 		 269 aa  144  8.000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.981962 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1334  NusG antitermination factor  42.6 
 
 		 175 aa  143  9e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0792615  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0689  transcription termination/antitermination factor NusG  43.2 
 
 		 177 aa  143  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.8031099999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0568  transcription antitermination protein nusG  42.86 
 
 		 277 aa  143  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0294  transcription antitermination protein nusG  44 
 
 		 228 aa  143  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.620815 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2687  NusG antitermination factor  43.82 
 
 		 185 aa  143  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00303522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6062  NusG antitermination factor  43.86 
 
 		 273 aa  142  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.275139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2700  transcription antitermination protein NusG  38.01 
 
 		 176 aa  142  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2336  NusG antitermination factor  39.18 
 
 		 177 aa  142  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.045954  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0921  NusG antitermination factor  42.01 
 
 		 175 aa  142  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3340  NusG antitermination factor  42.01 
 
 		 175 aa  142  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0014891 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21030  transcription antitermination protein nusG  38.1 
 
 		 296 aa  142  3e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0843287  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0994  transcription antitermination protein NusG  42.26 
 
 		 177 aa  140  8e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000169889  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1175  NusG antitermination factor  42.05 
 
 		 181 aa  140  9e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000364949  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3597  NusG antitermination factor  39.31 
 
 		 202 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.259347  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0668  NusG antitermination factor  39.64 
 
 		 175 aa  139  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.652128  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5088  transcription antitermination protein NusG  36.99 
 
 		 185 aa  139  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120932  normal  0.503676 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4536  transcription antitermination protein nusG  38.73 
 
 		 197 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.151972  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2868  transcription antitermination protein NusG  41.42 
 
 		 175 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.157482  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0885  transcription antitermination protein nusG  42.26 
 
 		 177 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0219053  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0537  NusG antitermination factor  39.11 
 
 		 246 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  hitchhiker  0.00572765 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0583  NusG antitermination factor  38.73 
 
 		 203 aa  139  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08690  transcription antitermination protein nusG  43.86 
 
 		 178 aa  139  1.9999999999999998e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000619667  hitchhiker  0.000000019364 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0835  transcription antitermination protein nusG  37.65 
 
 		 176 aa  139  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000261776  normal  0.0934709 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1056  NusG antitermination factor  41.42 
 
 		 175 aa  138  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.654649  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_866  transcription antiterminator  41.67 
 
 		 177 aa  138  3.9999999999999997e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00385803  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2707  NusG antitermination factor  38.25 
 
 		 267 aa  137  4.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0283787 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2995  NusG antitermination factor  38.46 
 
 		 287 aa  137  4.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1025  transcription antitermination protein NusG  38.82 
 
 		 176 aa  137  6e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0614  transcription antitermination protein nusG  41.42 
 
 		 175 aa  137  7e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000451246 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>