More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3692 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3692  ribosomal protein L1  100 
 
 		 230 aa  463  1e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000151678  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2721  50S ribosomal protein L1  76.96 
 
 		 231 aa  348  5e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127574  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0309  50S ribosomal protein L1  78.22 
 
 		 230 aa  343  8.999999999999999e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0170319  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1530  50S ribosomal protein L1  67.98 
 
 		 230 aa  335  2.9999999999999997e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000127232  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2471  50S ribosomal protein L1  66.52 
 
 		 231 aa  319  1.9999999999999998e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  hitchhiker  0.00777473 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2725  50S ribosomal protein L1  71.68 
 
 		 229 aa  319  1.9999999999999998e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000462552  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2411  50S ribosomal protein L1  71.68 
 
 		 229 aa  319  1.9999999999999998e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000512351  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0856  50S ribosomal protein L1  69.43 
 
 		 230 aa  316  2e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000185888  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2723  ribosomal protein L1  66.38 
 
 		 233 aa  316  2e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0212  50S ribosomal protein L1  64.91 
 
 		 231 aa  315  5e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0231088  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0179  50S ribosomal protein L1  63.16 
 
 		 231 aa  305  4.0000000000000004e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000606052  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0275  50S ribosomal protein L1  62.28 
 
 		 232 aa  304  9.000000000000001e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000501108  hitchhiker  0.000549627 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0407  50S ribosomal protein L1  66.96 
 
 		 230 aa  302  3.0000000000000004e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.3464e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0575  50S ribosomal protein L1  61.84 
 
 		 230 aa  301  5.000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000352195  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0561  50S ribosomal protein L1  61.84 
 
 		 230 aa  301  5.000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000069455  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2345  ribosomal protein L1  61.33 
 
 		 233 aa  300  1e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0238114  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1146  ribosomal protein L1  64.76 
 
 		 236 aa  299  2e-80  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000284572  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0095  50S ribosomal protein L1  67.69 
 
 		 233 aa  296  1e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0099  50S ribosomal protein L1  67.69 
 
 		 233 aa  295  3e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000132548  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5208  50S ribosomal protein L1  66.81 
 
 		 230 aa  295  3e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140164  unclonable  7.070390000000001e-26 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1928  ribosomal protein L1  64.47 
 
 		 232 aa  295  3e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0450124  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0118  50S ribosomal protein L1  67.25 
 
 		 230 aa  294  7e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0098  50S ribosomal protein L1  67.25 
 
 		 230 aa  293  1e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000678721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0098  50S ribosomal protein L1  67.25 
 
 		 230 aa  293  1e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000382446  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0094  50S ribosomal protein L1  67.25 
 
 		 230 aa  293  1e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.15488e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0092  50S ribosomal protein L1  67.25 
 
 		 230 aa  293  1e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000339498  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0128  50S ribosomal protein L1  67.25 
 
 		 230 aa  293  1e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000143327  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0098  50S ribosomal protein L1  67.25 
 
 		 230 aa  293  1e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000205875  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0109  50S ribosomal protein L1  67.25 
 
 		 230 aa  293  1e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9844e-61 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0092  50S ribosomal protein L1  66.23 
 
 		 230 aa  292  3e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000171982  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0182  LSU ribosomal protein L1P  60.79 
 
 		 233 aa  292  3e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000240107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0093  50S ribosomal protein L1  66.38 
 
 		 230 aa  290  1e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000014838  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4019  ribosomal protein L1  58.67 
 
 		 235 aa  288  6e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.534035 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1822  ribosomal protein L1  56.71 
 
 		 242 aa  285  5.999999999999999e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0480  50S ribosomal protein L1  56.58 
 
 		 233 aa  284  7e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.841279  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1058  50S ribosomal protein L1  57.83 
 
 		 233 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.30711  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0670  50S ribosomal protein L1  59.73 
 
 		 233 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.759589  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0204  ribosomal protein L1  61.84 
 
 		 229 aa  282  3.0000000000000004e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000198509  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01060  ribosomal protein L1  59.47 
 
 		 235 aa  282  3.0000000000000004e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.745230000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0465  50S ribosomal protein L1  56.58 
 
 		 233 aa  281  5.000000000000001e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00222885  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2866  50S ribosomal protein L1  58.74 
 
 		 234 aa  279  2e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1173  ribosomal protein L1  58.33 
 
 		 235 aa  280  2e-74  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000649528  unclonable  0.0000000262625 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1336  50S ribosomal protein L1  57.96 
 
 		 233 aa  280  2e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.167533  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1589  50S ribosomal protein L1  61.75 
 
 		 234 aa  278  4e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0577  ribosomal protein L1  59.29 
 
 		 236 aa  278  4e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0677262  hitchhiker  0.00322479 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2283  50S ribosomal protein L1  58.33 
 
 		 229 aa  278  7e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00159003  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2274  50S ribosomal protein L1  61.29 
 
 		 234 aa  277  8e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2362  50S ribosomal protein L1  61.29 
 
 		 234 aa  277  8e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.193513  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1373  50S ribosomal protein L1  55.17 
 
 		 242 aa  276  1e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00191675  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0643  50S ribosomal protein L1  54.39 
 
 		 232 aa  277  1e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0857628  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0923  50S ribosomal protein L1  57.39 
 
 		 233 aa  277  1e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4354  ribosomal protein L1  60 
 
 		 236 aa  276  2e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0616  50S ribosomal protein L1  57.96 
 
 		 234 aa  275  3e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000217065 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0691  50S ribosomal protein L1  57.78 
 
 		 233 aa  275  5e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.4447699999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3338  50S ribosomal protein L1  56.52 
 
 		 233 aa  274  9e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000142685 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2224  50S ribosomal protein L1  60.83 
 
 		 234 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.009605 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2657  50S ribosomal protein L1P  56.89 
 
 		 235 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.106941  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1475  50S ribosomal protein L1  56.19 
 
 		 237 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0729357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1324  ribosomal protein L1  54.63 
 
 		 242 aa  271  4.0000000000000004e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3936  50S ribosomal protein L1  57.33 
 
 		 238 aa  272  4.0000000000000004e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0699  ribosomal protein L1  56.7 
 
 		 234 aa  271  7e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0241249  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4328  50S ribosomal protein L1  56.44 
 
 		 238 aa  270  1e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0357  50S ribosomal protein L1  57.02 
 
 		 230 aa  270  1e-71  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000538139 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1805  50S ribosomal protein L1P  59.38 
 
 		 232 aa  267  1e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.163663 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5963  50S ribosomal protein L1  55.9 
 
 		 236 aa  266  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0912  ribosomal protein L1  55.9 
 
 		 237 aa  265  2.9999999999999995e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911951  normal  0.174852 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0522  ribosomal protein L1  54.46 
 
 		 235 aa  265  2.9999999999999995e-70  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1546  ribosomal protein L1  56.7 
 
 		 234 aa  265  4e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.826154 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4679  50S ribosomal protein L1  55.26 
 
 		 235 aa  265  5.999999999999999e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000682303  decreased coverage  0.0030741 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0301  50S ribosomal protein L1  53.68 
 
 		 242 aa  265  5.999999999999999e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000226656  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0697  50S ribosomal protein L1P  57.46 
 
 		 259 aa  264  8e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1510  ribosomal protein L1  57.14 
 
 		 235 aa  264  1e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000430301  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0388  ribosomal protein L1  54.15 
 
 		 241 aa  263  2e-69  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0846  50S ribosomal protein L1  52.84 
 
 		 235 aa  263  2e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000865088  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3471  50S ribosomal protein L1  55.9 
 
 		 230 aa  259  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1624  50S ribosomal protein L1  56.52 
 
 		 230 aa  259  2e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29860  LSU ribosomal protein L1P  55.75 
 
 		 238 aa  259  3e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0316  50S ribosomal protein L1  54.67 
 
 		 229 aa  258  4e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000103871  hitchhiker  0.000950319 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1105  ribosomal protein L1  52.61 
 
 		 236 aa  258  4e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0193805  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2957  50S ribosomal protein L1  55.22 
 
 		 231 aa  258  6e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0502013 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0354  50S ribosomal protein L1  54.42 
 
 		 229 aa  257  9e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000103528  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2784  ribosomal protein L1  52.63 
 
 		 234 aa  257  1e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0008683  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl608  50S ribosomal protein L1  56.6 
 
 		 227 aa  256  2e-67  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3327  50S ribosomal protein L1  53.95 
 
 		 240 aa  256  2e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.24535  normal  0.407372 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3160  ribosomal protein L1  56.19 
 
 		 238 aa  256  2e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.496068  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23970  LSU ribosomal protein L1P  55.75 
 
 		 239 aa  256  3e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0702955  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0539  50S ribosomal protein L1  59.56 
 
 		 237 aa  256  3e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.653827  normal  0.0435444 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0193  50S ribosomal protein L1  55.75 
 
 		 229 aa  255  4e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000225522  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5111  ribosomal protein L1  54.67 
 
 		 225 aa  255  5e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253072  normal  0.533351 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0309  50S ribosomal protein L1  54.82 
 
 		 253 aa  255  5e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000338213  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2564  50S ribosomal protein L1  55.9 
 
 		 232 aa  254  7e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0511824 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2675  ribosomal protein L1  54.63 
 
 		 238 aa  253  1.0000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2278  50S ribosomal protein L1  55.56 
 
 		 229 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.360769  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0446  50S ribosomal protein L1  54.82 
 
 		 233 aa  253  2.0000000000000002e-66  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0241504  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2165  50S ribosomal protein L1P  53.12 
 
 		 230 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0296  50S ribosomal protein L1P  55.9 
 
 		 239 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_002620  TC0592  50S ribosomal protein L1  51.32 
 
 		 232 aa  252  3e-66  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0784244  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1822  50S ribosomal protein L1  57.14 
 
 		 232 aa  253  3e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0358  50S ribosomal protein L1  54.46 
 
 		 236 aa  252  4.0000000000000004e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.235543  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3200  50S ribosomal protein L1  53.71 
 
 		 229 aa  251  9.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.935977 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>