More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3691 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3691  ribosomal protein L10  100 
 
 		 164 aa  328  1e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2724  50S ribosomal protein L10  53.75 
 
 		 166 aa  165  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000159716  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2410  50S ribosomal protein L10  53.75 
 
 		 166 aa  165  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000332682  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  50.31 
 
 		 166 aa  151  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  47.85 
 
 		 166 aa  150  7e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000179203  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  47.85 
 
 		 166 aa  150  7e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  46.54 
 
 		 166 aa  150  7e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  50.31 
 
 		 166 aa  150  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  47.24 
 
 		 166 aa  149  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  46.63 
 
 		 166 aa  147  7e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  50 
 
 		 176 aa  147  9e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  46.63 
 
 		 166 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  46.63 
 
 		 166 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0099  50S ribosomal protein L10  46.63 
 
 		 166 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0095  50S ribosomal protein L10  46.63 
 
 		 166 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.69083e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  46.63 
 
 		 166 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  46.63 
 
 		 166 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  46.63 
 
 		 166 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  46.63 
 
 		 166 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0180  50S ribosomal protein L10  46.63 
 
 		 166 aa  144  7.0000000000000006e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0693527  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  47.74 
 
 		 170 aa  141  4e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1387  50S ribosomal protein L10  50 
 
 		 171 aa  140  6e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000123079  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2722  50S ribosomal protein L10P  48.3 
 
 		 178 aa  140  9e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314918  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  45.34 
 
 		 174 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  47.97 
 
 		 174 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3453  50S ribosomal protein L10  45.81 
 
 		 174 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0925685  normal  0.446601 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  43.4 
 
 		 174 aa  136  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1529  ribosomal protein L10  46.62 
 
 		 183 aa  135  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000554953  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  49.25 
 
 		 175 aa  135  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  46.67 
 
 		 174 aa  134  7.000000000000001e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  45.33 
 
 		 172 aa  134  7.000000000000001e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3036  50S ribosomal protein L10  45.51 
 
 		 168 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0878547 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  42.31 
 
 		 174 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0567  50S ribosomal protein L10  44.97 
 
 		 167 aa  132  3e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00969269  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3316  50S ribosomal protein L10  44.65 
 
 		 168 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2969  50S ribosomal protein L10  44.65 
 
 		 168 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.45658 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1302  50S ribosomal protein L10  45.83 
 
 		 166 aa  131  5e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000076628  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  46 
 
 		 174 aa  130  6e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0445  50S ribosomal protein L10  43.95 
 
 		 166 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.470652  unclonable  0.000000241771 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0475  50S ribosomal protein L10  43.95 
 
 		 166 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2850  50S ribosomal protein L10  44.72 
 
 		 165 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.675463 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0313  50S ribosomal protein L10  45.06 
 
 		 166 aa  129  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000558823  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0478  50S ribosomal protein L10  43.95 
 
 		 195 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00597987  hitchhiker  0.00527924 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  41.06 
 
 		 172 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  46.67 
 
 		 174 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3191  50S ribosomal protein L10  42.14 
 
 		 173 aa  129  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579756  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3336  50S ribosomal protein L10  44.37 
 
 		 173 aa  128  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4758  50S ribosomal protein L10  42.68 
 
 		 166 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00494482  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0385  50S ribosomal protein L10  42.95 
 
 		 177 aa  128  4.0000000000000003e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0360  50S ribosomal protein L10  42.95 
 
 		 177 aa  128  4.0000000000000003e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0310  50S ribosomal protein L10  43.04 
 
 		 165 aa  127  7.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0746923  normal  0.0249908 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3918  50S ribosomal protein L10  43.95 
 
 		 166 aa  127  9.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3437  50S ribosomal protein L10  43.23 
 
 		 165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  41.89 
 
 		 172 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0828  50S ribosomal protein L10  43.95 
 
 		 166 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0279492  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2769  50S ribosomal protein L10  43.23 
 
 		 165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08740  50S ribosomal protein L10  43.95 
 
 		 166 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037754 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0338  50S ribosomal protein L10  43.23 
 
 		 165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.550948  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0317  50S ribosomal protein L10  43.23 
 
 		 165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00438278  normal  0.203557 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  40.67 
 
 		 174 aa  125  3e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  43.33 
 
 		 173 aa  125  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  43.33 
 
 		 173 aa  125  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1417  50S ribosomal protein L10  41.46 
 
 		 197 aa  125  3e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000013127  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1337  50S ribosomal protein L10  48.51 
 
 		 174 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.900212  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0617  ribosomal protein L10  42.68 
 
 		 166 aa  123  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.532211  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0271  50S ribosomal protein L10  45.33 
 
 		 178 aa  123  1e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00121092  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5088  50S ribosomal protein L10  42.95 
 
 		 166 aa  122  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000128873  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2344  ribosomal protein L10  39.22 
 
 		 173 aa  122  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.032292  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4557  50S ribosomal protein L10  42.04 
 
 		 166 aa  122  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.669843  decreased coverage  0.0090203 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2423  50S ribosomal protein L10  41.72 
 
 		 205 aa  121  5e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0857  50S ribosomal protein L10  43.33 
 
 		 177 aa  120  7e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259828  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0205  50S ribosomal protein L10  41.38 
 
 		 181 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000665859  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0586  50S ribosomal protein L10  43.23 
 
 		 177 aa  119  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0361  50S ribosomal protein L10  41.77 
 
 		 190 aa  120  9.999999999999999e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000502234  hitchhiker  0.0000804712 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06150  50S ribosomal protein L10  42.21 
 
 		 166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0040  50S ribosomal protein L10  41.72 
 
 		 179 aa  118  3e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0245031  hitchhiker  0.0000000000023806 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3654  50S ribosomal protein L10  46.67 
 
 		 167 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0512272  hitchhiker  0.000000643388 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0304  50S ribosomal protein L10  46.67 
 
 		 167 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.125975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0044  50S ribosomal protein L10  41.06 
 
 		 215 aa  118  3.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000127438  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3869  50S ribosomal protein L10  47.76 
 
 		 182 aa  118  3.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2038  50S ribosomal protein L10  42.95 
 
 		 175 aa  117  7e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0258299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0239  50S ribosomal protein L10  45.19 
 
 		 165 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0229066 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0266  50S ribosomal protein L10  45.19 
 
 		 165 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.646007  normal  0.635943 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3078  50S ribosomal protein L10  45.19 
 
 		 165 aa  117  9e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.892062  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2643  50S ribosomal protein L10  45.19 
 
 		 165 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1912  50S ribosomal protein L10  45.19 
 
 		 165 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000184172  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3788  50S ribosomal protein L10  45.19 
 
 		 165 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.166109  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3756  50S ribosomal protein L10  45.19 
 
 		 184 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0407684  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3467  50S ribosomal protein L10  45.19 
 
 		 184 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108818  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3818  50S ribosomal protein L10  45.19 
 
 		 184 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3180  50S ribosomal protein L10  44.12 
 
 		 140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000385503  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3642  50S ribosomal protein L10  41.94 
 
 		 183 aa  115  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.279713 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3594  50S ribosomal protein L10  43.87 
 
 		 178 aa  115  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.196569  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2262  50S ribosomal protein L10  43.59 
 
 		 174 aa  115  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168271  normal  0.476107 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4285  ribosomal protein L10  41.67 
 
 		 166 aa  114  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000716484  hitchhiker  0.000000472968 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0882  50S ribosomal protein L10  40.69 
 
 		 176 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.629984  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4444  50S ribosomal protein L10  41.29 
 
 		 176 aa  114  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.651473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0257  50S ribosomal protein L10  45.19 
 
 		 188 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0591157  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4533  50S ribosomal protein L10  42.95 
 
 		 168 aa  114  5e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3899  50S ribosomal protein L10  42.31 
 
 		 168 aa  113  8.999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>