More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3661 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3661  ribosomal protein S3  100 
 
 		 219 aa  448  1e-125  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178065  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0117  30S ribosomal protein S3  67.59 
 
 		 218 aa  309  2e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00121985  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0113  30S ribosomal protein S3  66.67 
 
 		 218 aa  307  9e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2909  SSU ribosomal protein S3P  65.02 
 
 		 226 aa  304  5.0000000000000004e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0764  ribosomal protein S3  67.94 
 
 		 222 aa  298  5e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000320467  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2454  30S ribosomal protein S3  62.56 
 
 		 219 aa  297  7e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2708  30S ribosomal protein S3  66.04 
 
 		 222 aa  297  8e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2393  30S ribosomal protein S3  66.04 
 
 		 222 aa  297  8e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1739  ribosomal protein S3  63.96 
 
 		 222 aa  293  1e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000032444  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0221  30S ribosomal protein S3  63.64 
 
 		 221 aa  291  5e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649554  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0110  30S ribosomal protein S3  64.65 
 
 		 219 aa  291  7e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000133483  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1568  ribosomal protein S3  64.06 
 
 		 238 aa  289  2e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000461215  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0116  30S ribosomal protein S3  65.24 
 
 		 219 aa  289  3e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000978645  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0116  30S ribosomal protein S3  65.24 
 
 		 219 aa  289  3e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000111227  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0112  30S ribosomal protein S3  65.24 
 
 		 219 aa  289  3e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.8436400000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0110  30S ribosomal protein S3  65.24 
 
 		 219 aa  289  3e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0116  30S ribosomal protein S3  65.24 
 
 		 219 aa  289  3e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000165133  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0147  30S ribosomal protein S3  65.24 
 
 		 219 aa  289  3e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000084584  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0137  30S ribosomal protein S3  65.24 
 
 		 219 aa  289  3e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000151619  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5189  30S ribosomal protein S3  65.24 
 
 		 219 aa  289  3e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000094199  unclonable  1.62141e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0128  30S ribosomal protein S3  65.24 
 
 		 219 aa  289  3e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.11451e-61 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1477  30S ribosomal protein S3  63.68 
 
 		 221 aa  288  5.0000000000000004e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000764619  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0111  30S ribosomal protein S3  63.72 
 
 		 219 aa  288  5.0000000000000004e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000062196  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0292  30S ribosomal protein S3  61.72 
 
 		 220 aa  285  4e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100891  normal  0.0448261 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0428  30S ribosomal protein S3  61.9 
 
 		 219 aa  285  5e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00750639  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1825  30S ribosomal protein S3  63.43 
 
 		 217 aa  284  8e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.652235  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2705  ribosomal protein S3  59.62 
 
 		 226 aa  282  3.0000000000000004e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105872  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2271  30S ribosomal protein S3  63.81 
 
 		 217 aa  282  4.0000000000000003e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000428524  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2312  30S ribosomal protein S3  63.81 
 
 		 217 aa  282  4.0000000000000003e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000168649  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1352  30S ribosomal protein S3  62.5 
 
 		 210 aa  280  1e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.112713  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0064  30S ribosomal protein S3  61.57 
 
 		 217 aa  280  2e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00697995  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0873  30S ribosomal protein S3  63.64 
 
 		 221 aa  278  3e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000095133  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1518  ribosomal protein S3  58.99 
 
 		 220 aa  278  4e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.337721  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0231  ribosomal protein S3  56.68 
 
 		 218 aa  277  1e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2851  30S ribosomal protein S3  61.06 
 
 		 211 aa  275  3e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.588721  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1901  30S ribosomal protein S3  60.65 
 
 		 217 aa  275  3e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.563087  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2396  30S ribosomal protein S3  62.62 
 
 		 217 aa  275  4e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0132783  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01230  ribosomal protein S3  61.24 
 
 		 214 aa  274  8e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.845852  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0632  30S ribosomal protein S3  60.58 
 
 		 211 aa  271  4.0000000000000004e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000111736  hitchhiker  0.00000000169292 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2327  30S ribosomal protein S3  59.62 
 
 		 227 aa  271  7e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000359117  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0686  30S ribosomal protein S3  59.62 
 
 		 210 aa  270  2e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.15256  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3322  30S ribosomal protein S3  60 
 
 		 211 aa  268  4e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000677184 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0939  30S ribosomal protein S3  60 
 
 		 211 aa  268  5e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0016445  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1073  30S ribosomal protein S3  59.52 
 
 		 210 aa  266  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000789266  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0200  SSU ribosomal protein S3P  57.21 
 
 		 229 aa  263  1e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0421793  normal  0.0820646 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0297  30S ribosomal protein S3  55.87 
 
 		 222 aa  263  1e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.5955900000000001e-28 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0714  ribosomal protein S3  57.89 
 
 		 216 aa  263  2e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.874756  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0707  30S ribosomal protein S3  57.97 
 
 		 210 aa  261  4.999999999999999e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000377493  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23410  SSU ribosomal protein S3P  58.17 
 
 		 244 aa  259  3e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000415625  hitchhiker  0.000000143523 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0568  30S ribosomal protein S3  55.5 
 
 		 278 aa  256  2e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1917  ribosomal protein S3  56.54 
 
 		 224 aa  256  2e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.652876 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2251  30S ribosomal protein S3  55.07 
 
 		 213 aa  256  2e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000614716  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1092  SSU ribosomal protein S3P  55.5 
 
 		 288 aa  255  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0581638 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2172  ribosomal protein S3  55.29 
 
 		 237 aa  255  4e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.686933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1962  ribosomal protein S3  56.05 
 
 		 237 aa  254  5e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.180974  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1346  ribosomal protein S3  55.77 
 
 		 395 aa  254  7e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1129  ribosomal protein S3  53.81 
 
 		 279 aa  254  7e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0202  SSU ribosomal protein S3P  56.05 
 
 		 223 aa  254  8e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0598468  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0085  30S ribosomal protein S3  55.07 
 
 		 213 aa  253  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0561951 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4315  ribosomal protein S3  52.8 
 
 		 272 aa  253  1.0000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1939  ribosomal protein S3  57.21 
 
 		 224 aa  253  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0694  ribosomal protein S3  54.5 
 
 		 282 aa  253  1.0000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2024  ribosomal protein S3  57.21 
 
 		 224 aa  253  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145772  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2059  30S ribosomal protein S3  54.59 
 
 		 213 aa  253  1.0000000000000001e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00063998  normal  0.0926898 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1759  30S ribosomal protein S3  55.56 
 
 		 212 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.341094  normal  0.399462 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1940  SSU ribosomal protein S3P  57.21 
 
 		 224 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1232  SSU ribosomal protein S3P  55.5 
 
 		 223 aa  253  2.0000000000000002e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855016 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0065  30S ribosomal protein S3  56.25 
 
 		 233 aa  252  3e-66  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00223028  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0312  30S ribosomal protein S3  52.17 
 
 		 341 aa  252  3e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243469 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3899  30S ribosomal protein S3  55.98 
 
 		 278 aa  251  6e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0666  30S ribosomal protein S3  56.04 
 
 		 213 aa  250  1e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00146093  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0292  30S ribosomal protein S3  59.43 
 
 		 241 aa  250  1e-65  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00457089  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2075  30S ribosomal protein S3  55.77 
 
 		 233 aa  250  1e-65  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000597186  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2640  30S ribosomal protein S3  53.66 
 
 		 270 aa  250  2e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.659159  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0090  30S ribosomal protein S3  55.45 
 
 		 231 aa  249  2e-65  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.157712  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0343  ribosomal protein S3  53.64 
 
 		 227 aa  249  2e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000438385  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1848  SSU ribosomal protein S3P  53.64 
 
 		 227 aa  249  2e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00165537  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0853  SSU ribosomal protein S3P  54.76 
 
 		 210 aa  249  2e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111374  hitchhiker  0.000095719 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1869  30S ribosomal protein S3  55.77 
 
 		 233 aa  249  3e-65  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.437759  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1698  30S ribosomal protein S3  55.77 
 
 		 233 aa  249  3e-65  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000141955  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6043  30S ribosomal protein S3  50.47 
 
 		 325 aa  249  3e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6608  ribosomal protein S3  51.85 
 
 		 275 aa  248  4e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0040  30S ribosomal protein S3  56.25 
 
 		 232 aa  248  4e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0666312  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1620  30S ribosomal protein S3  58.17 
 
 		 249 aa  248  5e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.446751  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5130  ribosomal protein S3  52.15 
 
 		 268 aa  248  6e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.805435 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5043  30S ribosomal protein S3  52.31 
 
 		 278 aa  247  8e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.084323  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09940  SSU ribosomal protein S3P  54.33 
 
 		 235 aa  248  8e-65  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.257564  hitchhiker  0.00000258289 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1027  30S ribosomal protein S3  55.29 
 
 		 232 aa  247  1e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000269281  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1771  30S ribosomal protein S3  55.29 
 
 		 232 aa  247  1e-64  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000585037  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1311  30S ribosomal protein S3  51.85 
 
 		 280 aa  247  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119681 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0588  30S ribosomal protein S3  50 
 
 		 315 aa  246  2e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3429  ribosomal protein S3  53.24 
 
 		 268 aa  246  2e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1046  30S ribosomal protein S3  51.85 
 
 		 287 aa  246  2e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1019  30S ribosomal protein S3  51.85 
 
 		 287 aa  246  2e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1561  ribosomal protein S3  53.85 
 
 		 233 aa  246  2e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.311089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1036  30S ribosomal protein S3  51.85 
 
 		 287 aa  246  2e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.261714  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3752  ribosomal protein S3  52.31 
 
 		 272 aa  246  3e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.40456  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0992  30S ribosomal protein S3  55.77 
 
 		 237 aa  246  3e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0174099 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10721  30S ribosomal protein S3  51.85 
 
 		 274 aa  246  3e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.680794  normal  0.235718 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4349  30S ribosomal protein S3  53.88 
 
 		 275 aa  246  3e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122787  normal  0.048354 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>