More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3660 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3660  50S ribosomal protein L16  100 
 
 		 145 aa  294  3e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000506256  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0429  50S ribosomal protein L16  80 
 
 		 145 aa  237  2.9999999999999997e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0009964  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0765  50S ribosomal protein L16  79.31 
 
 		 145 aa  232  2.0000000000000002e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000894235  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2910  50S ribosomal protein L16  77.24 
 
 		 145 aa  229  1e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1738  50S ribosomal protein L16  74.48 
 
 		 147 aa  219  9e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000521329  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0874  50S ribosomal protein L16  72.41 
 
 		 144 aa  217  5e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000946353  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2707  50S ribosomal protein L16  72.22 
 
 		 144 aa  215  2e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2392  50S ribosomal protein L16  72.22 
 
 		 144 aa  215  2e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2326  50S ribosomal protein L16  70.34 
 
 		 144 aa  214  2e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000195214  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2704  ribosomal protein L16  69.66 
 
 		 145 aa  212  1.9999999999999998e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.589348  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01240  50S ribosomal protein L16  70.92 
 
 		 144 aa  209  7.999999999999999e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.844455  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2453  50S ribosomal protein L16  71.63 
 
 		 144 aa  209  9e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.219362 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0201  50S ribosomal protein L16  70.21 
 
 		 144 aa  207  3e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.126239  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2171  ribosomal protein L16  75.37 
 
 		 140 aa  206  9e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.501834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1567  50S ribosomal protein L16  67.63 
 
 		 142 aa  204  4e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00199901  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1860  50S ribosomal protein L16  67.91 
 
 		 141 aa  201  4e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0761083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4019  50S ribosomal protein L16  65.96 
 
 		 141 aa  199  7e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261659  hitchhiker  0.00000510081 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1178  50S ribosomal protein L16  65.96 
 
 		 141 aa  199  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.371003  normal  0.169961 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0118  50S ribosomal protein L16  67.59 
 
 		 144 aa  199  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312557  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1844  50S ribosomal protein L16  70.5 
 
 		 139 aa  199  9.999999999999999e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.242343  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0232  50S ribosomal protein L16  69.23 
 
 		 143 aa  199  9.999999999999999e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0222  50S ribosomal protein L16  71.74 
 
 		 144 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000752115  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2225  50S ribosomal protein L16  68.15 
 
 		 142 aa  197  3.9999999999999996e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.877159  normal  0.84916 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1299  50S ribosomal protein L16  65.94 
 
 		 140 aa  197  6e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.210849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0111  50S ribosomal protein L16  67.59 
 
 		 144 aa  197  6e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000578104  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3710  50S ribosomal protein L16  68.38 
 
 		 139 aa  196  7e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0687  50S ribosomal protein L16  66.18 
 
 		 140 aa  196  7e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.129729  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2850  50S ribosomal protein L16  66.91 
 
 		 140 aa  196  7.999999999999999e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.867321  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0117  50S ribosomal protein L16  67.59 
 
 		 144 aa  196  9e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000580753  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0113  50S ribosomal protein L16  67.59 
 
 		 144 aa  196  9e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.719700000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0111  50S ribosomal protein L16  67.59 
 
 		 144 aa  196  9e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000723278  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0129  50S ribosomal protein L16  67.59 
 
 		 144 aa  196  9e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.87351e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0138  50S ribosomal protein L16  67.59 
 
 		 144 aa  196  9e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000009071  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0117  50S ribosomal protein L16  67.59 
 
 		 144 aa  196  9e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167847  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5188  50S ribosomal protein L16  67.59 
 
 		 144 aa  196  9e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000330931  unclonable  1.07151e-25 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23400  LSU ribosomal protein L16P  69.57 
 
 		 143 aa  196  9e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000203395  hitchhiker  0.00000101059 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0117  50S ribosomal protein L16  66.9 
 
 		 144 aa  195  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000995896  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0633  50S ribosomal protein L16  66.91 
 
 		 140 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000966771  hitchhiker  0.00000000446584 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0148  50S ribosomal protein L16  66.9 
 
 		 144 aa  195  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139217  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0112  50S ribosomal protein L16  66.9 
 
 		 144 aa  195  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000501448  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0114  50S ribosomal protein L16  66.67 
 
 		 141 aa  194  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0242  50S ribosomal protein L16  68.38 
 
 		 139 aa  194  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0245  50S ribosomal protein L16  68.38 
 
 		 139 aa  194  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1517  ribosomal protein L16  65.94 
 
 		 151 aa  194  4.0000000000000005e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.592014  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2289  50S ribosomal protein L16  68.35 
 
 		 139 aa  194  5.000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000386576  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2566  50S ribosomal protein L16  66.18 
 
 		 141 aa  193  7e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23091  50S ribosomal protein L16  63.95 
 
 		 158 aa  193  7e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0698  50S ribosomal protein L16  65.69 
 
 		 142 aa  193  8.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000251243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09930  LSU ribosomal protein L16P  69.4 
 
 		 140 aa  192  9e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.11543  hitchhiker  0.0000034816 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3017  50S ribosomal protein L16  64.71 
 
 		 151 aa  192  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00890597  hitchhiker  0.0081871 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1154  ribosomal protein L16  71.43 
 
 		 141 aa  192  2e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000356332  hitchhiker  0.0000299058 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2222  50S ribosomal protein L16  66.19 
 
 		 139 aa  192  2e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000157972  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2057  50S ribosomal protein L16  65.47 
 
 		 139 aa  191  3e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00129703  normal  0.24244 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2416  50S ribosomal protein L16  65.47 
 
 		 139 aa  191  3e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000559542  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1074  50S ribosomal protein L16  62.86 
 
 		 140 aa  190  4e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000319005  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3321  50S ribosomal protein L16  62.14 
 
 		 140 aa  191  4e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000147904 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0940  50S ribosomal protein L16  62.14 
 
 		 140 aa  191  4e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00197835  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0296  50S ribosomal protein L16  65.94 
 
 		 139 aa  190  5e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0293  50S ribosomal protein L16  67.88 
 
 		 143 aa  190  5e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00638417  normal  0.0397052 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1824  50S ribosomal protein L16  63.45 
 
 		 144 aa  190  6e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.418493  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2270  50S ribosomal protein L16  62.76 
 
 		 144 aa  189  8e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000763654  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2311  50S ribosomal protein L16  62.76 
 
 		 144 aa  189  8e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000620596  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3005  50S ribosomal protein L16  66.18 
 
 		 137 aa  189  8e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.840277  hitchhiker  0.00634453 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2900  ribosomal protein L16  66.42 
 
 		 141 aa  189  1e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2639  50S ribosomal protein L16  67.16 
 
 		 138 aa  187  4e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0634  ribosomal protein L16  65.25 
 
 		 139 aa  187  5e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.953159  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1353  50S ribosomal protein L16  63.57 
 
 		 140 aa  187  5.999999999999999e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0405  ribosomal protein L16  62.68 
 
 		 145 aa  186  9e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17090  50S ribosomal protein L16  65 
 
 		 138 aa  185  1e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00239118  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1962  50S ribosomal protein L16  61.9 
 
 		 158 aa  186  1e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1918  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 		 138 aa  186  1e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.573905 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29670  LSU ribosomal protein L16P  65 
 
 		 139 aa  185  1e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.810934  normal  0.371793 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5131  ribosomal protein L16  65.67 
 
 		 137 aa  185  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.77654 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17421  50S ribosomal protein L16  63.7 
 
 		 160 aa  184  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0849  ribosomal protein L16  64.23 
 
 		 144 aa  185  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17581  50S ribosomal protein L16  63.7 
 
 		 160 aa  185  2e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0188  50S ribosomal protein L16  64.49 
 
 		 139 aa  184  3e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000404592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17331  50S ribosomal protein L16  61.27 
 
 		 160 aa  184  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.613797  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1562  50S ribosomal protein L16  64.96 
 
 		 138 aa  184  3e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4922  50S ribosomal protein L16  60.56 
 
 		 145 aa  184  4e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.185448  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4500  ribosomal protein L16  64.18 
 
 		 138 aa  184  4e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23740  LSU ribosomal protein L16P  64.93 
 
 		 139 aa  184  4e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0335503  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0708  50S ribosomal protein L16  62.77 
 
 		 141 aa  183  6e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000940858  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0369  50S ribosomal protein L16  60.96 
 
 		 158 aa  183  6e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20800  LSU ribosomal protein L16P  62.86 
 
 		 139 aa  183  7e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2680  50S ribosomal protein L16  65 
 
 		 138 aa  183  9e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0065  50S ribosomal protein L16  69.4 
 
 		 137 aa  182  9e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00303691  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16711  50S ribosomal protein L16  61.43 
 
 		 179 aa  182  9e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1093  50S ribosomal protein L16  64.93 
 
 		 139 aa  182  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0519804 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1643  50S ribosomal protein L16  62.96 
 
 		 160 aa  182  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1233  50S ribosomal protein L16  61.94 
 
 		 139 aa  182  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000804114 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2968  50S ribosomal protein L16  64.29 
 
 		 138 aa  182  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.306381  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0722  ribosomal protein L16  66.67 
 
 		 144 aa  182  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0569  50S ribosomal protein L16  64.93 
 
 		 139 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0594  ribosomal protein L16  62.41 
 
 		 139 aa  181  2.0000000000000003e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.158135  normal  0.764393 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2612  50S ribosomal protein L16  64.18 
 
 		 141 aa  182  2.0000000000000003e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000705593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0589  50S ribosomal protein L16  63.12 
 
 		 138 aa  181  3e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6042  50S ribosomal protein L16  62.41 
 
 		 138 aa  180  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.883127  normal  0.124755 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0313  50S ribosomal protein L16  65.67 
 
 		 139 aa  180  5.0000000000000004e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183052 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3751  ribosomal protein L16  63.24 
 
 		 138 aa  180  6e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.596484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>