More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3650 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3650  ribosomal protein S5  100 
 
 		 168 aa  330  4e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000874802  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2920  30S ribosomal protein S5  66.47 
 
 		 166 aa  210  9e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000379873  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0775  30S ribosomal protein S5  64.29 
 
 		 167 aa  202  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000409593  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0232  30S ribosomal protein S5  63.58 
 
 		 166 aa  202  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010623  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2694  ribosomal protein S5  62.35 
 
 		 164 aa  200  8e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2697  30S ribosomal protein S5  61.73 
 
 		 165 aa  195  3e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2382  30S ribosomal protein S5  61.73 
 
 		 165 aa  195  3e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0303  30S ribosomal protein S5  60.49 
 
 		 166 aa  193  8.000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000149284  normal  0.159424 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1728  30S ribosomal protein S5  58.68 
 
 		 168 aa  192  2e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000123427  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1363  30S ribosomal protein S5  58.86 
 
 		 162 aa  191  5e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00227785  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01340  ribosomal protein S5  61.73 
 
 		 166 aa  190  6e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0211  SSU ribosomal protein S5P  61.08 
 
 		 168 aa  189  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.102513  normal  0.321891 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0121  30S ribosomal protein S5  59.88 
 
 		 166 aa  188  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1507  ribosomal protein S5  57.58 
 
 		 173 aa  187  5e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2443  30S ribosomal protein S5  61.11 
 
 		 166 aa  187  5e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.995236 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0124  30S ribosomal protein S5  58.68 
 
 		 166 aa  186  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0128  30S ribosomal protein S5  58.08 
 
 		 166 aa  186  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0884  30S ribosomal protein S5  60.12 
 
 		 167 aa  185  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.560186  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5178  30S ribosomal protein S5  58.64 
 
 		 166 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000595354  unclonable  1.58877e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0127  30S ribosomal protein S5  58.64 
 
 		 166 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181316  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0127  30S ribosomal protein S5  58.64 
 
 		 166 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000033601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0123  30S ribosomal protein S5  58.64 
 
 		 166 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000320585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0121  30S ribosomal protein S5  58.64 
 
 		 166 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828927  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0139  30S ribosomal protein S5  58.64 
 
 		 166 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.93712e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0127  30S ribosomal protein S5  58.64 
 
 		 166 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0304335  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0148  30S ribosomal protein S5  58.64 
 
 		 166 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000129671  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0158  30S ribosomal protein S5  58.64 
 
 		 166 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000826666  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0439  30S ribosomal protein S5  58.02 
 
 		 166 aa  181  4.0000000000000006e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0122  30S ribosomal protein S5  57.49 
 
 		 166 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00008348  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2840  30S ribosomal protein S5  57.59 
 
 		 162 aa  181  5.0000000000000004e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.122031  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0242  ribosomal protein S5  58.02 
 
 		 168 aa  181  5.0000000000000004e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.529563  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0697  30S ribosomal protein S5  56.96 
 
 		 162 aa  181  6e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0643  30S ribosomal protein S5  56.33 
 
 		 162 aa  179  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000275279  hitchhiker  0.000000114757 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1572  ribosomal protein S5  56.17 
 
 		 166 aa  179  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0532593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3988  ribosomal protein S5  58.33 
 
 		 166 aa  179  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0501123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09830  SSU ribosomal protein S5P  57.05 
 
 		 173 aa  179  2e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0111363  hitchhiker  0.0000146915 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2316  ribosomal protein S5  58.97 
 
 		 167 aa  179  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00562795  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1466  30S ribosomal protein S5  54.6 
 
 		 169 aa  177  9e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130874  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0725  ribosomal protein S5  58.17 
 
 		 165 aa  175  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.104359  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1557  ribosomal protein S5  56.52 
 
 		 169 aa  175  3e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000355903  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1083  30S ribosomal protein S5  56.96 
 
 		 162 aa  175  3e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.237908  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3311  30S ribosomal protein S5  56.33 
 
 		 162 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000304124 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1929  30S ribosomal protein S5  55.9 
 
 		 169 aa  172  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2035  30S ribosomal protein S5  55.9 
 
 		 169 aa  172  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34488  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1853  ribosomal protein S5  54.84 
 
 		 172 aa  172  1.9999999999999998e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1950  30S ribosomal protein S5  55.9 
 
 		 169 aa  172  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0950  30S ribosomal protein S5  56.33 
 
 		 162 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00386761  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2161  ribosomal protein S5  53.42 
 
 		 175 aa  172  1.9999999999999998e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0929942  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23300  SSU ribosomal protein S5P  55.13 
 
 		 179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0615843  hitchhiker  0.0000066757 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0718  30S ribosomal protein S5  56.52 
 
 		 163 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.160468  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1928  30S ribosomal protein S5  53.33 
 
 		 168 aa  171  5e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.69161 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1814  30S ribosomal protein S5  60.26 
 
 		 166 aa  168  3e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2260  30S ribosomal protein S5  59.6 
 
 		 166 aa  168  4e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00378829  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2301  30S ribosomal protein S5  59.6 
 
 		 166 aa  168  4e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.186174  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4931  ribosomal protein S5  53.12 
 
 		 182 aa  164  4e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.023543  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0732  ribosomal protein S5  50.93 
 
 		 190 aa  162  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1243  30S ribosomal protein S5  52.15 
 
 		 169 aa  160  5.0000000000000005e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00969773  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0243  30S ribosomal protein S5  50.31 
 
 		 203 aa  159  1e-38  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1144  ribosomal protein S5  50 
 
 		 173 aa  160  1e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000788101  normal  0.0120151 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl140  30S ribosomal protein S5  55.03 
 
 		 206 aa  158  3e-38  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4781  30S ribosomal protein S5  52.29 
 
 		 185 aa  157  5e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694187  hitchhiker  0.00000059117 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0619  30S ribosomal protein S5  50.62 
 
 		 172 aa  157  6e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.797529 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1357  ribosomal protein S5  54.32 
 
 		 197 aa  157  7e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0611  SSU ribosomal protein S5P  53.55 
 
 		 165 aa  157  7e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0764806  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1202  30S ribosomal protein S5  54.25 
 
 		 208 aa  156  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.0445875 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1778  30S ribosomal protein S5  51.28 
 
 		 201 aa  156  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0732859  normal  0.169541 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0323  SSU ribosomal protein S5P  52.94 
 
 		 199 aa  156  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179129 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1164  30S ribosomal protein S5  50.92 
 
 		 174 aa  156  2e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00523189  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0271  30S ribosomal protein S5  49.02 
 
 		 187 aa  155  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0228264  normal  0.455231 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3002  30S ribosomal protein S5  51.61 
 
 		 172 aa  155  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.214721  normal  0.0562945 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1929  30S ribosomal protein S5  52.26 
 
 		 189 aa  155  3e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2406  30S ribosomal protein S5  51.27 
 
 		 172 aa  155  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0326698  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0579  30S ribosomal protein S5  52.94 
 
 		 210 aa  155  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.898965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2212  30S ribosomal protein S5  51.9 
 
 		 172 aa  155  4e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000015537  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3888  SSU ribosomal protein S5P  53.59 
 
 		 205 aa  155  4e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.361  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0075  30S ribosomal protein S5  59.49 
 
 		 164 aa  154  5.0000000000000005e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.774512  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0051  30S ribosomal protein S5  58.57 
 
 		 147 aa  154  5.0000000000000005e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.546505  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1748  30S ribosomal protein S5  50 
 
 		 163 aa  154  6e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.749725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0306  30S ribosomal protein S5  51.27 
 
 		 172 aa  154  7e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0963107  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0198  30S ribosomal protein S5  50.63 
 
 		 171 aa  154  7e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.136971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2048  30S ribosomal protein S5  51.28 
 
 		 163 aa  154  7e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00145313  normal  0.0102029 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2753  ribosomal protein S5  50.64 
 
 		 186 aa  153  8e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.3085  normal  0.221046 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf423  ribosomal protein S5  50.64 
 
 		 234 aa  154  8e-37  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1973  30S ribosomal protein S5  50.64 
 
 		 186 aa  153  9e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00407796  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3978  ribosomal protein S5  48.5 
 
 		 168 aa  153  1e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2201  30S ribosomal protein S5  51.28 
 
 		 195 aa  153  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0854513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2138  SSU ribosomal protein S5P  52.29 
 
 		 200 aa  153  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0665154  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05805  30S ribosomal protein S5  48.47 
 
 		 174 aa  153  1e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1724  30S ribosomal protein S5  51.92 
 
 		 243 aa  153  1e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00276041  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2047  30S ribosomal protein S5  52.98 
 
 		 172 aa  152  2e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0164309  normal  0.432227 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4304  ribosomal protein S5  52.94 
 
 		 205 aa  152  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1216  30S ribosomal protein S5  50.98 
 
 		 186 aa  152  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0302  30S ribosomal protein S5  47.44 
 
 		 191 aa  152  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.440819 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3280  30S ribosomal protein S5  50.97 
 
 		 172 aa  152  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00328937  hitchhiker  0.0000684502 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2933  30S ribosomal protein S5  50.97 
 
 		 172 aa  152  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000097006 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1890  30S ribosomal protein S5  58.86 
 
 		 164 aa  152  2e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2959  30S ribosomal protein S5  49.69 
 
 		 236 aa  152  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0103501  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1632  ribosomal protein S5  51.85 
 
 		 172 aa  152  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0096  30S ribosomal protein S5  46.25 
 
 		 163 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0990487 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0212  30S ribosomal protein S5  55.41 
 
 		 168 aa  151  2.9999999999999998e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000316  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>