More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3646 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3646  adenylate kinase  100 
 
 
217 aa  445  1.0000000000000001e-124  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000547337  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1725  adenylate kinase  61.5 
 
 
215 aa  286  1e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000477664  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2693  adenylate kinase  61.5 
 
 
216 aa  276  1e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2378  adenylate kinase  61.5 
 
 
216 aa  276  1e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0779  adenylate kinase  61.03 
 
 
214 aa  267  8e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000192318  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2924  adenylate kinase  59.07 
 
 
217 aa  266  1e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1237  adenylate kinase  55.14 
 
 
214 aa  254  5e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000920741  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2256  adenylate kinase  56.6 
 
 
215 aa  254  6e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0268599  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2297  adenylate kinase  56.6 
 
 
215 aa  254  6e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0443  adenylate kinase  55.5 
 
 
217 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0132  adenylate kinase  54.93 
 
 
216 aa  251  5.000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0583  adenylate kinase  53.27 
 
 
217 aa  251  7e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0887  adenylate kinase  54.46 
 
 
217 aa  250  1e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.037956  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1810  adenylate kinase  54.72 
 
 
215 aa  250  1e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0128  adenylate kinase  53 
 
 
217 aa  250  1e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1504  adenylate kinases  55.14 
 
 
215 aa  250  1e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1163  adenylate kinase  56.35 
 
 
211 aa  250  1e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0529729  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0086  adenylate kinase  55.56 
 
 
215 aa  249  2e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00306231  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0125  adenylate kinase  51.85 
 
 
216 aa  245  4e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000166818  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1718  adenylate kinase  53.11 
 
 
213 aa  244  4.9999999999999997e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1338  adenylate kinase  53.59 
 
 
213 aa  244  8e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.389991  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0152  adenylate kinase  51.39 
 
 
216 aa  244  9e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00506864  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0126  adenylate kinase  51.39 
 
 
216 aa  243  9.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000253561  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0131  adenylate kinase  50.93 
 
 
216 aa  242  3e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000890423  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0162  adenylate kinase  50.93 
 
 
216 aa  242  3e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3307  adenylate kinase  52.63 
 
 
214 aa  242  3e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1111  adenylate kinase  52.8 
 
 
214 aa  241  5e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000158184  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5174  adenylate kinase  50.93 
 
 
216 aa  241  6e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000620291  unclonable  1.1738e-25 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2439  adenylate kinase  51.61 
 
 
217 aa  240  1e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2312  adenylate kinase  51.44 
 
 
215 aa  239  2e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00140159  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0131  adenylate kinase  50.46 
 
 
216 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000156427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0127  adenylate kinase  50.46 
 
 
216 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000429626  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0125  adenylate kinase  50.46 
 
 
216 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0141617  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0131  adenylate kinase  50.46 
 
 
216 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000118062  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0025  adenylate kinase  52.36 
 
 
215 aa  238  2.9999999999999997e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000610793  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0144  adenylate kinase  50.46 
 
 
216 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.24496e-61 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1001  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  51.42 
 
 
215 aa  238  5.999999999999999e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000583079  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0954  adenylate kinase  54.31 
 
 
214 aa  237  8e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.338741  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1576  adenylate kinases  52.58 
 
 
213 aa  235  3e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00457177  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1753  adenylate kinase  51.17 
 
 
213 aa  233  2.0000000000000002e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000121762  normal  0.119807 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0701  adenylate kinase  55.05 
 
 
220 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0297411  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01370  Adenylate kinase  52.11 
 
 
216 aa  232  3e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000615524  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6028  adenylate kinase  54.04 
 
 
217 aa  231  8.000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.16698 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004136  adenylate kinase  56.81 
 
 
214 aa  230  1e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1462  adenylate kinase  51.64 
 
 
219 aa  230  1e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000718997  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1207  adenylate kinase  53.54 
 
 
217 aa  230  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00730136 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3035  adenylate kinase  53.21 
 
 
214 aa  228  4e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0722  adenylate kinase  50.7 
 
 
216 aa  228  5e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.940289  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01328  adenylate kinase  56.34 
 
 
214 aa  228  5e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0603  adenylate kinase  54.04 
 
 
217 aa  228  5e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1024  adenylate kinase  53.21 
 
 
214 aa  228  8e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00425  adenylate kinase  54.59 
 
 
214 aa  226  1e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3136  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  54.59 
 
 
214 aa  226  1e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.335837  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3142  adenylate kinase  54.59 
 
 
214 aa  226  1e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.207455  normal  0.0239561 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1117  adenylate kinase  52.58 
 
 
218 aa  227  1e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.018146  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0406  adenylate kinase  54.59 
 
 
214 aa  226  1e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.395771  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1107  adenylate kinase  53.92 
 
 
216 aa  226  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.211555 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0513  adenylate kinase  54.59 
 
 
214 aa  226  1e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.18608  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0518  adenylate kinase  54.59 
 
 
214 aa  226  1e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0222194  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0566  adenylate kinase  54.59 
 
 
234 aa  227  1e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0567733  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0551  adenylate kinase  54.59 
 
 
214 aa  226  1e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0980412  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1139  adenylate kinase  53.21 
 
 
214 aa  226  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.498003  unclonable  0.0000000226015 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00430  hypothetical protein  54.59 
 
 
214 aa  226  1e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3194  adenylate kinase  53.21 
 
 
214 aa  226  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.804867  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3054  adenylate kinase  53.21 
 
 
214 aa  226  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3205  adenylate kinase  58.06 
 
 
217 aa  226  2e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.129481  normal  0.282312 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2894  adenylate kinase  53.21 
 
 
214 aa  226  2e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.290073  normal  0.0817579 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4294  adenylate kinase  52.53 
 
 
217 aa  226  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487166 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0167  adenylate kinases  49.3 
 
 
228 aa  226  2e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0999685  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1164  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  48.15 
 
 
226 aa  225  4e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000123796  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2690  adenylate kinase  50.23 
 
 
216 aa  225  5.0000000000000005e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0131862  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0215  Adenylate kinase  49.76 
 
 
214 aa  225  5.0000000000000005e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1553  adenylate kinase  51.38 
 
 
218 aa  224  5.0000000000000005e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.216762  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1367  adenylate kinase  52.36 
 
 
214 aa  225  5.0000000000000005e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00134255  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0507  adenylate kinase  55.4 
 
 
214 aa  224  6e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1080  adenylate kinase  53.67 
 
 
214 aa  224  6e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0448433  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0327  adenylate kinase  48.58 
 
 
217 aa  224  6e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000417947 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0954  adenylate kinase  53.67 
 
 
214 aa  224  7e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01105  adenylate kinase  53.21 
 
 
214 aa  224  7e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.474153  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1361  adenylate kinase  47.44 
 
 
224 aa  223  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2153  adenylate kinase  57.53 
 
 
218 aa  223  1e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2836  adenylate kinase  50 
 
 
217 aa  223  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3902  adenylate kinase  51.52 
 
 
217 aa  223  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1140  adenylate kinase  52.36 
 
 
208 aa  223  2e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000592914  normal  0.025222 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1504  adenylate kinase  60.22 
 
 
217 aa  222  3e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.179397 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3231  adenylate kinase  52.75 
 
 
214 aa  222  3e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.103733  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0815  adenylate kinase  55.05 
 
 
215 aa  222  4e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0648  adenylate kinase  52.29 
 
 
214 aa  221  4.9999999999999996e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0373092  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3003  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  46.92 
 
 
222 aa  221  4.9999999999999996e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.192004  hitchhiker  0.00720085 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4005  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  48.15 
 
 
226 aa  221  6e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000000986709  hitchhiker  0.0000175975 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2533  adenylate kinase  58.2 
 
 
222 aa  221  8e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.154116 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0593  adenylate kinase  52.75 
 
 
214 aa  221  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0533  adenylate kinase  52.75 
 
 
214 aa  221  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0534  adenylate kinase  52.75 
 
 
214 aa  221  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0550  adenylate kinase  52.75 
 
 
214 aa  221  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.186562  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0539  adenylate kinase  52.75 
 
 
214 aa  221  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.263643  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1430  adenylate kinase  51.83 
 
 
214 aa  221  9e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000051006  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1540  adenylate kinase  52.07 
 
 
214 aa  221  9e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0198359  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1528  adenylate kinase  52.07 
 
 
227 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000135558  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1315  adenylate kinase  54.55 
 
 
214 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0119239  normal  0.109595 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>