104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3618 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3618  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 508 aa  1067    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000797588  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1257  glycoside hydrolase family 43  41.1 
 
 		 500 aa  370  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3875  glycoside hydrolase family protein  39.88 
 
 		 518 aa  368  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1420  glycoside hydrolase family 43  37.77 
 
 		 530 aa  348  2e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394008  normal  0.931127 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2114  glycoside hydrolase family 43  37.04 
 
 		 518 aa  320  3.9999999999999996e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.554254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  35.6 
 
 		 1585 aa  305  2.0000000000000002e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  51.07 
 
 		 1338 aa  291  1e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1251  glycoside hydrolase family protein  32.46 
 
 		 665 aa  241  2e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07275  xylosidase/glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00930)  32.12 
 
 		 503 aa  237  4e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000188631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  31.2 
 
 		 746 aa  226  8e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  30.16 
 
 		 691 aa  220  5e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3302  glycoside hydrolase family 43  30.43 
 
 		 532 aa  219  8.999999999999998e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00567592  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3237  glycoside hydrolase family protein  31.35 
 
 		 1195 aa  195  2e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414155 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2413  glycoside hydrolase family protein  29.92 
 
 		 521 aa  179  7e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.333908  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3718  glycoside hydrolase family protein  26.78 
 
 		 504 aa  157  4e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.456589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1661  endo-1,4-beta-xylanase/Beta-xylosidase  32.42 
 
 		 901 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4249  glycoside hydrolase family protein  27.85 
 
 		 532 aa  144  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2632  glycoside hydrolase family protein  27.65 
 
 		 543 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0211688  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0700  glycoside hydrolase family 43  29.65 
 
 		 522 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0935  glycoside hydrolase family 43  29.46 
 
 		 522 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3438  glycoside hydrolase family 43  27.45 
 
 		 519 aa  128  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990127  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29240  beta-xylosidase  27.87 
 
 		 527 aa  127  7e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  26.2 
 
 		 536 aa  124  6e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1150  glycoside hydrolase family 43  26.89 
 
 		 560 aa  123  9e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3351  glycoside hydrolase family 43  28.74 
 
 		 522 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0501  glycoside hydrolase family 43  27.64 
 
 		 525 aa  122  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4289  glycoside hydrolase family protein  25.45 
 
 		 572 aa  120  6e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.786059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1500  glycoside hydrolase family 43  27.81 
 
 		 551 aa  116  7.999999999999999e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3048  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.77 
 
 		 515 aa  114  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0608814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3011  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.95 
 
 		 538 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1655  translation initiation factor IF-1  25.14 
 
 		 566 aa  110  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0976225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3228  glycoside hydrolase family protein  24.2 
 
 		 563 aa  111  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00674596  normal  0.0120766 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0598  Alpha-L-arabinofuranosidase  23.92 
 
 		 577 aa  109  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2518  glycoside hydrolase family protein  26.08 
 
 		 516 aa  109  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03855  xylosidase; arabinosidase  24.46 
 
 		 556 aa  105  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  26.8 
 
 		 562 aa  105  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  26.03 
 
 		 512 aa  99.8  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1143  Alpha-L-arabinofuranosidase  25.13 
 
 		 523 aa  98.6  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0842  Alpha-L-arabinofuranosidase  23.01 
 
 		 546 aa  98.2  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.122484  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2318  alpha-N-arabinofuranosidase  24.27 
 
 		 512 aa  96.3  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0875  glycoside hydrolase family protein  25.6 
 
 		 636 aa  93.2  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000412559  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20520  beta-xylosidase  26.06 
 
 		 542 aa  93.2  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129044  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1423  Xylan 1,4-beta-xylosidase  27.36 
 
 		 558 aa  93.2  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.423704 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3569  glycoside hydrolase family 43  27.09 
 
 		 484 aa  89.4  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0058203  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2996  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.59 
 
 		 559 aa  88.2  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1878  beta-xylosidase  29.15 
 
 		 539 aa  87.8  4e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4322  glycoside hydrolase family protein  22.41 
 
 		 581 aa  86.7  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0289  xylan 1,4-beta-xylosidase  23.28 
 
 		 532 aa  85.9  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000021727  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3398  glycoside hydrolase family protein  28.95 
 
 		 514 aa  81.3  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740676  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0430  glycoside hydrolase family 43  28.5 
 
 		 497 aa  80.9  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.710686 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2532  glycoside hydrolase family 43  24.49 
 
 		 586 aa  80.5  0.00000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3880  glycoside hydrolase family protein  22.68 
 
 		 571 aa  79.7  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1400  glycoside hydrolase family 43  22.74 
 
 		 517 aa  79.7  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.587173  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1616  alpha-L-arabinofuranosidase  22.39 
 
 		 550 aa  77.4  0.0000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2028  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 		 498 aa  77.4  0.0000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2459  Xylan 1,4-beta-xylosidase  24.52 
 
 		 488 aa  77  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  29.23 
 
 		 1474 aa  76.3  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3599  glycoside hydrolase family 43  24.42 
 
 		 497 aa  76.6  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2108  glycoside hydrolase family 43  26.89 
 
 		 650 aa  74.7  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000141623  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3334  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.59 
 
 		 536 aa  73.6  0.000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.783434  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3545  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.15 
 
 		 547 aa  72.8  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0270111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4681  glycoside hydrolase family protein  20.94 
 
 		 492 aa  72.4  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.026787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0431  glycoside hydrolase family protein  25.89 
 
 		 451 aa  71.2  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2409  hypothetical protein  25 
 
 		 541 aa  71.2  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21180  beta-xylosidase  25.42 
 
 		 526 aa  70.1  0.00000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.166078 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0457  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.18 
 
 		 539 aa  69.3  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0354643 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0936  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.98 
 
 		 546 aa  69.3  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.789253 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07864  conserved hypothetical protein  22.86 
 
 		 540 aa  69.3  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0157749  normal  0.535242 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2699  glycoside hydrolase family 43  20.6 
 
 		 496 aa  69.3  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.276179  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1291  Beta-xylosidase  26.21 
 
 		 553 aa  67.8  0.0000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08477  xylosidase : arabinofuranosidase (AFU_orthologue; AFUA_2G13190)  25.16 
 
 		 546 aa  66.2  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  28.99 
 
 		 524 aa  63.9  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3622  Xylan 1,4-beta-xylosidase  23.53 
 
 		 540 aa  63.9  0.000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573352  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06751  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06110)  37.36 
 
 		 591 aa  63.5  0.000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.326162 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1710  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.56 
 
 		 541 aa  62.4  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.783601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2504  Xylan 1,4-beta-xylosidase  29.93 
 
 		 558 aa  62  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3811  glycoside hydrolase family 43  23.1 
 
 		 535 aa  60.1  0.00000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2329  Xylan 1,4-beta-xylosidase  26.61 
 
 		 537 aa  59.7  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  25 
 
 		 522 aa  59.3  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0848  Beta-xylosidase  22.87 
 
 		 552 aa  58.5  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.168219  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2090  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.15 
 
 		 537 aa  58.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00759162  normal  0.572245 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1068  glycoside hydrolase family 43  26.6 
 
 		 797 aa  58.5  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000256501  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  32.56 
 
 		 472 aa  57.4  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  22.08 
 
 		 501 aa  55.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4021  glycoside hydrolase family protein  29.2 
 
 		 537 aa  54.7  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1435  glycoside hydrolase family 43  21.4 
 
 		 545 aa  54.3  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3522  glycoside hydrolase family protein  22.68 
 
 		 534 aa  53.1  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.653851  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  30 
 
 		 495 aa  51.2  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0753  glycoside hydrolase family protein  24.14 
 
 		 465 aa  50.4  0.00007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  27.14 
 
 		 306 aa  50.4  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3109  glycoside hydrolase family protein  23.81 
 
 		 348 aa  50.1  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158232 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3042  twin-arginine translocation pathway signal  28.18 
 
 		 537 aa  49.7  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.351967  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  26.21 
 
 		 472 aa  49.7  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  24.76 
 
 		 699 aa  49.3  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1302  putative beta-xylosidase  27.11 
 
 		 713 aa  49.3  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2914  glycoside hydrolase family protein  22.22 
 
 		 547 aa  48.5  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0745  glycoside hydrolase family 43  26.26 
 
 		 327 aa  48.5  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.465475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  25.57 
 
 		 345 aa  48.1  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  26.6 
 
 		 315 aa  47  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2529  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.95 
 
 		 355 aa  46.6  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0997912 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>