136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3616 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_2328  Radical SAM domain protein  61.58 
 
 		 666 aa  873    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.80431 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1407  hypothetical protein  57.64 
 
 		 662 aa  787    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00374356  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1216  hypothetical protein  58.14 
 
 		 662 aa  788    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.364904  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11120  Fe-S oxidoreductase  66.33 
 
 		 718 aa  879    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.390145  normal  0.0549005 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1094  hypothetical protein  57.72 
 
 		 639 aa  799    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0145194  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3126  hypothetical protein  61.81 
 
 		 642 aa  815    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0311249  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0603  hypothetical protein  55.59 
 
 		 683 aa  794    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3616  hypothetical protein  100 
 
 		 685 aa  1429    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2132  hypothetical protein  63.48 
 
 		 620 aa  829    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00115691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1776  hypothetical protein  49.5 
 
 		 622 aa  606  9.999999999999999e-173  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1858  radical SAM domain-containing protein  49.58 
 
 		 600 aa  599  1e-170  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2444  radical SAM domain-containing protein  47.5 
 
 		 640 aa  597  1e-169  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1409  Radical SAM domain protein  49.3 
 
 		 614 aa  594  1e-168  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1972  Radical SAM domain protein  47.45 
 
 		 621 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.270598  normal  0.360161 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1538  radical SAM domain-containing protein  48.84 
 
 		 598 aa  579  1e-164  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.415289  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1897  Fe-S oxidoreductase  44.6 
 
 		 625 aa  558  1e-158  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000117655  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0609  radical SAM family protein  45.86 
 
 		 603 aa  552  1e-156  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00147953  hitchhiker  0.00191958 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3187  Radical SAM domain protein  46.31 
 
 		 607 aa  552  1e-156  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00436822  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3346  Radical SAM domain protein  45.94 
 
 		 598 aa  547  1e-154  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0576598 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0556  radical SAM domain-containing protein  41.74 
 
 		 623 aa  547  1e-154  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.837617  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0915  Radical SAM domain protein  45.09 
 
 		 599 aa  546  1e-154  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1632  extracellular solute-binding protein  47.29 
 
 		 612 aa  545  1e-154  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1052  radical SAM domain-containing protein  45.58 
 
 		 605 aa  548  1e-154  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.173598  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0582  radical SAM domain-containing protein  47.2 
 
 		 567 aa  532  1e-149  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0596  radical SAM domain-containing protein  47.2 
 
 		 567 aa  532  1e-149  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.578273  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2873  radical SAM domain-containing protein  44.86 
 
 		 605 aa  522  1e-147  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1109  Radical SAM domain protein  46 
 
 		 571 aa  525  1e-147  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.890323  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1417  Fe-S oxidoreductase, radical SAM domain protein  44.76 
 
 		 583 aa  522  1e-147  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0066  radical SAM family protein  44.05 
 
 		 648 aa  519  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2297  Elongator protein 3/MiaB/NifB  46.05 
 
 		 620 aa  520  1e-146  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0942  radical SAM domain-containing protein  43.54 
 
 		 679 aa  521  1e-146  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6215  radical SAM domain-containing protein  43.01 
 
 		 679 aa  521  1e-146  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.310596 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7218  hypothetical protein  42.39 
 
 		 674 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.466758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4193  Radical SAM domain protein  41.59 
 
 		 678 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0746  Radical SAM domain protein  42.39 
 
 		 677 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0293  hypothetical protein  40.87 
 
 		 710 aa  513  1e-144  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0072  Radical SAM domain protein  43.88 
 
 		 648 aa  514  1e-144  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.290916  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5075  Radical SAM domain protein  43.37 
 
 		 688 aa  512  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.369209 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1103  radical SAM domain-containing protein  43.07 
 
 		 673 aa  514  1e-144  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.204136  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0652  hypothetical protein  39.77 
 
 		 763 aa  513  1e-144  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000231874 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0689  radical SAM family protein  41.11 
 
 		 671 aa  511  1e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0281  Radical SAM domain protein  42.51 
 
 		 589 aa  509  1e-143  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0856  hypothetical protein  37.45 
 
 		 790 aa  512  1e-143  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.109884  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1314  hypothetical protein  37.86 
 
 		 789 aa  510  1e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4610  radical SAM domain-containing protein  43.37 
 
 		 688 aa  511  1e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0159872 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2003  radical SAM family protein  41.92 
 
 		 707 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0068  radical SAM domain-containing protein  42.98 
 
 		 658 aa  507  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.514908  normal  0.0285773 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0084  Radical SAM domain protein  43.88 
 
 		 648 aa  507  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.028481  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02888  hypothetical protein  38.3 
 
 		 739 aa  503  1e-141  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0262  radical SAM domain-containing protein  44.48 
 
 		 568 aa  504  1e-141  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.282617  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02838  hypothetical protein  38.3 
 
 		 739 aa  503  1e-141  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0684  Radical SAM domain protein  38.3 
 
 		 739 aa  501  1e-140  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1403  Radical SAM domain protein  41.24 
 
 		 630 aa  499  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.59751 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4327  hypothetical protein  38.3 
 
 		 739 aa  500  1e-140  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3352  hypothetical protein  40.74 
 
 		 723 aa  501  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3349  hypothetical protein  40.74 
 
 		 723 aa  501  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3519  hypothetical protein  40.74 
 
 		 723 aa  501  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.115115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3424  hypothetical protein  38.62 
 
 		 724 aa  501  1e-140  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07700  hypothetical protein  39.24 
 
 		 757 aa  501  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.568115  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3194  hypothetical protein  38.3 
 
 		 739 aa  501  1e-140  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3484  hypothetical protein  38.3 
 
 		 739 aa  501  1e-140  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4234  hypothetical protein  39.97 
 
 		 721 aa  501  1e-140  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.577109 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0681  hypothetical protein  38.3 
 
 		 739 aa  501  1e-140  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3300  hypothetical protein  38.3 
 
 		 739 aa  501  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0672097 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3451  hypothetical protein  38.3 
 
 		 739 aa  500  1e-140  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3424  hypothetical protein  40.74 
 
 		 723 aa  501  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.518229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3418  hypothetical protein  40.74 
 
 		 723 aa  501  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01783  hypothetical protein  37.43 
 
 		 791 aa  496  1e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0585  hypothetical protein  37.17 
 
 		 787 aa  498  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02777  hypothetical protein  38.07 
 
 		 787 aa  497  1e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0666  hypothetical protein  39.25 
 
 		 775 aa  496  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003066  hypothetical protein  37 
 
 		 781 aa  492  1e-137  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1515  Radical SAM domain protein  39.06 
 
 		 758 aa  486  1e-136  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0572332  hitchhiker  0.00245581 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1013  Radical SAM domain protein  42.66 
 
 		 607 aa  482  1e-135  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000409081  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1364  radical SAM domain-containing protein  36.93 
 
 		 755 aa  483  1e-135  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000206829 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0587  hypothetical protein  38.99 
 
 		 769 aa  481  1e-134  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.282021  normal  0.175321 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0540  hypothetical protein  37.26 
 
 		 767 aa  482  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.212733  normal  0.530642 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3431  radical SAM-like  37.75 
 
 		 784 aa  480  1e-134  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4160  hypothetical protein  40.1 
 
 		 687 aa  481  1e-134  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1506  radical SAM domain-containing protein  45.01 
 
 		 554 aa  476  1e-133  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4928  radical SAM domain protein  39.42 
 
 		 771 aa  475  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2153  Elongator protein 3/MiaB/NifB  36.97 
 
 		 763 aa  475  1e-132  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.157967 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0382  hypothetical protein  36.81 
 
 		 763 aa  474  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0407  radical SAM domain-containing protein  42.63 
 
 		 595 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1663  Radical SAM domain protein  35.71 
 
 		 745 aa  462  1e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0934  hypothetical protein  40.03 
 
 		 634 aa  457  1e-127  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.157188 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1359  Elongator protein 3/MiaB/NifB  39.55 
 
 		 646 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1188  Radical SAM domain protein  41.64 
 
 		 740 aa  439  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.903904  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0819  radical SAM domain-containing protein  39.96 
 
 		 680 aa  436  1e-120  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3203  radical SAM domain-containing protein  34.55 
 
 		 752 aa  423  1e-117  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.939016  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2121  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 746 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0945  hypothetical protein  51.57 
 
 		 657 aa  395  1e-108  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0324  hypothetical protein  38.13 
 
 		 815 aa  314  2.9999999999999996e-84  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.366005 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0355  hypothetical protein  38.03 
 
 		 812 aa  312  1e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.170887 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4177  hypothetical protein  37.67 
 
 		 807 aa  308  3e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0396  hypothetical protein  36.76 
 
 		 773 aa  307  4.0000000000000004e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4059  hypothetical protein  35.89 
 
 		 819 aa  307  4.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3981  hypothetical protein  37.44 
 
 		 812 aa  307  5.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2008  hypothetical protein  37.41 
 
 		 817 aa  303  1e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0530056  normal  0.455739 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5654  hypothetical protein  38.65 
 
 		 747 aa  301  3e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>