243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3612 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3612  hypothetical protein  100 
 
 
290 aa  576  1.0000000000000001e-163  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0235  hypothetical protein  40 
 
 
281 aa  190  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2703  hypothetical protein  40.07 
 
 
301 aa  190  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000135804  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2675  hypothetical protein  33.33 
 
 
285 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000375547  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2360  hypothetical protein  33.7 
 
 
285 aa  172  7.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.411181  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0967  hypothetical protein  41.42 
 
 
281 aa  170  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.69732  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1456  hypothetical protein  38.11 
 
 
293 aa  170  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0996755  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2126  protein of unknown function DUF161  35.54 
 
 
289 aa  167  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00308608  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3076  hypothetical protein  35.59 
 
 
283 aa  168  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000401824  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1254  hypothetical protein  36.27 
 
 
293 aa  166  4e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.611511  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3006  protein of unknown function DUF161  37.18 
 
 
286 aa  165  8e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000192497  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1697  hypothetical protein  36.36 
 
 
293 aa  165  9e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.264379  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1440  hypothetical protein  36.36 
 
 
293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00353544  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1412  hypothetical protein  36.36 
 
 
293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000497334  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3759  hypothetical protein  35.64 
 
 
293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1413  hypothetical protein  36.36 
 
 
293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118799  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2061  protein of unknown function DUF161  40.3 
 
 
283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.512789  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1586  hypothetical protein  35.64 
 
 
293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.379604  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1553  hypothetical protein  36.36 
 
 
293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.188198  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1624  hypothetical protein  36.36 
 
 
293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.459527 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3191  Protein of unknown function DUF2179  38.32 
 
 
287 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2920  protein of unknown function DUF161  38.14 
 
 
303 aa  163  3e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000232125  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1658  hypothetical protein  35.66 
 
 
293 aa  162  6e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3014  protein of unknown function DUF161  34.85 
 
 
295 aa  162  7e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000325851  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4895  hypothetical protein  35.46 
 
 
311 aa  159  7e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000776906  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16380  hypothetical protein  38.11 
 
 
286 aa  159  7e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000759545  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1288  protein of unknown function DUF161  34.98 
 
 
293 aa  155  8e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0493  Protein of unknown function DUF2179  34.62 
 
 
290 aa  155  9e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2546  hypothetical protein  36.1 
 
 
294 aa  154  1e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000203917  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0468  Protein of unknown function DUF2179  34.4 
 
 
287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1219  protein of unknown function DUF161  31.41 
 
 
299 aa  152  8e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.929134  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1207  protein of unknown function DUF161  33.8 
 
 
294 aa  151  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.772174  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1705  hypothetical protein  31.34 
 
 
288 aa  150  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1406  protein of unknown function DUF161  35.87 
 
 
278 aa  149  4e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000114892  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0290  hypothetical protein  33.58 
 
 
285 aa  144  1e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000120699  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3969  protein of unknown function DUF161  37.87 
 
 
290 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000285246  unclonable  0.000000000121594 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0295  hypothetical protein  32.38 
 
 
285 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0907  hypothetical protein  32.86 
 
 
296 aa  144  2e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00009581 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1662  Protein of unknown function DUF2179  29.89 
 
 
292 aa  142  7e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.242914  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1947  hypothetical protein  32.32 
 
 
313 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1913  hypothetical protein  34.18 
 
 
295 aa  137  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2215  protein of unknown function DUF161  36.76 
 
 
294 aa  137  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00368135  hitchhiker  0.000374105 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0234  yitT family protein  32.51 
 
 
278 aa  135  9e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.347632  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0253  yitT family protein  32.51 
 
 
278 aa  135  9e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2263  Protein of unknown function DUF2179  29.89 
 
 
304 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0771  hypothetical protein  29.6 
 
 
283 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.103591  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0203  hypothetical protein  32.26 
 
 
278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0210  yitT family protein  31.8 
 
 
278 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0196  hypothetical protein  31.8 
 
 
278 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.851419  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0200  hypothetical protein  31.8 
 
 
278 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5091  yitT family protein  32.16 
 
 
278 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0218  yitT family protein  31.8 
 
 
278 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0196  hypothetical protein  31.45 
 
 
278 aa  132  5e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0228  yitT family protein  31.8 
 
 
278 aa  132  6e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2110  hypothetical protein  30.22 
 
 
282 aa  132  6.999999999999999e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2106  hypothetical protein  32.09 
 
 
314 aa  132  7.999999999999999e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.874955  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2849  protein of unknown function DUF161  29.56 
 
 
288 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0235  yitT family protein  31.45 
 
 
278 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.673313  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0748  hypothetical protein  28.67 
 
 
283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0644757  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2225  hypothetical protein  32.82 
 
 
309 aa  130  3e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.22076  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1826  hypothetical protein  32.3 
 
 
298 aa  129  4.0000000000000003e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0748  hypothetical protein  30.04 
 
 
295 aa  128  1.0000000000000001e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.796789  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0305  hypothetical protein  30.07 
 
 
277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3548  protein of unknown function DUF161  33.22 
 
 
288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3284  hypothetical protein  34.15 
 
 
279 aa  125  6e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.565823  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5163  hypothetical protein  29.89 
 
 
297 aa  125  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3254  hypothetical protein  33.8 
 
 
279 aa  125  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3033  hypothetical protein  33.8 
 
 
279 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.238411  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3014  hypothetical protein  33.8 
 
 
279 aa  125  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.098054  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3259  hypothetical protein  33.8 
 
 
279 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3266  hypothetical protein  33.8 
 
 
279 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.698402  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0669  hypothetical protein  30.43 
 
 
277 aa  125  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.866307  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0684  hypothetical protein  30.43 
 
 
277 aa  125  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0536  hypothetical protein  28.47 
 
 
288 aa  125  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5178  hypothetical protein  29.89 
 
 
297 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2616  protein of unknown function DUF161  33.33 
 
 
288 aa  124  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000720176  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0080  hypothetical protein  29.89 
 
 
297 aa  124  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2170  hypothetical protein  29.24 
 
 
290 aa  123  3e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000241108  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5168  hypothetical protein  29.89 
 
 
297 aa  124  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2954  hypothetical protein  33.8 
 
 
279 aa  123  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.645882  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2358  Protein of unknown function DUF2179  27.76 
 
 
296 aa  123  4e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.127007  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1996  hypothetical protein  33.45 
 
 
279 aa  122  5e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3612  hypothetical protein  30.63 
 
 
297 aa  122  6e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0958  hypothetical protein  31.4 
 
 
306 aa  122  6e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2979  hypothetical protein  33.45 
 
 
279 aa  122  6e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.034636  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1039  hypothetical protein  30.58 
 
 
315 aa  122  7e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4891  hypothetical protein  29.89 
 
 
297 aa  122  8e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4733  hypothetical protein  29.89 
 
 
297 aa  122  8e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4748  hypothetical protein  29.89 
 
 
297 aa  122  8e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5265  hypothetical protein  29.89 
 
 
297 aa  122  8e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0594093  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5133  hypothetical protein  29.89 
 
 
297 aa  122  8e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0885  protein of unknown function DUF161  31.32 
 
 
280 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000434482  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0103  protein of unknown function DUF161  27.3 
 
 
279 aa  121  9.999999999999999e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4850  hypothetical protein  29.89 
 
 
297 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3566  protein of unknown function DUF161  35.14 
 
 
288 aa  119  6e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.332576  normal  0.685125 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0167  Protein of unknown function DUF2179  31.87 
 
 
293 aa  119  6e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1380  hypothetical protein  31.15 
 
 
285 aa  119  6e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000107649  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2267  protein of unknown function DUF161  32.74 
 
 
299 aa  119  7e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000155206  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2105  hypothetical protein  28.85 
 
 
290 aa  117  3e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.53861  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2305  hypothetical protein  36.24 
 
 
269 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>