More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3508 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  100 
 
 		 443 aa  903    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  33.83 
 
 		 392 aa  223  4e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  34.53 
 
 		 400 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  33.76 
 
 		 390 aa  204  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  34.53 
 
 		 414 aa  200  5e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  31.03 
 
 		 377 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  30.14 
 
 		 369 aa  163  6e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  30.14 
 
 		 369 aa  162  9e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  31.59 
 
 		 369 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  31.65 
 
 		 370 aa  161  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  29.25 
 
 		 391 aa  161  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  27.63 
 
 		 378 aa  160  4e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  28.34 
 
 		 435 aa  155  2e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  34.19 
 
 		 305 aa  149  9e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  28.9 
 
 		 379 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  25.58 
 
 		 477 aa  148  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  27.74 
 
 		 386 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  32.76 
 
 		 368 aa  145  1e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  27.15 
 
 		 363 aa  145  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  28.53 
 
 		 381 aa  145  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  27.49 
 
 		 385 aa  139  8.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  29.1 
 
 		 392 aa  139  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  30.22 
 
 		 325 aa  137  5e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  29.77 
 
 		 374 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  29.77 
 
 		 374 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  27.72 
 
 		 389 aa  134  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  30 
 
 		 383 aa  134  3e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  29.97 
 
 		 370 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  29.53 
 
 		 377 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  27.11 
 
 		 387 aa  127  6e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  27.11 
 
 		 409 aa  126  7e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0915  Tn916, transposase  28.73 
 
 		 405 aa  124  3e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  25.51 
 
 		 403 aa  124  4e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  27.81 
 
 		 383 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  28.76 
 
 		 388 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  23.56 
 
 		 402 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  27.66 
 
 		 463 aa  119  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0709  phage integrase family protein  27.97 
 
 		 386 aa  118  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  24.81 
 
 		 431 aa  119  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  25.31 
 
 		 379 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  25.31 
 
 		 379 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  28.83 
 
 		 385 aa  118  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  23.98 
 
 		 422 aa  117  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5534  integrase family protein  23.82 
 
 		 426 aa  117  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  28.95 
 
 		 391 aa  117  6e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  28.36 
 
 		 398 aa  117  6e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  24.49 
 
 		 422 aa  116  7.999999999999999e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3878  integrase family protein  25 
 
 		 380 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  26.56 
 
 		 404 aa  114  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  33.33 
 
 		 378 aa  111  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1239  integrase family protein  25.22 
 
 		 390 aa  109  9.000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.120865  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0882  phage integrase family protein  27.2 
 
 		 414 aa  109  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.520245  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  25.69 
 
 		 373 aa  108  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  30.66 
 
 		 391 aa  108  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2665  integrase family protein  26.29 
 
 		 407 aa  107  5e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000119591  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  25.53 
 
 		 376 aa  107  6e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  26.34 
 
 		 416 aa  107  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  25.48 
 
 		 451 aa  105  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3318  integrase family protein  25.21 
 
 		 423 aa  103  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000001885  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1561  site-specific recombinase phage integrase family protein  29.64 
 
 		 418 aa  103  6e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.885578  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  26.93 
 
 		 365 aa  103  8e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  25.45 
 
 		 381 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  23.82 
 
 		 371 aa  100  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1419  integrase family protein  25.81 
 
 		 390 aa  100  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.447287  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  24.85 
 
 		 381 aa  100  8e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  24.77 
 
 		 393 aa  99  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  28.12 
 
 		 397 aa  99  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1407  integrase family protein  25.26 
 
 		 374 aa  99.4  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0609363  normal  0.0878514 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1351  integrase family protein  23.71 
 
 		 416 aa  97.4  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  26.91 
 
 		 454 aa  97.1  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  24.78 
 
 		 376 aa  96.7  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6718  integrase family protein  25.8 
 
 		 656 aa  96.7  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3350  integrase  27.24 
 
 		 308 aa  95.9  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00359362  decreased coverage  0.00980373 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1100  phage integrase family protein  24.23 
 
 		 383 aa  96.3  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  25.86 
 
 		 413 aa  95.1  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28710  site-specific recombinase XerD  25.49 
 
 		 370 aa  94.4  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.870092  normal  0.942592 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1422  phage integrase  27.52 
 
 		 442 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25.07 
 
 		 376 aa  94  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25.07 
 
 		 376 aa  94  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1440  phage integrase family protein  27.52 
 
 		 393 aa  93.6  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3691  site-specific integrase  26.21 
 
 		 370 aa  93.6  7e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  23.74 
 
 		 376 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  25.71 
 
 		 384 aa  92.8  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  22.82 
 
 		 378 aa  92  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2625  phage integrase family protein  25.69 
 
 		 409 aa  90.9  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0300817  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0457  integrase family protein  25.07 
 
 		 487 aa  90.9  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2293  phage integrase family protein  26.52 
 
 		 395 aa  90.9  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0926  integrase family protein  25.24 
 
 		 438 aa  90.5  5e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0860  integrase family protein  27.16 
 
 		 370 aa  89.7  8e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0607  integrase  25.73 
 
 		 374 aa  88.6  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2145  integrase  23.94 
 
 		 393 aa  88.6  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.234907  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  24.42 
 
 		 357 aa  87.8  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8572  DNA binding domain protein, excisionase family  23.74 
 
 		 507 aa  87.8  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0167813  normal  0.0589685 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3933  integrase family protein  24.78 
 
 		 344 aa  86.7  8e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00343242  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08320  site-specific recombinase XerD  23.95 
 
 		 460 aa  86.7  8e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.113738 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0924  integrase family protein  24.8 
 
 		 399 aa  86.7  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  33.92 
 
 		 404 aa  86.7  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09660  site-specific recombinase, integrase family  27.73 
 
 		 396 aa  85.1  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.458441  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2865  site-specific recombinase XerD-like  25.79 
 
 		 417 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.11888  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6721  integrase family protein  25.53 
 
 		 494 aa  85.5  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.917048  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>