More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3507 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3507  sugar transferase  100 
 
 
211 aa  428  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4101  sugar transferase  71.77 
 
 
211 aa  316  1e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0756237 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5069  sugar transferase  68.16 
 
 
210 aa  285  4e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5447  exopolysaccharide production protein ExoY  78.03 
 
 
134 aa  222  3e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3388  sugar transferase  53.48 
 
 
186 aa  200  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1337  sugar transferase  50.8 
 
 
186 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0288404 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3985  sugar transferase  48.13 
 
 
186 aa  191  6e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1586  sugar transferase  49.73 
 
 
187 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0491146  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2587  sugar transferase  51.35 
 
 
186 aa  188  5.999999999999999e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6496  sugar transferase  49.2 
 
 
188 aa  187  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1626  sugar transferase  50.81 
 
 
186 aa  187  8e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6006  sugar transferase  53.05 
 
 
219 aa  186  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0633  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  48.4 
 
 
196 aa  184  6e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.339085  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1263  sugar transferase  49.19 
 
 
186 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1277  sugar transferase  46.49 
 
 
186 aa  181  8.000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0679585  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0569  sugar transferase  49.73 
 
 
186 aa  180  1e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00336814  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3481  sugar transferase  52.83 
 
 
186 aa  180  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0937708  normal  0.263675 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1493  sugar transferase  47.94 
 
 
200 aa  175  3e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2615  sugar transferase  48.66 
 
 
188 aa  176  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0152  sugar transferase  45.41 
 
 
185 aa  173  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0147  sugar transferase  45.41 
 
 
185 aa  173  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1752  sugar transferase  49.06 
 
 
186 aa  163  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.637714  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5393  UDP-galactose phosphate transferase  47.92 
 
 
230 aa  162  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0595  sugar transferase family protein  43.54 
 
 
220 aa  159  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.750917  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2247  capsular polysaccharide synthesis protein  44.62 
 
 
188 aa  157  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.436876  hitchhiker  0.00758225 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0763  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  44.39 
 
 
219 aa  153  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2276  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  42.93 
 
 
456 aa  153  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000104182  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3537  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  43.39 
 
 
488 aa  150  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0569176 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1519  sugar transferase  45.21 
 
 
214 aa  149  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3047  sugar transferase  43.01 
 
 
243 aa  149  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1698  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  40.72 
 
 
204 aa  149  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.965123  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3821  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  41.62 
 
 
206 aa  148  4e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3256  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  42.16 
 
 
207 aa  148  5e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2523  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  40.29 
 
 
226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181679 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3866  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  43.55 
 
 
461 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193818  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0818  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  42.93 
 
 
461 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1979  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  39.59 
 
 
457 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0160004 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1034  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  42.11 
 
 
490 aa  145  5e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10743  putative undecaprenyl-phosphate glycosyl-1-phosphate transferase  41.92 
 
 
202 aa  145  6e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.335264  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2852  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  43.01 
 
 
208 aa  142  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0584  glycosyltransferase  40.31 
 
 
209 aa  142  4e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000164965  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1068  putative glycosyl transferase  41.58 
 
 
494 aa  141  6e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.676615  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3387  sugar transferase  42.29 
 
 
182 aa  140  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0716  sugar transferase  38.89 
 
 
207 aa  140  9.999999999999999e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1539  sugar transferase  44.72 
 
 
183 aa  140  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0350538  hitchhiker  0.0019273 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0831  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase, WbaP  42 
 
 
474 aa  140  9.999999999999999e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1141  general glycosylation pathway protein  41.12 
 
 
200 aa  140  9.999999999999999e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.987369  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0778  sugar transferase  40.91 
 
 
189 aa  139  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.105471  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0466  capsular polysaccharide biosynthesis protein  43.3 
 
 
222 aa  139  3e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000106234  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1266  general glycosylation pathway protein  40.61 
 
 
200 aa  138  4.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5172  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  39.8 
 
 
502 aa  138  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00967107  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1363  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  39.39 
 
 
239 aa  138  6e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.585717  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1395  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  37.88 
 
 
470 aa  138  6e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000275666  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0812  sugar transferase  43.21 
 
 
185 aa  138  7e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.201129  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2023  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  40.43 
 
 
201 aa  138  7.999999999999999e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.686933  hitchhiker  0.0000000000460797 
 
 
-
 
NC_004310  BR0781  sugar transferase  41.67 
 
 
512 aa  137  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.783563  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0454  glycosyltransferase, putative  42.93 
 
 
222 aa  137  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000102874  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3271  sugar transferase  40.57 
 
 
182 aa  137  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3127  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  38.38 
 
 
501 aa  136  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.526829  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4061  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  39.49 
 
 
522 aa  135  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2712  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  39.29 
 
 
505 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.104173 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0384  sugar transferase  40 
 
 
202 aa  135  4e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0775  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  41.15 
 
 
512 aa  135  4e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0636  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  36.76 
 
 
207 aa  135  5e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.678977  normal  0.34007 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2070  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  37.5 
 
 
247 aa  135  5e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1126  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  40.93 
 
 
201 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0875109  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0597  general glycosylation pathway protein  41.08 
 
 
200 aa  134  8e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4475  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  41.24 
 
 
463 aa  134  8e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6387  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  38.97 
 
 
522 aa  134  8e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2344  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  47.59 
 
 
232 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3142  sugar transferase, putative  41.9 
 
 
473 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3524  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  39.04 
 
 
470 aa  134  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000171122  normal  0.258747 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2509  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  38.54 
 
 
516 aa  134  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2713  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  40.78 
 
 
473 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.821002 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0462  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  41.03 
 
 
448 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00445069  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2572  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  41.9 
 
 
473 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1293  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  38.78 
 
 
485 aa  134  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0890  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  41.5 
 
 
454 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.541362  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2370  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  40.58 
 
 
229 aa  133  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.335038  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3389  sugar transferase  39.32 
 
 
204 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.251832  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2000  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  38.74 
 
 
215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1835  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  37.19 
 
 
239 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.68976  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0229  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.48 
 
 
506 aa  132  3e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.287512 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1255  galactosyltransferase  44.16 
 
 
200 aa  132  3e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1433  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  40.84 
 
 
194 aa  132  3.9999999999999996e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2903  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  41.34 
 
 
472 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3089  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  39.06 
 
 
518 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.411544  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1539  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  37.24 
 
 
506 aa  132  5e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4262  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  38.58 
 
 
206 aa  132  5e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3064  sugar transferase  39.68 
 
 
490 aa  132  5e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.829905  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1436  sugar transferase  39.49 
 
 
329 aa  132  5e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0467092  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2699  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  36.14 
 
 
477 aa  132  5e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.438937 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0111  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  41.86 
 
 
477 aa  131  6e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.629672  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1374  sugar transferase  39.29 
 
 
476 aa  131  6.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0318096 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0586  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  42.49 
 
 
206 aa  131  6.999999999999999e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3108  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  40.58 
 
 
229 aa  131  7.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2459  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  38.5 
 
 
498 aa  131  7.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.721842  normal  0.253971 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1222  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  40.31 
 
 
521 aa  131  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.957103  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1412  sugar transferase  39.29 
 
 
510 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1277  sugar transferase  41.14 
 
 
183 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000470933 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>