40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3466 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  100 
 
 		 1281 aa  2588    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1439  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  25.43 
 
 		 1049 aa  90.5  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00896108  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1245  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  25.36 
 
 		 969 aa  84.3  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0232944  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0636  bifunctional autolysin  26.56 
 
 		 1335 aa  74.3  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.0000166594  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1135  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.16 
 
 		 1248 aa  72.4  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00817868  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1112  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase., mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosaminidase  27.16 
 
 		 1248 aa  72.4  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00229916  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1562  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  27.92 
 
 		 545 aa  68.2  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0927  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosaminidase  27.92 
 
 		 632 aa  62.8  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0909  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosaminidase  27.92 
 
 		 632 aa  62.8  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0063  peptidoglycan-binding LysM  58.93 
 
 		 202 aa  60.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0180593  normal  0.117773 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0372  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosaminidase  26.62 
 
 		 624 aa  60.1  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0363  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosaminidase  26.62 
 
 		 624 aa  60.1  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2373  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosaminidase  27.92 
 
 		 258 aa  56.6  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.628854  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2330  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosaminidase  27.92 
 
 		 258 aa  56.6  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4013  peptidoglycan-binding LysM  50.91 
 
 		 203 aa  55.8  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0332681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0587  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  23.5 
 
 		 553 aa  54.3  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.369962  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2308  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.1 
 
 		 1776 aa  52.8  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1891  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.2 
 
 		 258 aa  51.6  0.00009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1281  hypothetical protein  45.16 
 
 		 430 aa  51.2  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.197658 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4505  PT repeat-containing protein  57.35 
 
 		 453 aa  50.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0528  hypothetical protein  50 
 
 		 431 aa  50.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.617097  normal  0.16882 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  56.9 
 
 		 846 aa  50.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0540  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  56.36 
 
 		 340 aa  48.9  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00025616 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  47.54 
 
 		 671 aa  48.9  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0391  SH3 type 3 domain-containing protein  23.97 
 
 		 510 aa  47.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744307 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  51.85 
 
 		 433 aa  48.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2288  serine/threonine protein kinase  48.57 
 
 		 771 aa  47  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000513908 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  23.65 
 
 		 370 aa  47.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  48.21 
 
 		 916 aa  47.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1986  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  53.57 
 
 		 257 aa  47.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2778  hypothetical protein  49.02 
 
 		 335 aa  46.6  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.687972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1873  peptidoglycan binding domain-containing protein  50 
 
 		 261 aa  46.2  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.499146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2810  serine/threonine kinase protein  51.85 
 
 		 1034 aa  45.8  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.855533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1913  hypothetical protein  42.42 
 
 		 337 aa  45.8  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00733934  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44995  predicted protein  33.03 
 
 		 1217 aa  45.8  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00833272  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0099  protein serine/threonine phosphatase  49.09 
 
 		 449 aa  45.8  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  27.5 
 
 		 424 aa  45.4  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1516  MerR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 201 aa  45.4  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.699928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4618  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.16 
 
 		 370 aa  45.1  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00401863  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2693  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.92 
 
 		 616 aa  45.1  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17431  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>