More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3461 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_11960  ATP-dependent protease  46.37 
 
 
854 aa  733  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1876  ATPase AAA-2 domain protein  53.95 
 
 
821 aa  852  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000589067 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0011  ATPase AAA-2 domain protein  48.77 
 
 
792 aa  736  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1419  ATPase AAA-2 domain protein  53.57 
 
 
822 aa  851  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0954  ATP-dependent chaperone ClpB  45.88 
 
 
872 aa  750  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0025  ATPase AAA-2 domain protein  46.83 
 
 
789 aa  738  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0102  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  56.41 
 
 
811 aa  907  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0845535  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1907  ATP-dependent chaperone ClpB  45.43 
 
 
864 aa  719  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.442635 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1480  ATPase AAA-2 domain protein  51.04 
 
 
823 aa  820  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0038131  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0899  ATPase AAA-2 domain protein  48.83 
 
 
894 aa  761  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  4.1024e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0111  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  56.53 
 
 
811 aa  907  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.2403  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3833  protein disaggregation chaperone  45.45 
 
 
857 aa  714  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  1.68048e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0666  chaperone ClpB (heat-shock protein)  45.95 
 
 
861 aa  733  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00205546  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1489  ATPase AAA-2 domain protein  49.27 
 
 
813 aa  775  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2617  ATPase AAA-2 domain protein  49.46 
 
 
846 aa  794  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0330  ATPase AAA-2 domain protein  49.7 
 
 
849 aa  796  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.711717 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4921  ATP-dependent chaperone ClpB  44.22 
 
 
879 aa  724  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289151  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5224  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  56.41 
 
 
811 aa  906  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  5.55448e-05  unclonable  1.16962e-24 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0091  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  56.53 
 
 
811 aa  907  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.7884e-59 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0389  ATPase AAA-2 domain protein  53.63 
 
 
826 aa  896  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0666957  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1825  ATPase AAA-2 domain protein  59.39 
 
 
829 aa  958  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1508  ATP-dependent chaperone ClpB  45.95 
 
 
864 aa  724  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.280077  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2550  ATP-dependent chaperone ClpB  46.66 
 
 
867 aa  716  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.454125  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0817  ATP-dependent chaperone ClpB  46 
 
 
859 aa  722  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.220377  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00870  ATPase AAA-2 domain protein  55.32 
 
 
806 aa  871  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.09164e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0327  ATPase AAA-2 domain protein  58.36 
 
 
810 aa  968  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00200367  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5381  ATP-dependent chaperone ClpB  44.39 
 
 
878 aa  726  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0414  ATP-dependent chaperone ClpB  45.49 
 
 
870 aa  714  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0332  ATPase AAA-2 domain protein  51.73 
 
 
830 aa  825  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4704  ATPase AAA-2 domain protein  53.94 
 
 
825 aa  863  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.655503 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4582  ATP-dependent chaperone ClpB  44.43 
 
 
899 aa  726  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.994728  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2969  ATP-dependent chaperone ClpB  46.44 
 
 
872 aa  760  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.472161  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1850  ATPase AAA-2 domain protein  48.66 
 
 
826 aa  783  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1436  ATPase AAA-2 domain protein  49.94 
 
 
834 aa  832  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.327817 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0314  ATP-dependent chaperone ClpB  48.22 
 
 
861 aa  764  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.174502  normal  0.43861 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2814  ATP-dependent chaperone ClpB  46.57 
 
 
864 aa  736  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  6.72053e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0355  ATPase AAA-2 domain protein  48.66 
 
 
853 aa  776  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  7.16084e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1585  ATP-binding subunit of Clp protease  45.44 
 
 
889 aa  715  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0010  ATP-binding subunit of Clp protease  52.86 
 
 
869 aa  845  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1089  protein disaggregation chaperone  45.45 
 
 
857 aa  714  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  8.60565e-06  decreased coverage  6.35783e-07 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0181  ATPase  53.08 
 
 
812 aa  908  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.551384  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0991  ATP-dependent chaperone ClpB  45.11 
 
 
864 aa  718  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.462361  normal  0.380293 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0671  ATP-dependent chaperone ClpB  45.92 
 
 
854 aa  720  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0835  ATPase  57.54 
 
 
816 aa  918  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0981203  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0076  ATPase  56.29 
 
 
811 aa  907  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0363  ATPase  49.08 
 
 
830 aa  753  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0571642  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3461  ATPase  100 
 
 
824 aa  1667  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.385513  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10981  ClpC  50.77 
 
 
859 aa  827  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.518332  normal  0.298944 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10731  ATP-dependent Clp protease, Hsp 100, ATP-binding subunit ClpB  43.69 
 
 
863 aa  717  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.977517  normal  0.696601 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4974  ATPase  46.64 
 
 
859 aa  735  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0503  ATPase  49.09 
 
 
837 aa  774  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0028  ATPase  48.3 
 
 
822 aa  759  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4709  ATPase  52.4 
 
 
844 aa  837  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0549246  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2308  ATPase  46.98 
 
 
848 aa  721  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0112773 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2192  ATPase  52.4 
 
 
836 aa  835  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.158504  normal  0.0967388 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0054  ATPase  49.43 
 
 
792 aa  716  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000677637  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0750  ATPase  50.55 
 
 
820 aa  796  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0092536  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1438  ATPase  46.54 
 
 
791 aa  718  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0255  ATPase AAA-2 domain protein  49.82 
 
 
849 aa  800  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1575  ATPase AAA-2 domain protein  51.11 
 
 
814 aa  786  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0146  ATPase AAA-2 domain protein  55.13 
 
 
814 aa  898  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1813  ATP-dependent chaperone ClpB  45.4 
 
 
865 aa  721  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.264392 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2973  protein disaggregation chaperone  45.45 
 
 
857 aa  714  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  8.39096e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0059  ATPase AAA-2 domain protein  48.23 
 
 
860 aa  775  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0310475  normal  0.148916 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1526  ATPase  50.36 
 
 
839 aa  828  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00101266  unclonable  2.18976e-18 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0938  ATP-dependent chaperone ClpB  45.97 
 
 
865 aa  721  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.651137 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0823  ATP-dependent chaperone ClpB  44.87 
 
 
865 aa  721  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.457177  normal  0.714446 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2678  ATPase  49.46 
 
 
840 aa  803  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1950  ATP-dependent chaperone ClpB  44.58 
 
 
872 aa  717  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5085  ATP-dependent chaperone ClpB  44.77 
 
 
878 aa  726  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1871  ATP-dependent chaperone ClpB  45.74 
 
 
865 aa  717  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914514  hitchhiker  0.00068735 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5444  ATP-dependent chaperone ClpB  44.66 
 
 
874 aa  719  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4545  ATP-dependent chaperone ClpB  45.87 
 
 
854 aa  734  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.822332  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2746  protein disaggregation chaperone  45.45 
 
 
857 aa  714  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00462147  normal  0.181562 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2696  ATPase  46.86 
 
 
862 aa  732  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4738  ATPase AAA-2 domain-containing protein  52.37 
 
 
824 aa  850  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0645  ATP-dependent chaperone ClpB  44.41 
 
 
892 aa  726  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1370  ATPase AAA-2 domain protein  48.49 
 
 
843 aa  776  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.79218  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0724  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  52.21 
 
 
862 aa  838  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0978513 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9148  class III stress response-related ATPase  51.97 
 
 
835 aa  845  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4026  ATPase AAA-2 domain protein  45.6 
 
 
868 aa  720  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.15159  normal  0.203961 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_56  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit  49.57 
 
 
824 aa  802  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1194  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit  49.15 
 
 
812 aa  790  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.453766  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0363  ATPase AAA-2 domain protein  51.92 
 
 
852 aa  828  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1399  ATPase AAA-2 domain protein  48.83 
 
 
815 aa  787  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1349  ATPase AAA-2 domain protein  52.76 
 
 
820 aa  865  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1216  ATP-dependent chaperone ClpB  47.09 
 
 
867 aa  757  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1402  ATPase AAA-2 domain protein  52.05 
 
 
819 aa  835  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.515013  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1077  ATP-dependent chaperone ClpB  46.15 
 
 
871 aa  749  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  1.52857e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05080  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  52.72 
 
 
858 aa  832  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4475  ATPase AAA-2 domain protein  52.48 
 
 
837 aa  847  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2465  ATP-dependent chaperone ClpB  47.26 
 
 
880 aa  728  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1682  ATPase AAA-2 domain protein  52.14 
 
 
868 aa  829  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0641  ATPase AAA-2 domain protein  51.05 
 
 
841 aa  830  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2062  ATPase AAA-2 domain protein  47.1 
 
 
847 aa  721  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.587119  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2309  ATP-dependent chaperone ClpB  46.34 
 
 
872 aa  754  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1201  ATP-dependent chaperone ClpB  43.45 
 
 
894 aa  733  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1000  ATPase AAA-2 domain-containing protein  49.94 
 
 
815 aa  809  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0499037  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11148  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpC  47.61 
 
 
848 aa  762  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4992  ATPase AAA-2 domain protein  51.97 
 
 
836 aa  838  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.384287  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>