291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3437 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3437  preprotein translocase, YajC subunit  100 
 
 		 110 aa  225  2e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.616709  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0682  preprotein translocase, YajC subunit  39.18 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1458  preprotein translocase, YajC subunit  39.24 
 
 		 99 aa  67.8  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000156531  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1801  preprotein translocase, YajC subunit  36.08 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0543558  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1667  preprotein translocase, YajC subunit  36.9 
 
 		 93 aa  66.6  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0070914  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3621  preprotein translocase, YajC subunit  37.63 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000152664  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1893  preprotein translocase, YajC subunit  35.11 
 
 		 103 aa  65.1  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.49225e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3465  preprotein translocase, YajC subunit  35.24 
 
 		 114 aa  64.7  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113386  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3112  preprotein translocase subunit YajC  39.22 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1218  preprotein translocase, YajC subunit  46.67 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000169115  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1757  preprotein translocase subunit YajC  36.89 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000115206  hitchhiker  0.00353276 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2483  preprotein translocase subunit YajC  38.38 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000329003  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3383  preprotein translocase subunit YajC  37.14 
 
 		 111 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000227784  normal  0.514524 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3122  preprotein translocase subunit YajC  37.14 
 
 		 111 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00795341  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12280  preprotein translocase, YajC subunit  35.56 
 
 		 91 aa  63.2  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107658  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0806  preprotein translocase, YajC subunit  35.05 
 
 		 103 aa  63.2  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0248725  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0542  preprotein translocase, YajC subunit  41.94 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0292946 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3263  preprotein translocase subunit YajC  37.14 
 
 		 111 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000145315  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1471  preprotein translocase subunit YajC  37.37 
 
 		 110 aa  62  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000169079  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4620  preprotein translocase subunit YajC  33.33 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1062  preprotein translocase subunit YajC  38.46 
 
 		 110 aa  62  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.9983  hitchhiker  0.00140347 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1383  preprotein translocase subunit YajC  37.37 
 
 		 110 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000313492  hitchhiker  0.00000720992 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00524  preprotein translocase subunit YajC  40 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1358  preprotein translocase, YajC subunit  35.44 
 
 		 90 aa  61.6  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00135815  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0068  preprotein translocase, YajC subunit  36.56 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.95541  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1348  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0068  preprotein translocase, YajC subunit  34.78 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1571  preprotein translocase subunit YajC  36.36 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000298712  hitchhiker  0.0000000623922 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2786  preprotein translocase subunit YajC  36.36 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000416487  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2881  preprotein translocase subunit YajC  36.36 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000118136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1662  protein translocase subunit yajC  39.76 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000198451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2806  preprotein translocase subunit YajC  36.36 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000242137  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2055  preprotein translocase, YajC subunit  36.08 
 
 		 102 aa  60.8  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.34976  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0485  preprotein translocase, YajC subunit  34.83 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0108  hypothetical protein  29.31 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3519  preprotein translocase subunit YajC  32.98 
 
 		 109 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0958686  normal  0.24263 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2183  preprotein translocase, YajC subunit  39.51 
 
 		 113 aa  60.1  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2348  preprotein translocase, YajC subunit  29.63 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2192  preprotein translocase subunit YajC  38.46 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0011264  hitchhiker  0.00792113 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1340  preprotein translocase, YajC subunit  38.71 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.497494  normal  0.750332 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1616  preprotein translocase subunit YajC  36.26 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0558559  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1402  preprotein translocase subunit YajC  40 
 
 		 91 aa  59.3  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000229037  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1217  protein translocase subunit yajC  32.04 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38734 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2112  preprotein translocase, YajC subunit  32.04 
 
 		 117 aa  58.9  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000210725  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0157  hypothetical protein  32.35 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2336  preprotein translocase, YajC subunit  39.51 
 
 		 91 aa  58.5  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000343241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14610  preprotein translocase subunit YajC  32.22 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1291  preprotein translocase subunit YajC  32.22 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2891  preprotein translocase subunit YajC  35.92 
 
 		 110 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0845715  hitchhiker  0.000439753 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2092  protein translocase subunit yajC  35.58 
 
 		 102 aa  58.2  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1790  preprotein translocase, YajC subunit  34.04 
 
 		 108 aa  58.2  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1229  preprotein translocase subunit YajC  40.51 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.655202  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1811  preprotein translocase, YajC subunit  35.8 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.690098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0727  preprotein translocase subunit YajC  40.91 
 
 		 93 aa  58.2  0.00000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0798345  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0853  protein translocase subunit yajC  37.04 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  30.77 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000092041  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1448  protein translocase subunit yajC  37.65 
 
 		 91 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000194286  hitchhiker  0.00984378 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0931  preprotein translocase subunit YajC  40 
 
 		 90 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1436  protein translocase subunit yajC  37.65 
 
 		 91 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000109142  hitchhiker  0.000636763 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2355  preprotein translocase, YajC subunit  38.96 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.458983  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40470  preprotein translocase subunit YajC  36.14 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1817  protein translocase subunit yajC  39.34 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0910437  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1322  preprotein translocase, YajC subunit  34.88 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2074  protein translocase subunit yajC  38.1 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.721534  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2010  preprotein translocase, YajC subunit  39.39 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798178  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1115  preprotein translocase, YajC subunit  38.82 
 
 		 120 aa  57.4  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.242644  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  39.39 
 
 		 105 aa  57  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0394  preprotein translocase, YajC subunit  35.56 
 
 		 126 aa  57  0.00000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.918235  normal  0.672603 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2517  preprotein translocase subunit YajC  34.12 
 
 		 91 aa  57  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00355  preprotein translocase subunit YajC  35.58 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324829  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3202  preprotein translocase, YajC subunit  35.58 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.463836  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  39.39 
 
 		 106 aa  57  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0439  preprotein translocase subunit YajC  35.58 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0487  preprotein translocase subunit YajC  35.58 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0876  preprotein translocase subunit YajC  36.54 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.187628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0477  preprotein translocase subunit YajC  35.58 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1274  preprotein translocase, YajC subunit  28.57 
 
 		 95 aa  56.6  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0326  preprotein translocase subunit YajC  36.54 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00359  hypothetical protein  35.58 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35742  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3226  preprotein translocase subunit YajC  35.58 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000105955 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1507  preprotein translocase, YajC subunit  32.98 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2213  preprotein translocase, YajC subunit  33.64 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00866418  normal  0.209417 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0437  preprotein translocase subunit YajC  35.58 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1930  preprotein translocase, YajC subunit  40.32 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0834  preprotein translocase subunit YajC  30 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.550481  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0877  preprotein translocase subunit YajC  30 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203563 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0420  hypothetical protein  30.23 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  33.33 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4344  preprotein translocase subunit YajC  30 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000136476 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0506  preprotein translocase subunit YajC  35.58 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0446  preprotein translocase subunit YajC  35.58 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0465  preprotein translocase subunit YajC  35.58 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0864  preprotein translocase subunit YajC  30 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.226856  normal  0.522349 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  34.15 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1906  preprotein translocase, YajC subunit  31.71 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0452  preprotein translocase subunit YajC  35.58 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.654019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01346  preprotein translocase subunit YajC  38.82 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.153767  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2701  preprotein translocase subunit YajC  35.79 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00115009  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2298  preprotein translocase, YajC subunit  34.94 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000341875  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0445  preprotein translocase subunit YajC  35.58 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>