115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3427 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3427  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 313 aa  650    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1251  radical SAM domain-containing protein  53.38 
 
 		 303 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.269935  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1063  radical SAM domain-containing protein  53.04 
 
 		 303 aa  332  4e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1289  radical SAM domain-containing protein  52.58 
 
 		 298 aa  326  2.0000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1152  Radical SAM domain protein  47.27 
 
 		 321 aa  303  3.0000000000000004e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.429756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0110  Radical SAM domain protein  47.6 
 
 		 296 aa  302  4.0000000000000003e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.389889  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1947  Radical SAM domain protein  48.58 
 
 		 283 aa  296  2e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0368  radical SAM family protein  46.55 
 
 		 315 aa  280  2e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000743683  normal  0.888767 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16130  pyruvate formate lyase activating protein-like uncharacterized Fe-S protein  44.48 
 
 		 293 aa  275  1.0000000000000001e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000206983 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0815  radical SAM domain-containing protein  46.6 
 
 		 320 aa  270  2e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0883393  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0838  radical SAM domain-containing protein  46.6 
 
 		 320 aa  270  2e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0526  Radical SAM domain protein  44.93 
 
 		 344 aa  265  7e-70  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0095894  unclonable  0.0000000400012 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09130  pyruvate formate lyase activating protein-like uncharacterized Fe-S protein  43.46 
 
 		 326 aa  261  8.999999999999999e-69  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0210847  normal  0.81477 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1225  Radical SAM domain protein  45.68 
 
 		 301 aa  260  2e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0616  radical SAM domain-containing protein  45.61 
 
 		 296 aa  254  1.0000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1072  radical SAM domain-containing protein  46.13 
 
 		 306 aa  254  2.0000000000000002e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1372  radical SAM domain-containing protein  45.39 
 
 		 298 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1956  Radical SAM domain protein  45.02 
 
 		 301 aa  251  1e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0661  Radical SAM domain protein  43.33 
 
 		 320 aa  249  3e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1143  radical SAM domain-containing protein  45.29 
 
 		 287 aa  248  6e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1772  radical SAM family protein  43.88 
 
 		 300 aa  247  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.138508  normal  0.113699 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4174  radical SAM domain-containing protein  42.91 
 
 		 305 aa  245  6e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000899263  hitchhiker  0.0000122101 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07611  pyruvate formate lyase activating enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15630)  44.03 
 
 		 373 aa  244  9.999999999999999e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00159546  normal  0.16163 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2309  Radical SAM domain protein  46.4 
 
 		 302 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1899  Radical SAM domain protein  46.4 
 
 		 309 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.735258  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4313  radical SAM domain-containing protein  42.91 
 
 		 305 aa  243  3e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1274  radical SAM domain-containing protein  44.24 
 
 		 319 aa  241  1e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.330948  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2082  radical SAM  43.53 
 
 		 308 aa  241  1e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1488  Radical SAM domain protein  40.13 
 
 		 323 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1949  radical SAM domain-containing protein  43.01 
 
 		 319 aa  238  9e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1859  radical SAM domain-containing protein  41.37 
 
 		 300 aa  237  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.54951  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1701  radical SAM domain-containing protein  44.16 
 
 		 295 aa  235  6e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1790  Radical SAM domain protein  42.09 
 
 		 307 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3220  radical SAM family protein  40.85 
 
 		 312 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0910246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1667  radical SAM domain-containing protein  40.14 
 
 		 312 aa  233  3e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1696  radical SAM domain-containing protein  40.22 
 
 		 336 aa  229  3e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2526  radical SAM domain-containing protein  42.81 
 
 		 318 aa  230  3e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.252975  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2282  radical SAM domain-containing protein  41.88 
 
 		 313 aa  230  3e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0003  radical SAM domain-containing protein  44.85 
 
 		 286 aa  229  5e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0003  radical SAM domain-containing protein  44.85 
 
 		 286 aa  229  6e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1368  radical SAM domain-containing protein  40.8 
 
 		 334 aa  221  8e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0299345  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2121  radical SAM domain-containing protein  40.25 
 
 		 326 aa  222  8e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152404  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1179  radical SAM domain-containing protein  40.8 
 
 		 334 aa  221  9.999999999999999e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0438654  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1149  radical SAM domain protein  40.8 
 
 		 334 aa  217  2e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000033704  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1076  Radical SAM domain protein  36.82 
 
 		 327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1745  Radical SAM domain protein  42.08 
 
 		 303 aa  206  6e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0609211 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2506  radical SAM domain-containing protein  38 
 
 		 331 aa  202  5e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000358558  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0826  radical SAM domain-containing protein  35.69 
 
 		 373 aa  165  8e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0283607 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0925  radical SAM domain-containing protein  35.34 
 
 		 355 aa  162  8.000000000000001e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1947  radical SAM domain-containing protein  35.66 
 
 		 372 aa  156  4e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0987  radical SAM domain-containing protein  36.62 
 
 		 371 aa  154  2e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.499392 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1370  radical SAM domain-containing protein  35.48 
 
 		 373 aa  144  2e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3602  formate acetyltransferase activating enzyme  31.56 
 
 		 345 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.795374  normal  0.163348 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0881  radical SAM domain-containing protein  32.98 
 
 		 374 aa  136  4e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.607875  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0539  radical SAM domain-containing protein  27.56 
 
 		 376 aa  59.7  0.00000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00688869  normal  0.395603 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0731  Radical SAM domain protein  23.96 
 
 		 342 aa  58.5  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00683582  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1712  Radical SAM domain protein  24.07 
 
 		 351 aa  58.2  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.465127  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1999  radical SAM domain-containing protein  24.88 
 
 		 351 aa  54.3  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.156539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0983  radical SAM domain-containing protein  26.05 
 
 		 344 aa  53.1  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16340  pyruvate formate-lyase 1-activating enzyme  27.11 
 
 		 287 aa  52.8  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.243728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2551  pyruvate formate-lyase activating enzyme-like protein  26.01 
 
 		 354 aa  51.6  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.592966  normal  0.73651 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0542  radical SAM domain-containing protein  25.9 
 
 		 384 aa  52.4  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0194035 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1815  radical SAM domain-containing protein  28.79 
 
 		 364 aa  52.4  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4120  radical SAM domain-containing protein  24.44 
 
 		 372 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246389  normal  0.424935 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23160  pyruvate formate-lyase activating enzyme  27.42 
 
 		 247 aa  51.2  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1625  radical SAM domain-containing protein  25.86 
 
 		 363 aa  50.1  0.00005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1455  Radical SAM domain protein  22.57 
 
 		 333 aa  49.7  0.00006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2404  radical SAM family Fe-S protein  22.82 
 
 		 353 aa  49.7  0.00006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0506  pyruvate formate-lyase activating enzyme  23.2 
 
 		 238 aa  49.7  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0339577  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0432  pyruvate formate-lyase activating enzyme  26.88 
 
 		 243 aa  49.3  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1722  pyruvate formate-lyase activating enzyme  26.7 
 
 		 293 aa  49.3  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.461343  normal  0.162758 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1167  radical SAM family protein  27.91 
 
 		 294 aa  48.9  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000619352  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1648  radical SAM domain-containing protein  27.64 
 
 		 363 aa  48.5  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1066  radical SAM domain-containing protein  26.09 
 
 		 333 aa  48.9  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.925022  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2681  Radical SAM domain protein  26.23 
 
 		 314 aa  48.9  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0480916  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1841  Radical SAM domain protein  27.89 
 
 		 340 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0922  radical SAM domain-containing protein  27.17 
 
 		 333 aa  47.8  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0540  radical SAM domain-containing protein  24.72 
 
 		 326 aa  47.8  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0325  Radical SAM domain protein  28.18 
 
 		 333 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1460  radical SAM domain-containing protein  25.37 
 
 		 332 aa  47.4  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0044  Radical SAM domain protein  22.95 
 
 		 343 aa  47.4  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.671161  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1894  pyruvate formate-lyase activating enzyme  28.29 
 
 		 334 aa  46.6  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.703525  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4810  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  25.4 
 
 		 243 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1670  radical SAM domain-containing protein  26.18 
 
 		 339 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0387663  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0189  Radical SAM domain protein  24.32 
 
 		 344 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1701  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  25.67 
 
 		 246 aa  45.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.276107 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0388  Radical SAM domain protein  26.56 
 
 		 339 aa  45.8  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00103201  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2474  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  23.96 
 
 		 245 aa  45.1  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0427  pyruvate formate-lyase activating enzyme  25.81 
 
 		 243 aa  45.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2591  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  25.13 
 
 		 244 aa  43.9  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1618  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  25.13 
 
 		 244 aa  43.9  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.344326  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0425  formate acetyltransferase activating enzyme (pyruvate formate-lyase activating enzyme)  24.34 
 
 		 243 aa  43.9  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0086  radical SAM family protein  23.65 
 
 		 356 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.508004  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0917  Radical SAM domain protein  23.79 
 
 		 324 aa  43.5  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1470  radical SAM domain-containing protein  24.91 
 
 		 342 aa  43.5  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.808287  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0270  radical SAM domain-containing protein  27.17 
 
 		 286 aa  43.9  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2679  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  25.13 
 
 		 265 aa  43.9  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0513  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  24.34 
 
 		 243 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2555  Radical SAM domain protein  23.56 
 
 		 366 aa  43.5  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.466932  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0564  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  24.34 
 
 		 243 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>