243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3417 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3417  Hsp33 protein  100 
 
 
292 aa  595  1e-169  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.235114  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2900  Hsp33 protein  50.69 
 
 
292 aa  310  2e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000174602  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1852  Hsp33 protein  48.61 
 
 
296 aa  295  4e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000569764  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0064  Hsp33-like chaperonin  45.83 
 
 
296 aa  293  3e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0066  Hsp33-like chaperonin  46.88 
 
 
295 aa  292  4e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000194487  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2063  Hsp33-like chaperonin  50.87 
 
 
294 aa  281  7.000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000230176  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0062  Hsp33-like chaperonin  43.94 
 
 
291 aa  281  7.000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1343  Hsp33 protein  44.14 
 
 
294 aa  280  2e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000573361  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24260  disulfide bond chaperone  46.15 
 
 
308 aa  278  6e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2157  Hsp33-like chaperonin  48.28 
 
 
319 aa  278  8e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10630  Hsp33 protein  46.5 
 
 
294 aa  277  1e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000018588  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1868  Hsp33-like chaperonin  48.28 
 
 
316 aa  277  2e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0062  Hsp33-like chaperonin  42.96 
 
 
291 aa  276  2e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0547  Hsp33-like chaperonin  45.42 
 
 
293 aa  276  4e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0534  Hsp33-like chaperonin  45.42 
 
 
293 aa  276  4e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1374  Hsp33 protein  43.06 
 
 
293 aa  271  9e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000113565  hitchhiker  0.0000000423891 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0151  Hsp33-like chaperonin  43.06 
 
 
293 aa  267  1e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5242  Hsp33-like chaperonin  42.91 
 
 
291 aa  263  3e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0777269 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0065  Hsp33-like chaperonin  42.56 
 
 
291 aa  262  6e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0066  Hsp33-like chaperonin  42.56 
 
 
291 aa  262  6e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0062  Hsp33-like chaperonin  42.56 
 
 
291 aa  262  6e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0062  Hsp33-like chaperonin  42.56 
 
 
291 aa  262  6e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0075  Hsp33-like chaperonin  42.56 
 
 
291 aa  262  6e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.05774 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0066  Hsp33-like chaperonin  42.56 
 
 
291 aa  262  6e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.77319  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0078  Hsp33-like chaperonin  42.56 
 
 
291 aa  262  6e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.486635  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0074  Hsp33-like chaperonin  42.56 
 
 
291 aa  261  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.638833  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0950  Hsp33 protein  44.25 
 
 
301 aa  255  6e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000811074  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0755  Hsp33 protein  46.24 
 
 
284 aa  242  5e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1272  Hsp33-like chaperonin  43.49 
 
 
300 aa  239  5e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0269  Hsp33-like chaperonin  42.01 
 
 
306 aa  235  7e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146823  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0041  Hsp33-like chaperonin  40.69 
 
 
301 aa  233  3e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.989456 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1050  Hsp33 protein  41.18 
 
 
295 aa  233  3e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.233043  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0278  Hsp33-like chaperonin  39.38 
 
 
306 aa  232  4.0000000000000004e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.175456  normal  0.0234968 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3348  Hsp33-like chaperonin  41.52 
 
 
301 aa  232  5e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.923438  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3554  Hsp33-like chaperonin  41.58 
 
 
295 aa  231  9e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0204  Hsp33 protein  40.77 
 
 
297 aa  231  1e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.1321  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5185  Hsp33-like chaperonin  41.78 
 
 
299 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000472348 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3620  Hsp33-like chaperonin  40.89 
 
 
295 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3840  Hsp33 protein  38.75 
 
 
294 aa  225  6e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000889682  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0258  Hsp33 protein  39.8 
 
 
297 aa  224  1e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000999551  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2283  Hsp33-like chaperonin  40.07 
 
 
311 aa  224  1e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.92108 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3227  Hsp33-like chaperonin  40.41 
 
 
301 aa  223  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.23939 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2869  Hsp33-like chaperonin  40.41 
 
 
301 aa  223  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2209  Hsp33-like chaperonin  40.42 
 
 
288 aa  221  8e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4200  Hsp33-like chaperonin  39.52 
 
 
301 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.990092  normal  0.212706 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0277  redox-related putative chaperone  37.37 
 
 
288 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1023  Hsp33 protein  38.83 
 
 
301 aa  212  4.9999999999999996e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1824  Hsp33-like chaperonin  37.72 
 
 
291 aa  208  7e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3228  Hsp33 protein  35.76 
 
 
291 aa  206  3e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0230  Hsp33-like chaperonin  36.71 
 
 
288 aa  205  6e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.193861  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0559  Hsp33-like chaperonin  37.33 
 
 
297 aa  202  6e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.136601  normal  0.555659 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2817  Hsp33 protein  38.23 
 
 
308 aa  191  1e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.037414 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0302  Hsp33 protein  37.88 
 
 
287 aa  191  1e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0369  Hsp33 protein  34.47 
 
 
284 aa  188  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0218109  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1435  Hsp33 protein  37.91 
 
 
290 aa  187  1e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1389  Hsp33 protein  37.55 
 
 
290 aa  187  2e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2399  Hsp33 protein  36.99 
 
 
344 aa  183  3e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0405  disulfide bond chaperones of the HSP33 family  35.96 
 
 
297 aa  181  2e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0022  Hsp33 protein  38.91 
 
 
240 aa  180  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0189  disulfide bond chaperones of the HSP33 family  33.1 
 
 
299 aa  180  2.9999999999999997e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.8305  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3383  Hsp33 protein  34.83 
 
 
304 aa  178  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.133262  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15846  predicted protein  36.53 
 
 
291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622688  normal  0.718386 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07221  Hsp33-like chaperonin  34.78 
 
 
299 aa  171  9e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00409809 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0097  Hsp33-like chaperonin  34.78 
 
 
299 aa  170  2e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.708069  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1282  Hsp33-like chaperonin  33.78 
 
 
305 aa  169  5e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1195  Hsp33-like chaperonin  35.31 
 
 
305 aa  169  7e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.688399  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07751  Hsp33-like chaperonin  33.33 
 
 
300 aa  156  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0056735 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07201  Hsp33-like chaperonin  34.11 
 
 
302 aa  157  3e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07381  Hsp33-like chaperonin  32.45 
 
 
300 aa  155  7e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1493  Hsp33 protein  35.79 
 
 
289 aa  155  9e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.364161  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0665  Hsp33-like chaperonin  32.78 
 
 
300 aa  152  7e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.294105  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07181  Hsp33-like chaperonin  32.45 
 
 
302 aa  150  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.244021  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0553  Hsp33 protein  33.45 
 
 
303 aa  138  1e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0449  Hsp33 protein  26.37 
 
 
295 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311517  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0450  Hsp33 protein  26.03 
 
 
295 aa  122  7e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0157  Hsp33 protein  28.75 
 
 
311 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0421  Hsp33 protein  27.05 
 
 
295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.93816  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2554  heat shock protein 34  28.47 
 
 
292 aa  119  6e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4148  Hsp33 protein  25.86 
 
 
294 aa  116  5e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.21226  hitchhiker  0.00565171 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33525  predicted protein  24.66 
 
 
364 aa  110  3e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0367  Hsp33-like chaperonin  23.89 
 
 
295 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0165  Hsp33 protein  26.33 
 
 
294 aa  97.4  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0020  chaperonin HSP33  23.96 
 
 
288 aa  95.1  1e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3626  heat shock protein HSP33  28.29 
 
 
297 aa  95.1  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.72943 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0277  Hsp33-like chaperonin  25.66 
 
 
299 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0252  Hsp33-like chaperonin  25.76 
 
 
299 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0158259 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05430  Hsp33-like chaperonin  25.28 
 
 
297 aa  92.8  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.512374  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0518  Hsp33 protein  27.63 
 
 
288 aa  91.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3487  33 kDa chaperonin  25.87 
 
 
332 aa  92  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0404  Hsp33 protein  27.62 
 
 
331 aa  91.3  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0267  Hsp33-like chaperonin  25.38 
 
 
299 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68610  Hsp33-like chaperonin  26.24 
 
 
297 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5937  Hsp33-like chaperonin  26.34 
 
 
297 aa  89  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2074  Hsp33 protein  24.51 
 
 
289 aa  89  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2980  chaperonin HSP33  26.29 
 
 
289 aa  86.7  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0761  Hsp33-like chaperonin  25.63 
 
 
331 aa  86.7  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.758302  normal  0.0192555 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0334  Hsp33 protein  25.97 
 
 
298 aa  86.3  5e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.107665  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1131  Hsp33 protein  25.81 
 
 
280 aa  85.9  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5257  Hsp33-like chaperonin  25.8 
 
 
351 aa  85.9  7e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526967  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1408  33 kDa chaperonin  25.81 
 
 
280 aa  85.9  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>