61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3368 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_1860  glycoside hydrolase family 48  67.14 
 
 		 1904 aa  903    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.738055  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2957  glycoside hydrolase family protein  52.67 
 
 		 966 aa  655    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3180  glycoside hydrolase family protein  52.59 
 
 		 963 aa  665    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000076749 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2089  glycoside hydrolase family protein  54.43 
 
 		 741 aa  768    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000609917  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  59.9 
 
 		 854 aa  772    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  52.17 
 
 		 984 aa  649    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3368  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  100 
 
 		 919 aa  1883    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00223117  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0729  glycoside hydrolase family 48  60.6 
 
 		 722 aa  912    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000900741  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0071  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  49.89 
 
 		 938 aa  877    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  67.14 
 
 		 1478 aa  907    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1867  glycoside hydrolase family 48  67.14 
 
 		 1759 aa  906    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.217559  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2167  glycoside hydrolase family 48  53.46 
 
 		 974 aa  686    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  54.39 
 
 		 1121 aa  682    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  54.91 
 
 		 973 aa  690    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  52.33 
 
 		 842 aa  704    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1153  glycoside hydrolase family 48  54.59 
 
 		 900 aa  686    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.420841  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  60 
 
 		 979 aa  743    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3105  glycoside hydrolase family 48  52.66 
 
 		 854 aa  670    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0252708  hitchhiker  0.000502295 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2138  family 48 glycoside hydrolase  57.57 
 
 		 785 aa  737    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.497206  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2448  glycoside hydrolase family 48  51.72 
 
 		 894 aa  667    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3367  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  59.2 
 
 		 985 aa  301  4e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2128  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  55.43 
 
 		 857 aa  291  5.0000000000000004e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00114643  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0040  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  59.87 
 
 		 887 aa  194  7e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0404  type 3a, cellulose-binding  55.41 
 
 		 522 aa  172  4e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0894635  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3077  cellulosome anchoring protein, cohesin region  52.8 
 
 		 1853 aa  169  2.9999999999999998e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1865  glycoside hydrolase family 9  55.19 
 
 		 1369 aa  156  1e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.56874  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1866  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase., Cellulase  55.19 
 
 		 1414 aa  156  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1859  glycoside hydrolase family 5  55.63 
 
 		 1294 aa  156  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1853  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  53.9 
 
 		 833 aa  154  8e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0781355  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1491  type 3a cellulose-binding domain protein  49.34 
 
 		 2344 aa  149  3e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0271  type 3a, cellulose-binding  45.27 
 
 		 308 aa  147  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.817907  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  44.38 
 
 		 671 aa  145  3e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0728  cellulosome anchoring protein cohesin region  44.94 
 
 		 1546 aa  138  5e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  43.87 
 
 		 1209 aa  119  3e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  44.44 
 
 		 1298 aa  117  6.9999999999999995e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  43.79 
 
 		 678 aa  117  6.9999999999999995e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0179  PHB depolymerase family esterase  43.79 
 
 		 656 aa  117  8.999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.18087  normal  0.428012 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  44.52 
 
 		 1137 aa  117  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  43.87 
 
 		 763 aa  116  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0460  glycoside hydrolase family 9  42 
 
 		 1017 aa  110  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1648  glycoside hydrolase family 9  41.22 
 
 		 949 aa  110  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2337  glycoside hydrolase family 5  38.41 
 
 		 505 aa  110  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.422091  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9095  hypothetical protein  38.93 
 
 		 467 aa  109  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2360  glycoside hydrolase family protein  40.85 
 
 		 928 aa  107  8e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2612  glycoside hydrolase family 5  37.75 
 
 		 505 aa  107  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.125365  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7202  type 3a cellulose-binding domain protein  39.13 
 
 		 473 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.601323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  35.58 
 
 		 1013 aa  100  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1257  carbohydrate-binding, CenC-like protein  33.99 
 
 		 1050 aa  99.8  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2760  glycoside hydrolase family protein  38.93 
 
 		 961 aa  98.6  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26535  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2712  cellulase  35.95 
 
 		 619 aa  97.4  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0059  type 3a, cellulose-binding  42.22 
 
 		 486 aa  93.2  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0360636  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1071  glycoside hydrolase family protein  37.09 
 
 		 728 aa  90.1  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.535323  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  34.48 
 
 		 1224 aa  83.6  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  41.57 
 
 		 1030 aa  81.3  0.00000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2147  glycoside hydrolase family protein  28.27 
 
 		 660 aa  80.9  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1642  type 3a cellulose-binding domain protein  31.85 
 
 		 658 aa  76.3  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.117524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1076  Ig-like domain-containing protein  36.26 
 
 		 1937 aa  57.4  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.659713  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0379  protein of unknown function DUF291  30.3 
 
 		 732 aa  53.9  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2423  hypothetical protein  31.01 
 
 		 998 aa  47.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0623  protein of unknown function DUF291  30.34 
 
 		 2205 aa  44.3  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.578825  unclonable  0.00000000542423 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2889  protein of unknown function DUF291  28.57 
 
 		 1672 aa  44.3  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>