More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3366 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3366  ATPase  100 
 
 
316 aa  650    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1709  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.29 
 
 
321 aa  348  6e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0280  ATPase  50.81 
 
 
312 aa  338  5.9999999999999996e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.760866  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1054  ATPase  48.42 
 
 
318 aa  335  7.999999999999999e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.84 
 
 
319 aa  329  3e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2936  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.78 
 
 
341 aa  328  8e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000363093  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1397  ATPase  51.31 
 
 
326 aa  322  5e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.464074  normal  0.0203934 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0692  ATPase  50.16 
 
 
323 aa  322  5e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5776  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.61 
 
 
354 aa  322  6e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.895461  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0622  ATPase  49.03 
 
 
327 aa  321  8e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3181  MoxR protein  49.67 
 
 
320 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2134  MoxR protein  49.67 
 
 
320 aa  319  3e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25030  MoxR-like ATPase  51.62 
 
 
359 aa  318  5e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.958569  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2157  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  50.17 
 
 
320 aa  317  2e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1953  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  49.5 
 
 
320 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19020  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.85 
 
 
313 aa  313  1.9999999999999998e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1210  ATPase  50.83 
 
 
372 aa  313  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.215297  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0886  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.03 
 
 
330 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2274  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  49.66 
 
 
320 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.83 
 
 
318 aa  312  3.9999999999999997e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1929  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  49.16 
 
 
320 aa  311  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788825  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1183  ATPase  46.38 
 
 
309 aa  311  6.999999999999999e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.247758  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1968  ATPase  49.66 
 
 
320 aa  311  9e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0928  ATPase  49.35 
 
 
314 aa  311  1e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0210  ATPase  48.86 
 
 
347 aa  311  1e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.283743  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1651  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.01 
 
 
356 aa  310  2e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54142 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2560  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.87 
 
 
315 aa  309  2.9999999999999997e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.050472  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1592  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.73 
 
 
325 aa  308  6.999999999999999e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.488895  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1431  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.84 
 
 
309 aa  306  3e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0802  ATPase  46.38 
 
 
317 aa  306  4.0000000000000004e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3232  ATPase  47.77 
 
 
350 aa  304  1.0000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0360468 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0494  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.04 
 
 
313 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0049  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.59 
 
 
319 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2815  ATPase  47.87 
 
 
309 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0187  ATPase  47.51 
 
 
313 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2538  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.92 
 
 
314 aa  302  5.000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2205  hypothetical protein  49.5 
 
 
320 aa  300  1e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277828  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3458  ATPase  48.84 
 
 
350 aa  301  1e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0164  ATPase  47.19 
 
 
319 aa  299  3e-80  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0345  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.86 
 
 
310 aa  300  3e-80  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.898086  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3015  hypothetical protein  47.87 
 
 
309 aa  299  4e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2860  methanol dehydrogenase regulatory protein  50.17 
 
 
325 aa  299  4e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.692572  normal  0.660052 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1974  hypothetical protein  49.16 
 
 
296 aa  299  5e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2122  hypothetical protein  49.16 
 
 
296 aa  299  5e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3052  hypothetical protein  46.89 
 
 
309 aa  297  1e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2227  hypothetical protein  47.87 
 
 
309 aa  297  1e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.837362  hitchhiker  0.00000000223173 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2754  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  46.89 
 
 
309 aa  296  4e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00295405  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3014  hypothetical protein  46.89 
 
 
309 aa  296  4e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0435671 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2735  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  47.21 
 
 
309 aa  295  5e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2803  hypothetical protein  46.89 
 
 
309 aa  295  6e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183805  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3016  hypothetical protein  46.89 
 
 
309 aa  295  6e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1586  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.16 
 
 
332 aa  295  8e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.766852 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3053  hypothetical protein  46.56 
 
 
309 aa  294  1e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.631245  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1359  ATPase  48.84 
 
 
310 aa  294  1e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.020418  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05630  MoxR-like ATPase  49.51 
 
 
331 aa  294  1e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.609898  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1000  ATPase  51.19 
 
 
332 aa  292  4e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.270469 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0438  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.59 
 
 
316 aa  291  8e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2106  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.75 
 
 
326 aa  291  9e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0941  ATPase  46.25 
 
 
308 aa  291  1e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3073  ATPase  50.84 
 
 
324 aa  290  2e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.205207  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1280  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.84 
 
 
383 aa  289  5.0000000000000004e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000592788 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3936  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.38 
 
 
337 aa  289  5.0000000000000004e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.528453  normal  0.396618 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2912  ATPase  45.31 
 
 
331 aa  289  5.0000000000000004e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0275816  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09798  magnesium chelatase, subunit I, putative ATPase  45.67 
 
 
340 aa  289  5.0000000000000004e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3171  magnesium chelatase, ChlI subunit; methanol dehydrogenase regulator  43.97 
 
 
309 aa  287  2e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0634  ATPase  47.19 
 
 
324 aa  287  2e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00000306223  normal  0.419184 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2119  magnesium chelatase, ChlI subunit  45.36 
 
 
302 aa  286  2e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0704  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.02 
 
 
314 aa  286  2e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0320  ATPase  44.88 
 
 
310 aa  286  2e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5108  ATPase  51.24 
 
 
342 aa  286  2.9999999999999996e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.34364  normal  0.11344 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3184  ATPase  44.76 
 
 
318 aa  286  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2529  AAA_3 ATPase  48.67 
 
 
306 aa  286  4e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2197  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.84 
 
 
318 aa  285  5e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.451133  decreased coverage  0.00303676 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2824  AAA family ATPase  45.7 
 
 
310 aa  285  5.999999999999999e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0314282  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3038  AAA family ATPase  45.7 
 
 
310 aa  285  5.999999999999999e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.392336  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1100  putative regulatory protein  46.89 
 
 
328 aa  285  9e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.916979  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0237  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.75 
 
 
325 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1274  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.45 
 
 
351 aa  284  1.0000000000000001e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.150646  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3146  ATPase  47.52 
 
 
306 aa  284  2.0000000000000002e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.109548 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3112  ATPase  45.02 
 
 
331 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0335747 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2136  MoxR-like ATPase, regulator  43.19 
 
 
326 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4915  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.63 
 
 
335 aa  283  2.0000000000000002e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.487273  normal  0.572673 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3911  methanol dehydrogenase regulatory protein  45.42 
 
 
325 aa  283  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0358591  normal  0.240116 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0216  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.74 
 
 
302 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0316575  normal  0.204344 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8515  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.1 
 
 
327 aa  283  4.0000000000000003e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  0.0546803 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0813  ATPase  48.93 
 
 
310 aa  282  5.000000000000001e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4014  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.25 
 
 
312 aa  282  5.000000000000001e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2229  ATPase  42.39 
 
 
337 aa  282  5.000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2518  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.6 
 
 
342 aa  281  1e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2773  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  44.7 
 
 
310 aa  280  3e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0680478  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2759  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  45.03 
 
 
309 aa  279  3e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3487  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.16 
 
 
324 aa  279  4e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1478  ATPase  43.77 
 
 
340 aa  279  4e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000160729  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3073  AAA family ATPase  44.7 
 
 
310 aa  279  5e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.209671  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1399  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.56 
 
 
306 aa  279  5e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1369  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.56 
 
 
306 aa  279  5e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0032  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.55 
 
 
318 aa  279  5e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.062228  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2530  ATPase  47.79 
 
 
303 aa  278  6e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3068  ATPase, AAA family  44.37 
 
 
310 aa  279  6e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0718148  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3034  ATPase, AAA family  44.7 
 
 
310 aa  278  9e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>