More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3347 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0303  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  59.89 
 
 
559 aa  693    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.296158  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2714  acetolactate synthase, large subunit  64.21 
 
 
555 aa  724    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0666  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  59.93 
 
 
552 aa  692    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3347  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  100 
 
 
561 aa  1160    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.18132  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  57.58 
 
 
554 aa  644    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0590  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  54.56 
 
 
553 aa  617  1e-175  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000684717  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  54.05 
 
 
588 aa  613  9.999999999999999e-175  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0281  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  53.33 
 
 
554 aa  608  1e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0710  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  53.41 
 
 
563 aa  611  1e-173  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0408  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  52.85 
 
 
562 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  55.15 
 
 
552 aa  608  9.999999999999999e-173  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1910  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  51.87 
 
 
565 aa  600  1e-170  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1260  acetolactate synthase, large subunit  50.98 
 
 
566 aa  595  1e-169  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00775476  hitchhiker  0.00000116322 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3720  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  51.25 
 
 
566 aa  597  1e-169  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104335  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1911  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  51.07 
 
 
566 aa  591  1e-167  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500204  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10830  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  53.08 
 
 
555 aa  588  1e-167  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1592  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  52.87 
 
 
569 aa  588  1e-167  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2037  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  52.14 
 
 
564 aa  586  1e-166  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182642  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0153  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  51.96 
 
 
562 aa  586  1e-166  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1903  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  52.14 
 
 
563 aa  587  1e-166  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0110  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  53.62 
 
 
557 aa  587  1e-166  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1662  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  50.88 
 
 
564 aa  588  1e-166  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1495  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  49.82 
 
 
566 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.433241 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0352  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  53.18 
 
 
556 aa  579  1e-164  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1070  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  52.36 
 
 
558 aa  578  1e-164  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0531725  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2746  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  49.47 
 
 
566 aa  579  1e-164  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2982  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  50 
 
 
572 aa  578  1e-164  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000024883  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3024  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  50 
 
 
572 aa  578  1e-164  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000501065  normal  0.146294 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2558  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  49.47 
 
 
566 aa  580  1e-164  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0505809  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1692  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  50.53 
 
 
563 aa  581  1e-164  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_737  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  51.97 
 
 
569 aa  575  1.0000000000000001e-163  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00716267  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2168  acetolactate synthase, large subunit  50.63 
 
 
562 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2503  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  50.36 
 
 
566 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000132944  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2146  acetolactate synthase large subunit  50.27 
 
 
562 aa  577  1.0000000000000001e-163  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0898  acetolactate synthase, large subunit  49.2 
 
 
564 aa  575  1.0000000000000001e-163  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3617  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  48.93 
 
 
563 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000692831  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0833  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  51.61 
 
 
569 aa  571  1e-161  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.469559  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0752  acetolactate synthase, large subunit  51.43 
 
 
569 aa  570  1e-161  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0892  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  49.02 
 
 
581 aa  566  1e-160  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.806334  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0745  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  49.02 
 
 
581 aa  566  1e-160  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.425404  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0605  acetolactate synthase, large subunit  52.6 
 
 
567 aa  565  1e-160  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0231  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  49.64 
 
 
582 aa  561  1.0000000000000001e-159  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329619  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2216  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  51.79 
 
 
557 aa  560  1e-158  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  52.17 
 
 
563 aa  560  1e-158  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1443  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  52.08 
 
 
559 aa  560  1e-158  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0306105  hitchhiker  0.00417959 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0372  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  48.09 
 
 
581 aa  558  1e-157  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0389  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  48.28 
 
 
581 aa  557  1e-157  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.143896  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0594  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  48.38 
 
 
557 aa  553  1e-156  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000784156  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1851  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  49.54 
 
 
573 aa  550  1e-155  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842705  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1707  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  49.82 
 
 
571 aa  551  1e-155  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2843  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  48.3 
 
 
587 aa  550  1e-155  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1296  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  47.76 
 
 
563 aa  550  1e-155  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1063  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  49.11 
 
 
595 aa  547  1e-154  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.722606  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0753  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  47.85 
 
 
587 aa  545  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1666  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  49.91 
 
 
570 aa  548  1e-154  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1848  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  47.85 
 
 
587 aa  545  1e-154  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1274  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  47.85 
 
 
587 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0396  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  47.85 
 
 
587 aa  545  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1419  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  47.85 
 
 
587 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2520  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  47.42 
 
 
582 aa  546  1e-154  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1877  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  47.46 
 
 
636 aa  545  1e-154  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000157707 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3491  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  49.36 
 
 
571 aa  548  1e-154  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0139  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  48.65 
 
 
612 aa  548  1e-154  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1281  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  47.85 
 
 
587 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1045  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  47.85 
 
 
587 aa  545  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.160852  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1187  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  49.37 
 
 
557 aa  548  1e-154  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1902  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  47.27 
 
 
566 aa  546  1e-154  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000354639  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1113  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  47.85 
 
 
587 aa  545  1e-154  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1714  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  49.17 
 
 
570 aa  543  1e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1691  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  49.36 
 
 
570 aa  544  1e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1328  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  47.67 
 
 
587 aa  541  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0958781 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1888  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  49.17 
 
 
570 aa  543  1e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1850  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  49.17 
 
 
570 aa  543  1e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0722574  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1966  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  49.72 
 
 
571 aa  544  1e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.107455  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2893  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  49.02 
 
 
592 aa  544  1e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0020584 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0284  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  47.48 
 
 
555 aa  543  1e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0741  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  49.65 
 
 
573 aa  545  1e-153  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0105  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  48.39 
 
 
568 aa  541  1e-153  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.180923  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0544  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  48.66 
 
 
602 aa  542  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2270  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  46.89 
 
 
576 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0947  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  48.05 
 
 
587 aa  540  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2401  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  51.45 
 
 
558 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0911  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  48.76 
 
 
587 aa  539  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1934  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  48.99 
 
 
571 aa  537  1e-151  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08850  acetolactate synthase, large subunit  47.26 
 
 
623 aa  538  1e-151  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.369585  normal  0.232213 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1141  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  46.58 
 
 
565 aa  536  1e-151  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1165  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  48.11 
 
 
561 aa  537  1e-151  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3554  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  49.03 
 
 
581 aa  535  1e-151  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.743835  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1389  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  46.21 
 
 
584 aa  535  1e-150  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0317493  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0810  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  47.86 
 
 
595 aa  533  1e-150  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.845021  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2757  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  48.21 
 
 
632 aa  533  1e-150  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.928665  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7782  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  47.11 
 
 
586 aa  534  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.340574 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1346  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  46.03 
 
 
584 aa  532  1e-150  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0313448  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2256  acetolactate synthase, large subunit  48.28 
 
 
560 aa  533  1e-150  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1886  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  48.42 
 
 
619 aa  532  1e-150  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0490387  normal  0.105007 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0875  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  46.98 
 
 
583 aa  533  1e-150  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.840064  normal  0.16884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1906  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  48.42 
 
 
619 aa  532  1e-150  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.365234  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2981  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  45.95 
 
 
556 aa  531  1e-150  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0018312  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0816  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  48.64 
 
 
558 aa  533  1e-150  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1952  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  48.42 
 
 
619 aa  532  1e-150  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.338885  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>