More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3324 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 
470 aa  970    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  59.02 
 
 
466 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  56.6 
 
 
468 aa  561  1.0000000000000001e-159  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  56.48 
 
 
465 aa  559  1e-158  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0154063  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0120  cysteinyl-tRNA synthetase  56.48 
 
 
465 aa  558  1e-157  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252042  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0089  cysteinyl-tRNA synthetase  56.05 
 
 
465 aa  555  1e-157  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  56.05 
 
 
465 aa  555  1e-157  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00483591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0085  cysteinyl-tRNA synthetase  56.05 
 
 
465 aa  555  1e-157  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  56.05 
 
 
465 aa  555  1e-157  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000157643  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  56.05 
 
 
465 aa  555  1e-157  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.67266e-60 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  56.48 
 
 
465 aa  555  1e-157  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  55.11 
 
 
466 aa  549  1e-155  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  54.99 
 
 
466 aa  547  1e-154  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  55.84 
 
 
465 aa  547  1e-154  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000240351  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  55.2 
 
 
465 aa  544  1e-153  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  54.8 
 
 
466 aa  544  1e-153  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0110  cysteinyl-tRNA synthetase  56.26 
 
 
465 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.033401  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5216  cysteinyl-tRNA synthetase  55.84 
 
 
465 aa  535  1e-151  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00001018  unclonable  2.47403e-25 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0552  cysteinyl-tRNA synthetase  52.01 
 
 
466 aa  525  1e-148  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  52.01 
 
 
466 aa  525  1e-148  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0170  cysteinyl-tRNA synthetase  51.59 
 
 
466 aa  518  1.0000000000000001e-145  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.183538  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  53.93 
 
 
466 aa  513  1e-144  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0303  cysteinyl-tRNA synthetase  52.62 
 
 
470 aa  507  9.999999999999999e-143  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209155  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  51.43 
 
 
486 aa  501  1e-141  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0171  cysteinyl-tRNA synthetase  51.49 
 
 
469 aa  504  1e-141  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000554263  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1645  cysteinyl-tRNA synthetase  54.22 
 
 
472 aa  499  1e-140  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0256229  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  48.32 
 
 
468 aa  501  1e-140  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  49.28 
 
 
493 aa  498  1e-140  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  49.69 
 
 
494 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  49.17 
 
 
481 aa  483  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  50.41 
 
 
485 aa  481  1e-134  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2732  cysteinyl-tRNA synthetase  50.21 
 
 
474 aa  481  1e-134  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.511576  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  49.18 
 
 
480 aa  481  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0338  cysteinyl-tRNA synthetase  50.21 
 
 
472 aa  478  1e-134  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000985703  hitchhiker  0.00000017831 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0265  cysteinyl-tRNA synthetase  46.39 
 
 
500 aa  477  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000351954  normal  0.0179812 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  48.13 
 
 
480 aa  478  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0398  cysteinyl-tRNA synthetase  48.95 
 
 
477 aa  473  1e-132  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000244083  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  45.79 
 
 
487 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0162  cysteinyl-tRNA synthetase  48.63 
 
 
468 aa  471  1.0000000000000001e-131  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.296388  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  45.53 
 
 
474 aa  465  9.999999999999999e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0188  cysteinyl-tRNA synthetase  47.51 
 
 
478 aa  467  9.999999999999999e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.272447  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0117  cysteinyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 
447 aa  465  9.999999999999999e-131  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0415  cysteinyl-tRNA synthetase  47.94 
 
 
490 aa  466  9.999999999999999e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148475  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0207  cysteinyl-tRNA synthetase  48.31 
 
 
447 aa  461  1e-129  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  46.94 
 
 
481 aa  464  1e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2484  cysteinyl-tRNA synthetase  47.17 
 
 
476 aa  464  1e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000672423  normal  0.0231509 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1952  cysteinyl-tRNA synthetase  47.55 
 
 
485 aa  462  1e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00515246  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1181  cysteinyl-tRNA synthetase  45.14 
 
 
493 aa  459  9.999999999999999e-129  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00250228  hitchhiker  0.0000333718 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2121  cysteinyl-tRNA synthetase  47.44 
 
 
485 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00371034  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0482  cysteinyl-tRNA synthetase  46.63 
 
 
485 aa  458  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00357659 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1554  cysteinyl-tRNA synthetase  46.31 
 
 
485 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2043  cysteinyl-tRNA synthetase  49.36 
 
 
448 aa  459  9.999999999999999e-129  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1559  cysteinyl-tRNA synthetase  48.54 
 
 
467 aa  459  9.999999999999999e-129  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  46.86 
 
 
459 aa  461  9.999999999999999e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2249  cysteine--tRNA ligase  45.03 
 
 
485 aa  456  1e-127  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000746597  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3653  cysteinyl-tRNA synthetase  49.36 
 
 
465 aa  458  1e-127  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0537  cysteinyl-tRNA synthetase  45.19 
 
 
485 aa  455  1e-127  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  46.97 
 
 
485 aa  454  1.0000000000000001e-126  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  46.44 
 
 
460 aa  451  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00960  cysteinyl-tRNA synthetase  46.17 
 
 
484 aa  449  1e-125  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000845689  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2722  cysteinyl-tRNA synthetase  45.42 
 
 
486 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.688362 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  47.29 
 
 
465 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  46.01 
 
 
479 aa  448  1.0000000000000001e-124  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  43.56 
 
 
493 aa  446  1.0000000000000001e-124  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1589  cysteinyl-tRNA synthetase  46.29 
 
 
487 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.354492  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19450  cysteinyl-tRNA synthetase  46.08 
 
 
498 aa  445  1.0000000000000001e-124  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000839474 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  46.67 
 
 
463 aa  443  1e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3036  cysteinyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 
478 aa  445  1e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  47.15 
 
 
455 aa  443  1e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  48.54 
 
 
459 aa  442  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  47.69 
 
 
459 aa  444  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000025745  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1447  cysteinyl-tRNA synthetase  44.99 
 
 
483 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0923  cysteinyl-tRNA synthetase  47.57 
 
 
456 aa  441  9.999999999999999e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1084  cysteinyl-tRNA synthetase  45.7 
 
 
454 aa  437  1e-121  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.462524  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  46.44 
 
 
459 aa  435  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1662  cysteinyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 
478 aa  435  1e-121  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.69895  normal  0.620733 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0635  cysteinyl-tRNA synthetase  47.85 
 
 
457 aa  435  1e-121  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  47.27 
 
 
459 aa  437  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2138  cysteinyl-tRNA synthetase  45.74 
 
 
478 aa  434  1e-120  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2571  cysteinyl-tRNA synthetase  46.04 
 
 
461 aa  434  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897166  hitchhiker  0.0000307026 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  45.72 
 
 
461 aa  432  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  45.72 
 
 
461 aa  432  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1263  cysteinyl-tRNA synthetase  45.81 
 
 
505 aa  434  1e-120  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.227331  normal  0.0688568 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  45.55 
 
 
459 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  45.09 
 
 
459 aa  428  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  44.84 
 
 
456 aa  429  1e-119  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  45.09 
 
 
459 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2051  cysteinyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 
461 aa  431  1e-119  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0707347  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1003  cysteinyl-tRNA synthetase  45.57 
 
 
488 aa  430  1e-119  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3108  cysteinyl-tRNA synthetase  45.47 
 
 
466 aa  430  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00597205  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1599  cysteinyl-tRNA synthetase  46.85 
 
 
476 aa  429  1e-119  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00000906806  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  45.3 
 
 
459 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  45.82 
 
 
461 aa  429  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000406523  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  45.76 
 
 
461 aa  428  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000012906  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0208  cysteinyl-tRNA synthetase  47.35 
 
 
460 aa  425  1e-118  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1361  cysteinyl-tRNA synthetase  45.44 
 
 
488 aa  427  1e-118  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2110  cysteinyl-tRNA synthetase  46.38 
 
 
460 aa  426  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000230638 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1345  cysteinyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 
461 aa  426  1e-118  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164999  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0064  cysteinyl-tRNA synthetase  45.99 
 
 
469 aa  427  1e-118  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00940017  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  44.56 
 
 
459 aa  427  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>