More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3274 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3274  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 412 aa  851    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000462006  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  70.24 
 
 		 413 aa  590  1e-167  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  66.83 
 
 		 412 aa  582  1.0000000000000001e-165  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  66.83 
 
 		 412 aa  578  1e-164  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3162  serine hydroxymethyltransferase  70.37 
 
 		 413 aa  568  1e-161  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  67.8 
 
 		 415 aa  569  1e-161  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  67.41 
 
 		 411 aa  552  1e-156  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  64.96 
 
 		 410 aa  541  1e-153  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4177  serine hydroxymethyltransferase  65.43 
 
 		 413 aa  541  1e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  65.19 
 
 		 412 aa  539  9.999999999999999e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  64.41 
 
 		 417 aa  541  9.999999999999999e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  64.72 
 
 		 410 aa  538  9.999999999999999e-153  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  64.79 
 
 		 415 aa  537  1e-151  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  64.55 
 
 		 414 aa  535  1e-151  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  64.55 
 
 		 414 aa  535  1e-151  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  64.08 
 
 		 413 aa  535  1e-151  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  64.08 
 
 		 413 aa  535  1e-151  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  63.59 
 
 		 420 aa  534  1e-151  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  64.06 
 
 		 418 aa  536  1e-151  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  64.08 
 
 		 413 aa  536  1e-151  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  63.83 
 
 		 413 aa  534  1e-150  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  64.3 
 
 		 414 aa  533  1e-150  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  64.55 
 
 		 415 aa  532  1e-150  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  64.79 
 
 		 415 aa  531  1e-150  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  64.79 
 
 		 415 aa  532  1e-150  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2392  glycine hydroxymethyltransferase  62.8 
 
 		 415 aa  531  1e-150  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  63.83 
 
 		 413 aa  533  1e-150  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  64.08 
 
 		 413 aa  534  1e-150  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  64.55 
 
 		 413 aa  531  1e-150  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  64.55 
 
 		 415 aa  528  1e-149  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1185  serine hydroxymethyltransferase  62.2 
 
 		 417 aa  530  1e-149  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  64.53 
 
 		 412 aa  528  1e-149  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  64.44 
 
 		 416 aa  530  1e-149  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  63.81 
 
 		 413 aa  528  1e-149  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  64.53 
 
 		 412 aa  528  1e-149  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  63.35 
 
 		 413 aa  529  1e-149  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  63.55 
 
 		 412 aa  525  1e-148  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1557  serine hydroxymethyltransferase  62.41 
 
 		 417 aa  527  1e-148  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1854  serine hydroxymethyltransferase  64.32 
 
 		 412 aa  526  1e-148  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2390  serine hydroxymethyltransferase  62.47 
 
 		 416 aa  527  1e-148  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0832592 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0573  serine hydroxymethyltransferase  62.04 
 
 		 417 aa  525  1e-148  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1094  serine hydroxymethyltransferase  60.98 
 
 		 417 aa  525  1e-148  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.383314 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1160  serine hydroxymethyltransferase  61.22 
 
 		 417 aa  526  1e-148  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  61.89 
 
 		 412 aa  525  1e-148  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3097  serine hydroxymethyltransferase  64.65 
 
 		 412 aa  525  1e-148  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175089 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1094  serine hydroxymethyltransferase  61.22 
 
 		 417 aa  526  1e-148  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.412028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2780  serine hydroxymethyltransferase  60.98 
 
 		 417 aa  522  1e-147  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04405  serine hydroxymethyltransferase  64.16 
 
 		 417 aa  521  1e-147  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0902  serine hydroxymethyltransferase  60.78 
 
 		 416 aa  521  1e-147  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3471  serine hydroxymethyltransferase  60.98 
 
 		 417 aa  524  1e-147  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1851  serine hydroxymethyltransferase  64.23 
 
 		 417 aa  523  1e-147  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2147  glycine hydroxymethyltransferase  62.87 
 
 		 415 aa  523  1e-147  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0686  serine hydroxymethyltransferase  60.86 
 
 		 424 aa  523  1e-147  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1871  Glycine hydroxymethyltransferase  62.22 
 
 		 417 aa  521  1e-147  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0163056  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  63.01 
 
 		 422 aa  522  1e-147  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1033  serine hydroxymethyltransferase  60.98 
 
 		 417 aa  522  1e-147  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414818  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3094  glycine hydroxymethyltransferase  61.73 
 
 		 417 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3305  serine hydroxymethyltransferase  60.49 
 
 		 417 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.297219  hitchhiker  0.000907019 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2083  serine hydroxymethyltransferase  61.35 
 
 		 418 aa  518  1e-146  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.112354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1912  serine hydroxymethyltransferase  63.71 
 
 		 430 aa  521  1e-146  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.637321  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0209  serine hydroxymethyltransferase  61.58 
 
 		 427 aa  518  1e-146  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0207  serine hydroxymethyltransferase  61.58 
 
 		 427 aa  518  1e-146  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  61.73 
 
 		 417 aa  520  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  63.79 
 
 		 415 aa  518  1e-146  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1014  serine hydroxymethyltransferase  60.98 
 
 		 417 aa  520  1e-146  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2659  serine hydroxymethyltransferase  63.02 
 
 		 440 aa  518  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.719136  normal  0.877467 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1142  serine hydroxymethyltransferase  60.24 
 
 		 417 aa  521  1e-146  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.510367  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3162  serine hydroxymethyltransferase  60.49 
 
 		 417 aa  519  1e-146  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.911286  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1134  serine hydroxymethyltransferase  62.47 
 
 		 437 aa  518  1e-146  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2530  serine hydroxymethyltransferase  62.47 
 
 		 439 aa  518  1e-146  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1209  serine hydroxymethyltransferase  60.49 
 
 		 417 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2762  serine hydroxymethyltransferase  59.71 
 
 		 417 aa  514  1.0000000000000001e-145  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2075  serine hydroxymethyltransferase  61.39 
 
 		 415 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1177  serine hydroxymethyltransferase  61.89 
 
 		 432 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0289619  normal  0.140013 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2668  serine hydroxymethyltransferase  61.39 
 
 		 415 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3250  serine hydroxymethyltransferase  61.39 
 
 		 415 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3161  serine hydroxymethyltransferase  60.24 
 
 		 417 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.261571  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1942  serine hydroxymethyltransferase  61.39 
 
 		 415 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1379  serine hydroxymethyltransferase  61.88 
 
 		 415 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0834  serine hydroxymethyltransferase  61.39 
 
 		 415 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3196  serine hydroxymethyltransferase  61.39 
 
 		 415 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3234  serine hydroxymethyltransferase  61.39 
 
 		 415 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0499  serine hydroxymethyltransferase  60.29 
 
 		 417 aa  516  1.0000000000000001e-145  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.757005  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1344  serine hydroxymethyltransferase  61.2 
 
 		 417 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.538197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0816  serine hydroxymethyltransferase  61.5 
 
 		 431 aa  511  1e-144  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.38724 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2477  serine hydroxymethyltransferase  59.28 
 
 		 417 aa  513  1e-144  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0765  serine hydroxymethyltransferase  62 
 
 		 438 aa  511  1e-144  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0461  serine hydroxymethyltransferase  60.62 
 
 		 417 aa  513  1e-144  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1025  serine hydroxymethyltransferase  61.12 
 
 		 422 aa  512  1e-144  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0071  Glycine hydroxymethyltransferase  61.65 
 
 		 417 aa  511  1e-144  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.30135  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4712  serine hydroxymethyltransferase  60.43 
 
 		 417 aa  514  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0290  serine hydroxymethyltransferase  60.82 
 
 		 418 aa  512  1e-144  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2927  serine hydroxymethyltransferase  59.51 
 
 		 415 aa  514  1e-144  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1266  serine hydroxymethyltransferase  61.17 
 
 		 432 aa  513  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0458809  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2634  serine hydroxymethyltransferase  62.04 
 
 		 433 aa  512  1e-144  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2671  serine hydroxymethyltransferase  62.29 
 
 		 433 aa  514  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1225  serine hydroxymethyltransferase  61.56 
 
 		 433 aa  513  1e-144  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0841  glycine hydroxymethyltransferase  60.05 
 
 		 417 aa  513  1e-144  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.33053  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0417  serine hydroxymethyltransferase  60.39 
 
 		 420 aa  508  1e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1917  serine hydroxymethyltransferase  59.76 
 
 		 430 aa  508  1e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.584505  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>