More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3263 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3263  HAD family hydrolase  100 
 
 
216 aa  435  1e-121  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1212  hypothetical protein  47.37 
 
 
219 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0173059  normal  0.0170431 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2202  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  47.87 
 
 
221 aa  189  4e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.958257  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3123  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  47.87 
 
 
221 aa  188  4e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0025393 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0092  HAD family hydrolase  47.21 
 
 
216 aa  186  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1139  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  45.24 
 
 
217 aa  183  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.652563  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1248  putative phosphatase  48.76 
 
 
245 aa  181  5.0000000000000004e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0320167  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1301  HAD superfamily hydrolase  48.26 
 
 
217 aa  180  2e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.193279  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0109  HAD family hydrolase  45.24 
 
 
224 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000398417 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2045  HAD family hydrolase  46.15 
 
 
225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143641  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2250  HAD superfamily hydrolase  45.97 
 
 
221 aa  179  4e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17199  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2003  phosphoglycolate phosphatase  46.45 
 
 
221 aa  179  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.196564  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2064  HAD superfamily hydrolase  45.5 
 
 
221 aa  177  7e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2220  HAD superfamily hydrolase  45.5 
 
 
221 aa  177  7e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2248  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  45.5 
 
 
221 aa  177  8e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.2381099999999995e-27 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2332  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  45.97 
 
 
221 aa  177  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150125  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0112  HAD family hydrolase  43.81 
 
 
224 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0709114  normal  0.0897877 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4333  HAD family hydrolase  45.97 
 
 
218 aa  175  5e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0094  HAD superfamily hydrolase  43.81 
 
 
216 aa  175  6e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0048007 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2004  phosphoglycolate phosphatase  45.02 
 
 
221 aa  174  7e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000935232  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0109  HAD family hydrolase  43.81 
 
 
237 aa  174  8e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0065  hypothetical protein  44.44 
 
 
221 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00770  hypothetical protein  44.44 
 
 
221 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35600  predicted phosphatase  39.81 
 
 
220 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4457  HAD family hydrolase  42.13 
 
 
215 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1720  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  41.55 
 
 
222 aa  159  4e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.739414  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3203  hydrolase  41.04 
 
 
220 aa  156  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1452  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  38.62 
 
 
231 aa  145  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.546355 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0364  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  38.24 
 
 
229 aa  145  3e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.946559  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2445  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  40.29 
 
 
232 aa  145  5e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0477823 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3215  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.16 
 
 
217 aa  140  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.246246 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2284  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  37.32 
 
 
223 aa  132  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0209  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  34.6 
 
 
235 aa  129  3e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.415502  normal  0.0513274 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0025  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein  34.62 
 
 
219 aa  129  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.412211  normal  0.132054 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2285  phosphatases  36.06 
 
 
221 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.812545  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12262  hypothetical protein  36.96 
 
 
291 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1821  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.48 
 
 
238 aa  126  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000701178 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1536  haloacid dehalogenase-like hydrolase  36.55 
 
 
223 aa  125  5e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.344514  normal  0.620103 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2889  HAD family hydrolase  38.5 
 
 
228 aa  125  7e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.119829  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2643  HAD family hydrolase  35.92 
 
 
227 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735097  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2080  hydrolase  35.27 
 
 
231 aa  124  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.025582  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02117  indigoidine synthesis like protein  36.08 
 
 
214 aa  122  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2535  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  33.01 
 
 
220 aa  122  6e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3357  HAD family hydrolase  36.76 
 
 
225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.563769  normal  0.442665 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3346  HAD family hydrolase  36.76 
 
 
225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.307883  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0174  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  40 
 
 
221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000420461  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3408  HAD family hydrolase  36.76 
 
 
225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.155839  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3098  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.89 
 
 
228 aa  119  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0621452  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0956  phosphatase, putative  32.86 
 
 
211 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000103613  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1453  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.86 
 
 
228 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.781565 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3458  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.13 
 
 
252 aa  115  6e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00396228  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2186  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  33.02 
 
 
221 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0760  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.17 
 
 
220 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.133542 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3621  HAD family hydrolase  35.98 
 
 
228 aa  109  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0795  haloacid dehalogenase-like hydrolase  32.29 
 
 
244 aa  107  1e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0568  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  31.79 
 
 
226 aa  106  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.939008  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3563  hydrolase  35.64 
 
 
232 aa  105  6e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0469  phosphatase  32.02 
 
 
239 aa  103  3e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.876662  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08880  predicted phosphatase  30.23 
 
 
247 aa  102  4e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0898254  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1899  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 
212 aa  92.8  3e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000244384  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0072  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.17 
 
 
230 aa  85.5  6e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0095  HAD family hydrolase  29.47 
 
 
212 aa  84.7  9e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0627  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  31.58 
 
 
233 aa  82.8  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0886  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  31.28 
 
 
236 aa  80.5  0.00000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0500332 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0919  HAD family hydrolase  31.22 
 
 
209 aa  79.7  0.00000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000975491  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  28.7 
 
 
229 aa  77.8  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.98 
 
 
221 aa  76.3  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1752  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25 
 
 
216 aa  76.3  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0384  HAD family hydrolase  25.71 
 
 
222 aa  76.3  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000045535  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0414  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.65 
 
 
217 aa  75.5  0.0000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1144  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.31 
 
 
217 aa  75.5  0.0000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  26.94 
 
 
223 aa  74.7  0.0000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2037  HAD family hydrolase  27.78 
 
 
225 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00546936 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0391  phosphoglycolate phosphatase  30.32 
 
 
216 aa  74.7  0.000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0387  conserved hypothetical protein, putative HAD superfamily hydrolase  31.63 
 
 
214 aa  72.8  0.000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.322414  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1987  HAD family hydrolase  24.53 
 
 
215 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0143235  normal  0.0109237 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2697  phosphoglycolate phosphatase  27.75 
 
 
240 aa  72  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1040  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.33 
 
 
211 aa  71.6  0.000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0261  phosphoglycolate phosphatase  25.25 
 
 
226 aa  71.6  0.000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  26.7 
 
 
225 aa  71.6  0.000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2080  phosphoglycolate phosphatase  26.56 
 
 
237 aa  71.6  0.000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  26.76 
 
 
226 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2233  phosphoglycolate phosphatase  25.34 
 
 
238 aa  71.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25252  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0147  ExsB family protein  26.13 
 
 
486 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00645126 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0431  3-amino-5-hydroxybenoic acid synthesis related  27.06 
 
 
263 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  26.76 
 
 
225 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0258  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.72 
 
 
220 aa  70.1  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  26.76 
 
 
225 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3798  phosphoglycolate phosphatase  25.66 
 
 
253 aa  70.5  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2014  phosphoglycolate phosphatase  26.73 
 
 
236 aa  70.1  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  26.76 
 
 
225 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1437  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.06 
 
 
213 aa  69.7  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000111508  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0484  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.4 
 
 
218 aa  70.1  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1661  AHBA synthesis associated protein  27.35 
 
 
214 aa  69.7  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49792 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1932  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.29 
 
 
218 aa  69.7  0.00000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0012  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.46 
 
 
212 aa  68.9  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0912057  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0460  phosphoglycolate phosphatase  23.81 
 
 
229 aa  69.3  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0934432  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2449  HAD family hydrolase  28.95 
 
 
217 aa  68.6  0.00000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0190416  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0976  HAD family hydrolase  26.94 
 
 
225 aa  68.6  0.00000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14060  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  27.01 
 
 
217 aa  68.6  0.00000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>