199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3121 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3121  rubrerythrin  100 
 
 		 184 aa  384  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00426378  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1771  rubrerythrin  75 
 
 		 184 aa  295  2e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0654519  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0418  Rubrerythrin  66.85 
 
 		 184 aa  259  2e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19080  Rubrerythrin  53.85 
 
 		 185 aa  203  1e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00100041  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1606  rubrerythrin  53.33 
 
 		 185 aa  195  2.0000000000000003e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0475668  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1650  Rubrerythrin  53.37 
 
 		 170 aa  194  4.0000000000000005e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.438503  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0631  rubrerythrin  50 
 
 		 169 aa  185  3e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0272  rubrerythrin  50 
 
 		 170 aa  184  5e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00220847  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0274  rubrerythrin  50 
 
 		 170 aa  184  5e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000207736  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0444  rubrerythrin  51.69 
 
 		 167 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000156568  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0467  rubrerythrin  51.12 
 
 		 167 aa  179  2e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000249666  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1891  rubrerythrin  47.19 
 
 		 182 aa  178  4e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2369  Rubrerythrin  46.15 
 
 		 182 aa  177  8e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1632  rubrerythrin  48.35 
 
 		 169 aa  174  8e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.368891  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0878  Rubrerythrin  49.72 
 
 		 168 aa  173  9.999999999999999e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000000346492  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3563  rubrerythrin  48.31 
 
 		 182 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1646  Rubrerythrin  44.25 
 
 		 165 aa  149  2e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2197  Rubrerythrin  45.4 
 
 		 166 aa  149  3e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0583  rubrerythrin  47.7 
 
 		 166 aa  148  4e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0179451  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3282  rubrerythrin  41.95 
 
 		 166 aa  145  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000199245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0916  rubrerythrin  42.53 
 
 		 165 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2740  rubrerythrin  36.93 
 
 		 173 aa  138  4.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0739  rubrerythrin  41.28 
 
 		 165 aa  135  4e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.491784  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0743  rubrerythrin  41.76 
 
 		 165 aa  135  4e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2612  rubrerythrin/rubredoxin protein, putative  41.76 
 
 		 168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0955  Rubrerythrin  41.24 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0818  Rubrerythrin  41.95 
 
 		 166 aa  132  3e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0782088  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1571  rubrerythrin  41.24 
 
 		 166 aa  131  5e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4153  rubrerythrin  44.24 
 
 		 168 aa  131  6e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0406  rubrerythrin/rubredoxin  41.14 
 
 		 165 aa  130  7.999999999999999e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0301  Rubrerythrin  36.93 
 
 		 166 aa  130  7.999999999999999e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1646  Rubrerythrin  40.8 
 
 		 166 aa  130  7.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.636053 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0111  hypothetical protein  37.71 
 
 		 168 aa  130  9e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.149828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3532  Rubrerythrin  40.35 
 
 		 158 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1978  rubrerythrin  40.8 
 
 		 166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.603623  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0921  Rubrerythrin  39.08 
 
 		 166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.4255200000000004e-33 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0668  rubrerythrin  40.23 
 
 		 166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.807065 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2460  Rubrerythrin  40.61 
 
 		 166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3325  Rubrerythrin  38.51 
 
 		 166 aa  128  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.939225  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2624  rubrerythrin  40.94 
 
 		 168 aa  127  6e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2474  Rubrerythrin  38.51 
 
 		 164 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_349  rubrerythrin/rubredoxin  39.43 
 
 		 165 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1794  Rubrerythrin  41.76 
 
 		 168 aa  125  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000201822  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0385  rubrerythrin  40.57 
 
 		 165 aa  125  3e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2468  rubrerythrin  38.64 
 
 		 163 aa  125  4.0000000000000003e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1644  Rubrerythrin  38.64 
 
 		 164 aa  124  8.000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0102  Rubrerythrin  40.91 
 
 		 172 aa  123  1e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000956858  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3154  rubrerythrin  37.5 
 
 		 166 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1320  rubrerythrin, putative  41.34 
 
 		 165 aa  119  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000383486  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0168  rubrerythrin  34.46 
 
 		 166 aa  117  7e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.364022  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0082  rubrerythrin  37.65 
 
 		 167 aa  115  3.9999999999999997e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2193  rubrerythrin  37.29 
 
 		 166 aa  114  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.336695  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1684  Rubrerythrin  36.72 
 
 		 166 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.928026  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3175  Rubrerythrin  37.87 
 
 		 164 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.738943 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1755  Rubrerythrin  36.72 
 
 		 166 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1044  rubrerythrin  40.83 
 
 		 163 aa  111  7.000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2295  Rubrerythrin  40.72 
 
 		 164 aa  110  9e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460498  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0897  Rubrerythrin  38.24 
 
 		 167 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000170126  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0112  hypothetical protein  35.12 
 
 		 166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0127739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4631  Rubrerythrin  36.93 
 
 		 228 aa  107  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000498251 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0940  rubrerythrin  37.28 
 
 		 164 aa  105  4e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.828203  normal  0.659027 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2736  rubrerythrin  35.03 
 
 		 184 aa  102  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.542692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0865  Rubrerythrin  40.68 
 
 		 182 aa  99  3e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.41243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2089  Rubrerythrin  33.7 
 
 		 202 aa  96.7  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3337  nigerythrin  31.67 
 
 		 202 aa  94.7  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2946  rubrerythrin  32.6 
 
 		 202 aa  94  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1657  Rubrerythrin  34.55 
 
 		 196 aa  93.2  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0084  rubrerythrin  36.78 
 
 		 169 aa  91.7  6e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.69995e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1657  rubrerythrin  36.11 
 
 		 194 aa  86.7  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1986  Rubrerythrin  32.61 
 
 		 177 aa  85.1  5e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.079110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0434  rubrerythrin  33.15 
 
 		 191 aa  84  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1311  rubrerythrin  33.71 
 
 		 190 aa  83.6  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.395984  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0972  rubrerythrin  34.44 
 
 		 194 aa  81.6  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.367114  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2183  rubrerythrin  33.14 
 
 		 167 aa  81.3  0.000000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000223416  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1565  rubrerythrin  35.36 
 
 		 194 aa  79.7  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1222  rubrerythrin  33.51 
 
 		 191 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000672055  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0138  Rubrerythrin  30 
 
 		 263 aa  79  0.00000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.996422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0256  rubrerythrin  33.33 
 
 		 194 aa  78.2  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2797  rubrerythrin  31.25 
 
 		 178 aa  78.2  0.00000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.31636e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0009  rubrerythrin  31.46 
 
 		 191 aa  77  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.195637  hitchhiker  0.00235505 
 
 
-
 
NC_002950  PG0195  rubrerythrin  31.46 
 
 		 192 aa  77  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.766512 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1680  Rubrerythrin  33.33 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3252  rubrerythrin  32.07 
 
 		 191 aa  76.6  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1668  Rubrerythrin  31.87 
 
 		 233 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.428689 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2375  rubrerythrin  37.96 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.580283  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0011  rubrerythrin  30.48 
 
 		 183 aa  74.3  0.0000000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0012  rubrerythrin  30.48 
 
 		 183 aa  74.3  0.0000000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000245189  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1511  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  28.07 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0038  rubrerythrin  30.48 
 
 		 183 aa  73.9  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0308291  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0860  rubrerythrin  28.72 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.069269  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0398  Rubrerythrin  30.34 
 
 		 200 aa  73.9  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.849916 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4424  rubrerythrin  29.26 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2264  Rubrerythrin  30.6 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0219984  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2716  Rubrerythrin  30.32 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.275247 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0418  Rubrerythrin  35.51 
 
 		 139 aa  72.4  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1538  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  27.63 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.029752 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1797  Rubrerythrin  31.46 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0136768  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2201  Rubrerythrin  36.3 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0203329 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3716  rubrerythrin  36.5 
 
 		 140 aa  72  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344603  normal  0.13516 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0999  hypothetical protein  34.46 
 
 		 180 aa  72.4  0.000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0268457  normal  0.36555 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>