78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3086 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3086  amino acid-binding ACT domain-containing protein  100 
 
 
135 aa  266  8e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2883  amino acid-binding ACT domain-containing protein  45.86 
 
 
143 aa  130  6e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.14042  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1120  amino acid-binding ACT domain protein  45.45 
 
 
143 aa  126  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.298875  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0514  ACT domain-containing protein  41.04 
 
 
143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1522  amino acid-binding ACT domain-containing protein  43.61 
 
 
170 aa  123  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0251264 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1575  amino acid-binding ACT domain-containing protein  42.86 
 
 
143 aa  122  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.114486  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0616  ACT domain-containing protein  42.96 
 
 
143 aa  120  7e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.896722  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0167  amino acid-binding ACT domain protein  45.67 
 
 
143 aa  119  9e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1682  amino acid-binding ACT domain-containing protein  43.61 
 
 
143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2322  amino acid-binding ACT domain-containing protein  40.6 
 
 
143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0816  amino acid-binding ACT  41.48 
 
 
142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.842739  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3510  amino acid-binding ACT domain protein  42.86 
 
 
143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0260882  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1138  amino acid-binding ACT domain protein  41.35 
 
 
143 aa  118  3e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000787959  normal  0.731263 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1736  ACT domain-containing protein  41.04 
 
 
143 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567956  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0447  amino acid-binding ACT domain protein  42.11 
 
 
143 aa  117  7e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.266025 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0261  amino acid-binding ACT domain-containing protein  37.88 
 
 
144 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0159897  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0796  amino acid-binding ACT domain protein  41.35 
 
 
143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1971  amino acid-binding ACT domain-containing protein  41.22 
 
 
142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1859  amino acid-binding ACT domain protein  42.11 
 
 
143 aa  115  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00254903  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2088  ACT domain-containing protein  42.86 
 
 
143 aa  115  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.835718  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2191  amino acid-binding ACT domain protein  41.6 
 
 
143 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0065  hypothetical protein  42.96 
 
 
142 aa  114  5e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2036  amino acid-binding ACT domain protein  41.6 
 
 
143 aa  113  8.999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000214069 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2132  amino acid-binding ACT domain-containing protein  41.41 
 
 
143 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0184772  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1503  amino acid-binding ACT domain protein  41.79 
 
 
143 aa  110  4.0000000000000004e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0208  amino acid-binding (ACT) protein  40 
 
 
145 aa  110  7.000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1824  ACT domain-containing protein  36.57 
 
 
143 aa  110  9e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0069  amino acid-binding ACT domain protein  41.48 
 
 
142 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0670  amino acid-binding ACT domain protein  41.27 
 
 
143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0074  amino acid-binding ACT domain protein  38.52 
 
 
142 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1670  amino acid-binding ACT domain-containing protein  35.82 
 
 
143 aa  107  7.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0860  amino acid-binding ACT domain-containing protein  42.22 
 
 
141 aa  105  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0495792  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0210  acetolactate synthase small subunit  37.31 
 
 
145 aa  105  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.846842 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1743  amino acid-binding ACT domain-containing protein  41.48 
 
 
141 aa  104  5e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.237603 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0168  amino acid-binding ACT domain-containing protein  42.64 
 
 
141 aa  103  6e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.25479  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2859  amino acid-binding ACT domain protein  37.96 
 
 
151 aa  100  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3082  amino acid-binding ACT domain-containing protein  41.04 
 
 
143 aa  100  7e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0041  amino acid-binding ACT domain protein  40.74 
 
 
147 aa  100  9e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0053  amino acid-binding ACT domain protein  40.74 
 
 
147 aa  100  9e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1570  ACT domain-containing protein  36.84 
 
 
143 aa  99.4  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4321  ACT domain-containing protein  47.52 
 
 
149 aa  99  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1584  amino acid-binding ACT domain protein  36.84 
 
 
144 aa  98.2  3e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0505283 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1421  hypothetical protein  35.77 
 
 
151 aa  96.7  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1591  amino acid-binding ACT domain-containing protein  37.98 
 
 
141 aa  96.3  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0708  amino acid-binding ACT domain-containing protein  37.7 
 
 
144 aa  94  6e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.464159  normal  0.126423 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0037  ACT domain-containing protein  38.52 
 
 
147 aa  93.6  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06230  ACT domain-containing protein  38.17 
 
 
142 aa  93.6  7e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.58032  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0832  amino acid-binding ACT domain-containing protein  37.19 
 
 
147 aa  90.9  6e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219299  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0720  putative acetolactate synthase small regulatory subunit  34.65 
 
 
151 aa  90.5  7e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.726001 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0748  amino acid-binding ACT domain-containing protein  34.43 
 
 
143 aa  90.1  9e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00491505  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0040  amino acid-binding ACT domain-containing protein  35.56 
 
 
147 aa  87.8  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0071  amino acid-binding ACT domain-containing protein  31.34 
 
 
145 aa  87  9e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1623  amino acid-binding ACT  32.09 
 
 
144 aa  85.5  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.856261 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2122  amino acid-binding ACT domain protein  31.54 
 
 
144 aa  85.9  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13420  ACT domain-containing protein  38.98 
 
 
142 aa  85.1  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1579  amino acid-binding ACT domain protein  37.25 
 
 
142 aa  85.1  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.210637 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0901  ACT domain-containing protein  35.43 
 
 
129 aa  80.9  0.000000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_885  ACT domain protein  35.43 
 
 
129 aa  80.9  0.000000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1014  ACT domain-containing protein  35.43 
 
 
129 aa  80.9  0.000000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1319  ACT domain-containing protein  30.4 
 
 
144 aa  77.8  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1455  hypothetical protein  32.74 
 
 
144 aa  75.5  0.0000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.323054 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2427  amino acid-binding ACT domain protein  32.67 
 
 
129 aa  66.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.662665  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2514  amino acid-binding ACT domain protein  32.67 
 
 
129 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.583261  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2396  amino acid-binding ACT domain-containing protein  30.4 
 
 
129 aa  65.5  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0909  amino acid-binding ACT domain-containing protein  30.16 
 
 
153 aa  63.2  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.394001  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1433  ACT domain-containing protein  31.68 
 
 
129 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.50436  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0873  amino acid-binding ACT  26.92 
 
 
152 aa  57.8  0.00000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3113  amino acid-binding ACT domain protein  32.14 
 
 
137 aa  53.9  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.569355  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1309  amino acid-binding ACT domain-containing protein  30.16 
 
 
142 aa  53.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2879  amino acid-binding ACT domain-containing protein  28 
 
 
128 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.555565 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1107  acetolactate synthase small subunit  27.27 
 
 
136 aa  50.8  0.000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0326  hypothetical protein  25.74 
 
 
125 aa  46.2  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2332  acetolactate synthase, small subunit  25.74 
 
 
159 aa  43.5  0.0009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000867929 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1570  ACT domain protein  29.29 
 
 
130 aa  42.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.409737  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1903  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.73 
 
 
159 aa  41.6  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0852  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.73 
 
 
159 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.889079  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2171  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.45 
 
 
158 aa  40.8  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0605  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  43.75 
 
 
158 aa  40.4  0.009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.911108  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>