More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3063 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3063  peptidase M23B  100 
 
 		 377 aa  771    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000502081  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3607  peptidase M23B  64.62 
 
 		 469 aa  191  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0610326  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0724  NLP/P60 protein  45.23 
 
 		 419 aa  154  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673085  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  49.22 
 
 		 373 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  47.66 
 
 		 375 aa  125  9e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  33.94 
 
 		 376 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0640  peptidase M23B  32.86 
 
 		 386 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000535366  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  43.75 
 
 		 375 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  38.85 
 
 		 541 aa  114  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  45.74 
 
 		 482 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  43.2 
 
 		 377 aa  114  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  45.6 
 
 		 379 aa  112  9e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  36.91 
 
 		 423 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2192  Peptidase M23  40.88 
 
 		 296 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0192897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0953  Peptidase M23  39.31 
 
 		 336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  45.67 
 
 		 379 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  48.21 
 
 		 431 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0794  M24/M37 family peptidase  32.86 
 
 		 384 aa  111  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000011526  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2852  peptidase M23B  36.69 
 
 		 315 aa  110  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0621759  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  36.91 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1202  Peptidase M23  42.74 
 
 		 367 aa  110  3e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  40.4 
 
 		 282 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2444  peptidase M23B  46.9 
 
 		 318 aa  110  5e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000108635  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  47.32 
 
 		 441 aa  109  6e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  44.88 
 
 		 430 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2235  peptidase M23B  46.49 
 
 		 288 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000416895  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  44.8 
 
 		 304 aa  109  7.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4836  Peptidase M23  39.55 
 
 		 230 aa  109  9.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000639661  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  40.94 
 
 		 374 aa  108  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2745  putative transmembrane protein  39.26 
 
 		 332 aa  107  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.170207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  44.92 
 
 		 387 aa  108  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0855  Fe-S type hydro-lyases tartrate/fumarate alpha region  45.69 
 
 		 310 aa  107  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000487918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0778  Peptidase M23  43.22 
 
 		 305 aa  108  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.266342  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4552  peptidase, M23/M37 family  31.12 
 
 		 384 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000312233  normal  0.0469454 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0779  peptidase, M23/M37 family  31.12 
 
 		 384 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0000701566  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  43.97 
 
 		 443 aa  107  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0634  peptidase NLP/P60 /M23/M37 peptidase domain-containing protein  32.51 
 
 		 386 aa  107  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000528425  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2264  peptidase M23B  35.97 
 
 		 450 aa  107  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971907  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0876  peptidase, M23/M37 family  32.51 
 
 		 386 aa  107  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0634  peptidase NLP/P60 /M23/M37 peptidase domain-containing protein  32.51 
 
 		 386 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.2041900000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03251  peptidase, M23/M37 family protein  43.1 
 
 		 292 aa  105  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00183313  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2106  M24/M37 family peptidase  47.15 
 
 		 328 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5898  Peptidase M23  47.15 
 
 		 332 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.941404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0610  peptidase M23B  29.58 
 
 		 383 aa  105  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000136568  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4455  M23/M37 peptidase domain-containing protein  43.86 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0690  M24/M37 family peptidase  32.16 
 
 		 386 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000234103  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1137  Peptidase M23  48.72 
 
 		 468 aa  105  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000109731  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0724  M23/37 family peptidase  32.16 
 
 		 386 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000754893  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0801  peptidase, M23/M37 family  32.51 
 
 		 386 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70657e-48 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0610  Peptidase M23  31.73 
 
 		 318 aa  105  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0598438  normal  0.897424 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3512  peptidase M23B  43.97 
 
 		 299 aa  105  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000873252  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  39.19 
 
 		 400 aa  103  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  44.44 
 
 		 524 aa  103  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  41.41 
 
 		 375 aa  103  4e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  44.74 
 
 		 402 aa  103  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  38.58 
 
 		 379 aa  103  7e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1868  peptidase M23B  39.2 
 
 		 460 aa  102  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0785648  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  38.62 
 
 		 404 aa  102  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0758  Peptidase M23  35.64 
 
 		 290 aa  102  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  44.17 
 
 		 430 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  42.98 
 
 		 456 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4212  M24/M37 family peptidase  42.75 
 
 		 299 aa  101  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  41.27 
 
 		 301 aa  101  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  43.86 
 
 		 457 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2912  peptidase M23B  43.75 
 
 		 330 aa  102  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.471591  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  42.98 
 
 		 455 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3563  peptidase M23B  42.75 
 
 		 299 aa  102  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000153251  hitchhiker  0.0000000453788 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0393  peptidase M23B  42.75 
 
 		 299 aa  101  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000111959  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3736  peptidase M23B  42.75 
 
 		 299 aa  101  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000766225  hitchhiker  0.000000231142 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  38.13 
 
 		 415 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2401  peptidase M23B  43.75 
 
 		 297 aa  101  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  41.13 
 
 		 374 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  40.94 
 
 		 404 aa  100  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0827  peptidase M23B  44.64 
 
 		 327 aa  101  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3297  peptidase M23B  50 
 
 		 448 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00235812  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3929  peptidase M23B  44.74 
 
 		 319 aa  100  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0210  peptidase M23B  41.27 
 
 		 216 aa  100  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  normal  0.0105886 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  42.98 
 
 		 459 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0030  Peptidase M23  40.48 
 
 		 445 aa  100  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  39.2 
 
 		 442 aa  100  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  43.86 
 
 		 455 aa  100  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  41.27 
 
 		 399 aa  100  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  39.84 
 
 		 303 aa  100  6e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3690  peptidase M23B  44.64 
 
 		 328 aa  100  6e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0362  peptidase M23B  43.75 
 
 		 299 aa  99.8  7e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000004833  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  42.86 
 
 		 402 aa  99.4  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0795  peptidase M23B  35.11 
 
 		 316 aa  99.8  8e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.244316 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  40.48 
 
 		 399 aa  99.4  8e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4435  Peptidase M23  40 
 
 		 308 aa  99.4  9e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4732  peptidase M23B  47.32 
 
 		 394 aa  99.4  9e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130567  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0417  peptidase M23B  41.96 
 
 		 299 aa  99  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000018485  hitchhiker  0.000198891 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0315  peptidase M23B  38.56 
 
 		 346 aa  98.6  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.612531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2579  peptidase M23B  37.42 
 
 		 384 aa  99.4  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0494  peptidase M23B  44.64 
 
 		 299 aa  97.8  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000148053  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  42.98 
 
 		 453 aa  97.8  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  42.24 
 
 		 313 aa  98.2  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0420  peptidase M23B  44.64 
 
 		 299 aa  97.8  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0052215  unclonable  0.00000446989 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3446  peptidase M23B  43.75 
 
 		 299 aa  97.8  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000175079  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3797  peptidase M23B  43.75 
 
 		 299 aa  97.8  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000938222  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3173  peptidase M23B  39.29 
 
 		 314 aa  97.4  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000536198  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>