More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3053 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3053  agmatinase  100 
 
 		 284 aa  588  1e-167  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0530  agmatinase  63.7 
 
 		 285 aa  389  1e-107  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0516  agmatinase  63.7 
 
 		 285 aa  389  1e-107  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2434  agmatinase  56.79 
 
 		 287 aa  345  7e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2793  agmatinase  53.55 
 
 		 280 aa  320  1.9999999999999998e-86  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0178  agmatinase  47.72 
 
 		 285 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000300631  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3460  agmatinase  48.03 
 
 		 291 aa  269  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5218  agmatinase  45.91 
 
 		 290 aa  261  1e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5050  agmatinase (agmatine ureohydrolase)  45.91 
 
 		 290 aa  261  1e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5461  putative agmatinase  45.91 
 
 		 290 aa  261  1e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5617  agmatinase  45.91 
 
 		 290 aa  261  1e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3883  putative agmatinase  45.91 
 
 		 290 aa  261  1e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3350  agmatinase  46.24 
 
 		 294 aa  261  1e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00473387  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5066  agmatinase (agmatine ureohydrolase)  45.91 
 
 		 290 aa  260  2e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5163  putative agmatinase  45.55 
 
 		 290 aa  260  2e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0489  putative agmatinase  46.24 
 
 		 288 aa  256  2e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000593846  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5460  putative agmatinase  45.2 
 
 		 290 aa  256  4e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5498  agmatinase, putative  45.2 
 
 		 290 aa  256  4e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5547  putative agmatinase  45.2 
 
 		 290 aa  256  4e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5491  putative agmatinase  45.2 
 
 		 290 aa  256  4e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0207  agmatinase  44.21 
 
 		 290 aa  245  4.9999999999999997e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.973687  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21591  arginase  42.71 
 
 		 299 aa  242  5e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.703776 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2793  agmatinase  42.14 
 
 		 295 aa  242  6e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.66818  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0695  agmatinase  43.32 
 
 		 289 aa  241  9e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.109058  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1315  agmatinase  43.32 
 
 		 285 aa  239  2.9999999999999997e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2591  agmatinase  45.29 
 
 		 291 aa  238  1e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.259439 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1815  agmatinase  45.45 
 
 		 296 aa  236  2e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2230  putative agmatinase  42.71 
 
 		 287 aa  235  7e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18171  arginase  41.96 
 
 		 296 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1287  arginase family  43.4 
 
 		 299 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3566  agmatinase  43.53 
 
 		 287 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1446  putative agmatinase  42.81 
 
 		 279 aa  228  1e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00618219  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1581  putative agmatinase  43.64 
 
 		 288 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1824  agmatinase  42.7 
 
 		 282 aa  223  2e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1085  agmatinase  42.35 
 
 		 282 aa  224  2e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0832  putative agmatinase  42.35 
 
 		 282 aa  223  3e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0897  putative agmatinase  42.24 
 
 		 283 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18771  arginase  39.73 
 
 		 294 aa  219  3.9999999999999997e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.218611  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29511  arginase family  42.48 
 
 		 304 aa  219  6e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18771  arginase  39.52 
 
 		 293 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.993676  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18961  arginase  39.78 
 
 		 293 aa  211  7.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0669  hypothetical protein  42.86 
 
 		 288 aa  211  1e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.340442  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1779  arginase family  39.29 
 
 		 293 aa  209  5e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.632137  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1978  putative agmatinase  44.05 
 
 		 250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000215726  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0694  agmatinase  35.89 
 
 		 291 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.464925  normal  0.230846 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0939  agmatinase  33.92 
 
 		 315 aa  159  4e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.220122 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0965  putative agmatinase  35.97 
 
 		 283 aa  159  7e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.336082  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0004  agmatinase  34.04 
 
 		 290 aa  156  4e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2336  agmatinase  36.52 
 
 		 287 aa  154  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.329379 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1421  agmatinase  33.22 
 
 		 297 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1414  agmatinase  35.41 
 
 		 295 aa  151  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000244509  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1550  agmatinase, putative  33.22 
 
 		 322 aa  150  2e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.912006 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8153  agmatinase  32.16 
 
 		 327 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0925  putative agmatinase  34.04 
 
 		 291 aa  150  3e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1896  agmatinase  33.57 
 
 		 289 aa  149  6e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.436435  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0897  putative agmatinase  40.44 
 
 		 268 aa  149  7e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.322484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0721  putative agmatinase  37.97 
 
 		 307 aa  147  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1457  agmatinase  32.41 
 
 		 316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.284678  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1417  agmatinase  33.1 
 
 		 325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1619  putative agmatinase  34.98 
 
 		 310 aa  146  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0140397 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2950  agmatinase  31.79 
 
 		 324 aa  147  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00201595  hitchhiker  0.00051665 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3224  agmatinase  35.33 
 
 		 333 aa  147  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.583379  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0425  agmatinase  32.62 
 
 		 283 aa  146  5e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.509578 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1728  agmatinase  32.74 
 
 		 318 aa  145  5e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180213  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46070  guanidinobutyrase  30.82 
 
 		 319 aa  145  6e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.781131 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5662  putative agmatinase  32.66 
 
 		 326 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5283  agmatinase  32.66 
 
 		 326 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3918  guanidinobutyrase  30.82 
 
 		 319 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5372  putative agmatinase  32.66 
 
 		 326 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2295  agmatinase  32.17 
 
 		 319 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0497  agmatinase  32.36 
 
 		 310 aa  145  1e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2256  agmatinase  32.17 
 
 		 319 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  32.17 
 
 		 319 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0046  putative agmatinase  32.86 
 
 		 321 aa  144  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319664 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2635  putative agmatinase  32.23 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1823  putative agmatinase  39.49 
 
 		 268 aa  144  2e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.397511  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2838  agmatinase  33.33 
 
 		 320 aa  144  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4700  agmatinase  32.39 
 
 		 318 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1626  agmatinase  39.05 
 
 		 265 aa  142  6e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0597  agmatinase, putative  31.58 
 
 		 315 aa  142  7e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1797  putative agmatinase  31.79 
 
 		 319 aa  142  7e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.57797 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0543  agmatinase  31.18 
 
 		 305 aa  142  9e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0797  putative agmatinase  32.98 
 
 		 337 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1825  agmatinase  32.03 
 
 		 365 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.028899  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1872  agmatinase  32.03 
 
 		 365 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.548708  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0714  agmatinase  32.37 
 
 		 315 aa  140  3e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147281  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1806  agmatinase  31.7 
 
 		 365 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.885321  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2241  agmatinase  31.18 
 
 		 315 aa  138  7.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014845  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0384  agmatinase  31.88 
 
 		 318 aa  137  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.958306  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6362  agmatinase  33.33 
 
 		 324 aa  138  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.823573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0161  putative agmatinase  30.96 
 
 		 329 aa  138  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3040  agmatinase  31.43 
 
 		 313 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301335  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3024  agmatinase  31.43 
 
 		 313 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1431  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  39.19 
 
 		 268 aa  137  2e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3083  agmatinase  31.43 
 
 		 313 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220565  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4523  agmatinase, putative  30.91 
 
 		 320 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4029  agmatinase  30.91 
 
 		 320 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192086  normal  0.0901062 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1388  putative agmatinase  30.94 
 
 		 320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584775  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3815  agmatinase  30.94 
 
 		 316 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1433  putative agmatinase  33.69 
 
 		 321 aa  136  4e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.946335  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>