81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3028 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3028  Alpha-L-fucosidase  100 
 
 		 470 aa  979    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1750  alpha-1,3/4-fucosidase, putative  45.74 
 
 		 606 aa  428  1e-118  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3894  coagulation factor 5/8 type domain protein  42.67 
 
 		 688 aa  390  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0308  Alpha-L-fucosidase  43.6 
 
 		 463 aa  385  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2160  Alpha-L-fucosidase  42.05 
 
 		 690 aa  380  1e-104  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1415  coagulation factor 5/8 type domain protein  41.88 
 
 		 698 aa  373  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2028  Alpha-L-fucosidase  41.72 
 
 		 704 aa  360  3e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2130  calx-beta domain-containing protein  40.26 
 
 		 932 aa  354  2e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.538147  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1843  FucA  40.04 
 
 		 750 aa  351  1e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6558  coagulation factor 5/8 type domain protein  40 
 
 		 687 aa  350  2e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00192951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0846  coagulation factor 5/8 type domain protein  38.46 
 
 		 704 aa  315  9.999999999999999e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2423  twin-arginine translocation pathway signal  35.94 
 
 		 638 aa  304  2.0000000000000002e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.204978  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2596  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.88 
 
 		 487 aa  288  2e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01697  F5/8 type C domain protein  35.02 
 
 		 581 aa  283  5.000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0392  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.83 
 
 		 709 aa  279  7e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0086  alpha-L-fucosidase  34.05 
 
 		 460 aa  259  8e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12980  alpha-L-fucosidase  36.09 
 
 		 434 aa  252  8.000000000000001e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194467  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1447  Alpha-L-fucosidase  41.49 
 
 		 410 aa  252  1e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.821107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0072  Alpha-L-fucosidase  34.22 
 
 		 460 aa  252  1e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0652  F5/8 type C domain-containing protein  26.89 
 
 		 436 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0313432  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0640  F5/8 type C domain-containing protein  27.04 
 
 		 436 aa  145  2e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6474  coagulation factor 5/8 type domain protein  25.51 
 
 		 467 aa  123  9e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.904376  normal  0.80795 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1127  Alpha-L-fucosidase  27.04 
 
 		 479 aa  106  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.95278 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3023  Alpha-L-fucosidase  28.9 
 
 		 435 aa  104  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.202324  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2595  Alpha-L-fucosidase  27.22 
 
 		 473 aa  100  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2796  Alpha-L-fucosidase  38.37 
 
 		 581 aa  100  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7054  Alpha-L-fucosidase  27.13 
 
 		 485 aa  99  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000348467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0146  Alpha-L-fucosidase  35.75 
 
 		 711 aa  98.6  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2703  Alpha-L-fucosidase  28.53 
 
 		 596 aa  94.4  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.487466 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2040  Alpha-L-fucosidase  26.33 
 
 		 494 aa  92  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.983344  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0130  Alpha-L-fucosidase  33.52 
 
 		 450 aa  92  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159466  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13010  alpha-L-fucosidase  28.37 
 
 		 445 aa  90.9  4e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0825018  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3264  Alpha-L-fucosidase  25.88 
 
 		 471 aa  89.7  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.868809 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6806  Alpha-L-fucosidase  29.21 
 
 		 452 aa  89  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00560113  hitchhiker  0.00000369598 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2841  Alpha-L-fucosidase  27.5 
 
 		 473 aa  89  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252312  hitchhiker  0.00495105 
 
 
-
 
NC_002950  PG1884  alpha-L-fucosidase precursor, putative  37.3 
 
 		 674 aa  89  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0019  Alpha-L-fucosidase  28.03 
 
 		 441 aa  86.7  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2596  Alpha-L-fucosidase  31.21 
 
 		 447 aa  86.7  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000031745  normal  0.128111 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2190  Alpha-L-fucosidase  25.7 
 
 		 435 aa  84.3  0.000000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0480  alpha-L-fucosidase family protein  31.22 
 
 		 478 aa  84  0.000000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00391877  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2693  Alpha-L-fucosidase  35.85 
 
 		 479 aa  81.3  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.101343  hitchhiker  0.00474294 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05120  alpha-L-fucosidase  33.59 
 
 		 474 aa  80.9  0.00000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3540  Alpha-L-fucosidase  25.49 
 
 		 340 aa  80.5  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.747964  normal  0.742804 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2842  Alpha-L-fucosidase  24.24 
 
 		 479 aa  80.5  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471674 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3943  Alpha-L-fucosidase  33.82 
 
 		 429 aa  80.5  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0611  Alpha-L-fucosidase  28.3 
 
 		 446 aa  77.8  0.0000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.620777  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5348  Alpha-L-fucosidase  31.61 
 
 		 440 aa  77.8  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.559613 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0625  Alpha-L-fucosidase  28.3 
 
 		 446 aa  77  0.0000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3467  Alpha-L-fucosidase  25.23 
 
 		 415 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.565754 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2695  Alpha-L-fucosidase  26.33 
 
 		 627 aa  76.3  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000601937  normal  0.037659 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3615  Alpha-L-fucosidase  35.29 
 
 		 429 aa  73.6  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.669923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1903  Alpha-L-fucosidase  32.35 
 
 		 431 aa  72.8  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0886  Alpha-L-fucosidase  25.79 
 
 		 408 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0105586  normal  0.109873 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0831  Alpha-L-fucosidase  23.92 
 
 		 537 aa  70.9  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000199076  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1916  Alpha-L-fucosidase  22.92 
 
 		 446 aa  70.1  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0902  Alpha-L-fucosidase  25.17 
 
 		 505 aa  70.1  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0010  Alpha-L-fucosidase  24.38 
 
 		 538 aa  69.7  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.886548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2045  Alpha-L-fucosidase  24.09 
 
 		 464 aa  68.9  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118416  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2605  Alpha-L-fucosidase  32.03 
 
 		 463 aa  63.5  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00783953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4476  Alpha-L-fucosidase  27.78 
 
 		 731 aa  62.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766125  normal  0.418244 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0823  Alpha-L-fucosidase  25.16 
 
 		 534 aa  62.4  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000144391  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2072  Alpha-L-fucosidase  26.52 
 
 		 486 aa  61.2  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2972  Alpha-L-fucosidase  38.27 
 
 		 490 aa  62  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245374  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0802  glycoside hydrolase family 29 (alpha-L-fucosidase)  37.63 
 
 		 495 aa  59.7  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.246166  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2814  Alpha-L-fucosidase  30.97 
 
 		 471 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.547268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2554  Alpha-L-fucosidase  32.04 
 
 		 478 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0869924  normal  0.838653 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1483  Alpha-L-fucosidase  32.2 
 
 		 482 aa  57.8  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000503275  normal  0.454676 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4947  Alpha-L-fucosidase  28.97 
 
 		 644 aa  57.4  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00851313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0390  Alpha-L-fucosidase  32 
 
 		 484 aa  55.8  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0617324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_29821  predicted protein  34.48 
 
 		 473 aa  53.9  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.979957  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2312  Alpha-L-fucosidase  28.95 
 
 		 466 aa  52  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.931291  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48865  predicted protein  28.47 
 
 		 500 aa  51.6  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00800  alpha-L-fucosidase  33.6 
 
 		 474 aa  51.2  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39282  predicted protein  33.33 
 
 		 492 aa  50.4  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.218149  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0435  alpha-L-fucosidase  44.44 
 
 		 212 aa  49.7  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0315  Alpha-L-fucosidase  34.21 
 
 		 464 aa  49.3  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01643  alpha-L-fucosidase  30.67 
 
 		 532 aa  47.8  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.20303  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2262  Alpha-L-fucosidase  30.67 
 
 		 606 aa  45.8  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2169  Alpha-L-fucosidase  32 
 
 		 584 aa  45.4  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.600207  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4875  Alpha-L-fucosidase  34.18 
 
 		 483 aa  43.5  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185578  normal  0.768755 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4932  Alpha-L-fucosidase  35.82 
 
 		 663 aa  43.1  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00307055  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>