More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3021 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3021  acetolactate synthase, small subunit  100 
 
 
166 aa  329  1e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000136695  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2257  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  57.96 
 
 
172 aa  181  5.0000000000000004e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0503  acetolactate synthase, small subunit  56.05 
 
 
170 aa  181  6e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.723319  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2517  acetolactate synthase, small subunit  56.6 
 
 
170 aa  179  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000223689  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3436  acetolactate synthase, small subunit  54.72 
 
 
169 aa  172  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00183335  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0707  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  51.22 
 
 
174 aa  171  3.9999999999999995e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10840  acetolactate synthase, small subunit  52.6 
 
 
168 aa  169  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0219  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  55.13 
 
 
161 aa  169  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.680597  normal  0.0364419 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0224  acetolactate synthase, small subunit  52.87 
 
 
164 aa  169  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.708645  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0282  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  52.6 
 
 
170 aa  168  3e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0709  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  53.5 
 
 
161 aa  168  3e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3553  acetolactate synthase, small subunit  51.83 
 
 
174 aa  168  4e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177769  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08880  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  51.85 
 
 
168 aa  167  7e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0591  acetolactate synthase, small subunit  50.65 
 
 
166 aa  165  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000221035  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2820  acetolactate synthase small subunit  50 
 
 
174 aa  165  2.9999999999999998e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4355  acetolactate synthase small subunit  51.57 
 
 
172 aa  163  8e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00134295  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1124  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  52.76 
 
 
171 aa  163  8e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.539849  hitchhiker  0.0000778154 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2774  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  51.92 
 
 
163 aa  163  9e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.805541  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0353  acetolactate synthase, small subunit  50.33 
 
 
165 aa  162  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.648118  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1234  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  52.87 
 
 
169 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2145  acetolactate synthase, small subunit  50 
 
 
160 aa  162  2.0000000000000002e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.168594  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0751  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.44 
 
 
178 aa  161  3e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0111  acetolactate synthase, small subunit  47.77 
 
 
165 aa  161  3e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.849988  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1542  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50.31 
 
 
169 aa  161  3e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0238  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.69 
 
 
169 aa  161  4.0000000000000004e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0953  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50.31 
 
 
169 aa  161  4.0000000000000004e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1675  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.69 
 
 
169 aa  161  4.0000000000000004e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1091  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  51.83 
 
 
174 aa  159  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8058  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50 
 
 
174 aa  159  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.654374  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1781  acetolactate synthase, small subunit  45.86 
 
 
164 aa  160  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0752076 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0012  acetolactate synthase, small subunit  47.2 
 
 
167 aa  159  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.046385  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2519  acetolactate synthase small subunit  51.59 
 
 
164 aa  159  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0606  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50.61 
 
 
167 aa  159  2e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.211278 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3616  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.68 
 
 
164 aa  159  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000178252  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3639  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  51.83 
 
 
174 aa  158  3e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2120  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  51.92 
 
 
163 aa  158  3e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.596226  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6020  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.77 
 
 
168 aa  158  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.103742  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2980  acetolactate synthase, small subunit  49.04 
 
 
172 aa  158  4e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0119022  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3022  acetolactate synthase, small subunit  49.04 
 
 
172 aa  158  4e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0809645  normal  0.107141 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2157  acetolactate synthase, small subunit  46.79 
 
 
163 aa  157  4e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3391  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.38 
 
 
184 aa  158  4e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523212  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0473  acetolactate synthase, small subunit  49.36 
 
 
163 aa  157  8e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.990351  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2271  acetolactate synthase, small subunit  48.72 
 
 
163 aa  156  1e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18800  acetolactate synthase, small subunit  50.94 
 
 
171 aa  156  1e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.425298  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1467  acetolactate synthase, small subunit  46.3 
 
 
170 aa  156  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000490839  normal  0.0250967 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1241  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.17 
 
 
167 aa  156  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0418826 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7781  acetolactate synthase, small subunit  48.17 
 
 
207 aa  155  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.460716 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1071  acetolactate synthase, small subunit  50.93 
 
 
167 aa  155  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00570032  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2400  acetolactate synthase, small subunit  51.25 
 
 
161 aa  156  2e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2896  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.38 
 
 
171 aa  155  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.386622  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1261  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50.96 
 
 
163 aa  154  4e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105007  hitchhiker  0.000000415778 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1591  acetolactate synthase, small subunit  47.1 
 
 
166 aa  154  4e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3579  acetolactate synthase, small subunit  47.13 
 
 
185 aa  154  4e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00517433  normal  0.401314 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1887  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.09 
 
 
172 aa  154  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00850496  normal  0.0767808 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1907  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.09 
 
 
172 aa  154  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.348754  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1953  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.09 
 
 
172 aa  154  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.146423  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08840  acetolactate synthase, small subunit  50 
 
 
162 aa  154  6e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.20928  normal  0.22405 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0893  acetolactate synthase, small subunit  46.88 
 
 
163 aa  154  7e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.254483  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0746  acetolactate synthase, small subunit  46.88 
 
 
161 aa  154  8e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4072  acetolactate synthase, small subunit  49.06 
 
 
175 aa  153  8e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.896436  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2123  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  51.27 
 
 
166 aa  153  9e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4238  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50.63 
 
 
166 aa  153  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.502745  normal  0.140358 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2892  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.08 
 
 
163 aa  152  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.018126 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0683  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.68 
 
 
169 aa  152  2e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1876  acetolactate synthase, small subunit  47.5 
 
 
161 aa  152  2e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000339514 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2076  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.72 
 
 
163 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2227  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.72 
 
 
163 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.469114 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3074  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  51.28 
 
 
163 aa  151  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00617205 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13017  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.68 
 
 
168 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0018972  normal  0.150654 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1904  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.72 
 
 
163 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2104  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.72 
 
 
163 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.111178 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2318  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.72 
 
 
163 aa  151  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.342254  normal  0.442664 
 
 
-
 
NC_002936  DET0832  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.44 
 
 
178 aa  151  4e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.199975  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4866  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.36 
 
 
163 aa  151  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.858705  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_736  acetolactate synthase, small subunit  47.44 
 
 
178 aa  151  4e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.118552  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1043  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.67 
 
 
184 aa  151  4e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.678602  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1990  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.36 
 
 
165 aa  151  5e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08540  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.12 
 
 
169 aa  151  5e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.097945  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1718  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.72 
 
 
163 aa  150  5e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0129853  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0948  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.08 
 
 
163 aa  150  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0912  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.08 
 
 
163 aa  150  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1901  acetolactate synthase, small subunit  47.77 
 
 
166 aa  150  8e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0148095  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1952  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.72 
 
 
163 aa  150  8e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1770  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.72 
 
 
163 aa  150  8e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.488316  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0172  acetolactate synthase, small subunit  49.39 
 
 
174 aa  150  8.999999999999999e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.693447 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1910  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.41 
 
 
163 aa  149  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.370159  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2038  acetolactate synthase, small subunit  49.68 
 
 
166 aa  150  1e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.153751  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2483  acetolactate synthase, small subunit  44.74 
 
 
159 aa  149  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000111374  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1908  acetolactate synthase small subunit  47.8 
 
 
169 aa  149  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00435991  hitchhiker  0.0000119915 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2863  acetolactate synthase, small subunit  51.59 
 
 
167 aa  150  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0719  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.17 
 
 
172 aa  149  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3719  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.04 
 
 
163 aa  149  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.512898  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3530  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.43 
 
 
164 aa  149  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01980  acetolactate synthase, small subunit  49.67 
 
 
161 aa  149  2e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000298092  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3229  acetolactate synthase, small subunit  48.12 
 
 
167 aa  149  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2931  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.43 
 
 
164 aa  149  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2745  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.41 
 
 
163 aa  149  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4448  acetolactate synthase, small subunit  44.72 
 
 
173 aa  149  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3400  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.43 
 
 
164 aa  149  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1496  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.77 
 
 
163 aa  148  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.440871 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>