39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2984 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2984  superfamily II helicase  100 
 
 		 624 aa  1288    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.421436  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1025  protein of unknown function DUF927  28.83 
 
 		 842 aa  209  2e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.337392  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2613  superfamily II helicase  24.1 
 
 		 987 aa  133  9e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3088  protein of unknown function DUF927  27.61 
 
 		 709 aa  113  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1193  protein of unknown function DUF927  26.71 
 
 		 897 aa  97.1  8e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.280994 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2819  hypothetical protein  23.96 
 
 		 676 aa  76.6  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.14645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2008  DNA primase  21.68 
 
 		 955 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491105  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1505  hypothetical protein  21.8 
 
 		 633 aa  74.7  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.618483  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2484  primase 2  22.86 
 
 		 953 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0098  hypothetical protein  23.02 
 
 		 950 aa  73.9  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1626  hypothetical protein  26.04 
 
 		 911 aa  72.8  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00166468  normal  0.0358334 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1754  inner membrane protein  23.02 
 
 		 958 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2366  inner membrane protein  23.02 
 
 		 958 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0050  hypothetical protein  25.08 
 
 		 597 aa  71.6  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0051  hypothetical protein  25.08 
 
 		 597 aa  71.6  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0113  hypothetical protein  24.02 
 
 		 950 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1288  inner membrane protein  23.02 
 
 		 953 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0309  inner membrane protein  24.02 
 
 		 955 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2496  hypothetical protein  25.08 
 
 		 597 aa  69.3  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7731  protein of unknown function DUF927  23.72 
 
 		 841 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1225  protein of unknown function DUF927  22.43 
 
 		 515 aa  69.7  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0207229  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3477  hypothetical protein  26.6 
 
 		 631 aa  69.3  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00832403 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0810  hypothetical protein  24.51 
 
 		 930 aa  66.2  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0651  hypothetical protein  24.24 
 
 		 627 aa  64.3  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.19875  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02077  hypothetical protein  24.73 
 
 		 979 aa  63.9  0.000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.777801  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04064  inner membrane protein  24.63 
 
 		 580 aa  63.5  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1073  hypothetical protein  28.19 
 
 		 591 aa  62.4  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0070  hypothetical protein  24.22 
 
 		 582 aa  60.1  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2096  protein of unknown function DUF927  22.62 
 
 		 1051 aa  58.9  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0990242  normal  0.675674 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0756  hypothetical protein  21.69 
 
 		 711 aa  56.6  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0381  inner membrane protein  22.25 
 
 		 890 aa  56.2  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.401126 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4783  zinc-binding domain protein, primase-helicase family  22.25 
 
 		 890 aa  56.2  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2244  hypothetical protein  24.49 
 
 		 658 aa  55.5  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.696952  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3881  P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  21.78 
 
 		 929 aa  55.1  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4214  hypothetical protein  24.88 
 
 		 845 aa  53.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.363466  normal  0.433142 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0552  hypothetical protein  28.57 
 
 		 574 aa  53.5  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4007  protein of unknown function DUF927  20.83 
 
 		 899 aa  52.8  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0065  hypothetical protein  24.14 
 
 		 298 aa  51.6  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2483  hypothetical protein  24.14 
 
 		 298 aa  51.6  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>