48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2940 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2940  hypothetical protein  100 
 
 
146 aa  289  9e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00270236  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1335  hypothetical protein  37.5 
 
 
154 aa  74.7  0.0000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1933  protein of unknown function DUF107  32.85 
 
 
154 aa  73.2  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000898113 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0062  hypothetical protein  34.81 
 
 
140 aa  71.2  0.000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.351134  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3685  protein of unknown function DUF107  37.78 
 
 
143 aa  69.7  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.384963 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0361  hypothetical protein  30.36 
 
 
141 aa  68.9  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.213386 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0062  hypothetical protein  34.07 
 
 
140 aa  68.6  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0560345  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2190  hypothetical protein  36.88 
 
 
153 aa  68.6  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00820926  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2413  protein of unknown function DUF107  37.89 
 
 
141 aa  68.2  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1351  hypothetical protein  30.43 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.927831  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1329  hypothetical protein  31.11 
 
 
136 aa  66.6  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.259806  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2309  hypothetical protein  28.68 
 
 
149 aa  65.1  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14650  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  33.64 
 
 
144 aa  60.5  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000389934  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3654  hypothetical protein  30.28 
 
 
144 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.642811  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0728  hypothetical protein  28.36 
 
 
152 aa  60.1  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1155  hypothetical protein  31.91 
 
 
143 aa  57.8  0.00000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.21889  normal  0.55377 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11516  hypothetical protein  35 
 
 
144 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.145618 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1630  protein of unknown function DUF107  33.33 
 
 
143 aa  56.6  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.159398  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1227  protein of unknown function DUF107  27.94 
 
 
133 aa  55.1  0.0000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2110  protein of unknown function DUF107  29.7 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2314  protein of unknown function DUF107  32.35 
 
 
181 aa  53.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2311  protein of unknown function DUF107  28.17 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00380708  hitchhiker  0.000930423 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19790  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  31.69 
 
 
143 aa  52.8  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000333903 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2090  protein of unknown function DUF107  32.64 
 
 
143 aa  52.8  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2365  hypothetical protein  27.4 
 
 
157 aa  50.8  0.000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2577  hypothetical protein  26.24 
 
 
153 aa  51.2  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.869725  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3263  hypothetical protein  28.47 
 
 
143 aa  49.7  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.154765  normal  0.527503 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18360  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  35.61 
 
 
141 aa  49.3  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.54278  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2052  protein of unknown function DUF107  30.93 
 
 
157 aa  48.5  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3420  protein of unknown function DUF107  30.43 
 
 
143 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1715  protein of unknown function DUF107  38.57 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1315  hypothetical protein  26.06 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00290766  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2226  putative integral membrane protein  24.03 
 
 
146 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1505  hypothetical protein  27.27 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.121654  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2314  protein of unknown function DUF107  28.72 
 
 
142 aa  45.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3440  protein of unknown function DUF107  25.55 
 
 
146 aa  44.7  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.782019  normal  0.877312 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2216  hypothetical protein  29.17 
 
 
148 aa  44.7  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00884783  normal  0.106638 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1923  hypothetical protein  25.58 
 
 
142 aa  44.7  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.126265  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3005  protein of unknown function DUF107  30.43 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1454  hypothetical protein  26.95 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8849  protein of unknown function DUF107  22.55 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3244  hypothetical protein  24.03 
 
 
142 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00265616  normal  0.45038 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2063  hypothetical protein  24.03 
 
 
142 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00757659  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2128  hypothetical protein  24 
 
 
165 aa  41.6  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.639111 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1559  hypothetical protein  24.78 
 
 
142 aa  41.6  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.151405  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1428  protein of unknown function DUF107  24.07 
 
 
152 aa  41.2  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4808  protein of unknown function DUF107  26.14 
 
 
143 aa  40.4  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0770  hypothetical protein  30.3 
 
 
146 aa  40.4  0.009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>