More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2907 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  100 
 
 
398 aa  820  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  2.01074e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  65.89 
 
 
394 aa  539  1e-152  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  63.75 
 
 
394 aa  519  1e-146  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  3.84465e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  60.46 
 
 
398 aa  511  1e-144  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  60.81 
 
 
398 aa  513  1e-144  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  60.46 
 
 
398 aa  511  1e-144  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  62.83 
 
 
404 aa  499  1e-140  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  60.82 
 
 
396 aa  494  1e-139  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  62.76 
 
 
393 aa  490  1e-137  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  58.78 
 
 
398 aa  488  1e-137  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  61.32 
 
 
384 aa  490  1e-137  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  61.38 
 
 
384 aa  487  1e-136  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  58.12 
 
 
399 aa  481  1e-135  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  59.69 
 
 
393 aa  478  1e-134  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  58.35 
 
 
398 aa  479  1e-134  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  60.21 
 
 
392 aa  473  1e-132  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  56.67 
 
 
392 aa  472  1e-132  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  58.81 
 
 
396 aa  472  1e-132  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  62.79 
 
 
392 aa  471  1e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  54.92 
 
 
400 aa  462  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  56.02 
 
 
390 aa  446  1e-124  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  56.28 
 
 
382 aa  441  1e-122  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  54.95 
 
 
388 aa  441  1e-122  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  5.31678e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  55.93 
 
 
394 aa  439  1e-122  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  54.03 
 
 
414 aa  431  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  5.61511e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  54.66 
 
 
402 aa  430  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  6.04426e-06 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  52.47 
 
 
396 aa  427  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.40569e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  52.47 
 
 
389 aa  423  1e-117  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  53.2 
 
 
409 aa  422  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  52.69 
 
 
395 aa  412  1e-114  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  52.62 
 
 
382 aa  410  1e-113  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  51.72 
 
 
379 aa  407  1e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  51.05 
 
 
404 aa  399  1e-110  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  50.13 
 
 
396 aa  400  1e-110  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  51.72 
 
 
381 aa  395  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  50.51 
 
 
402 aa  394  1e-108  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  50.39 
 
 
399 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  50 
 
 
407 aa  391  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  50.64 
 
 
394 aa  395  1e-108  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  50.52 
 
 
400 aa  394  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  48.95 
 
 
403 aa  394  1e-108  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  50.39 
 
 
400 aa  394  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  49.34 
 
 
394 aa  391  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0688  cysteine desulfurase NifS  52.07 
 
 
388 aa  391  1e-107  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0297222  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  52 
 
 
381 aa  391  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  49.36 
 
 
389 aa  390  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  50.77 
 
 
401 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  51.16 
 
 
401 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  50 
 
 
384 aa  389  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  51.16 
 
 
401 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  49.61 
 
 
389 aa  386  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  49.87 
 
 
386 aa  385  1e-106  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  48.7 
 
 
393 aa  387  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  50.13 
 
 
383 aa  386  1e-106  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1563  cysteine desulfurase IscS  50.77 
 
 
403 aa  386  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4244  aminotransferase class V  51.46 
 
 
381 aa  387  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00204023  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4480  aminotransferase, class V  50.93 
 
 
381 aa  382  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.921351  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  50 
 
 
400 aa  381  1e-105  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  49.36 
 
 
389 aa  383  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  50.52 
 
 
388 aa  382  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2015  aminotransferase, class V  48.84 
 
 
391 aa  383  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118596  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4530  aminotransferase, class V  50.66 
 
 
381 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  7.02151e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4129  aminotransferase, class V  50.66 
 
 
381 aa  381  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00019108  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  49.87 
 
 
380 aa  379  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  49.35 
 
 
383 aa  379  1e-104  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  51.3 
 
 
398 aa  381  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4140  aminotransferase, class V  50.93 
 
 
381 aa  380  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000996508  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4477  aminotransferase, class V  50.66 
 
 
381 aa  381  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.5082e-19 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1344  aminotransferase class V  47.59 
 
 
406 aa  381  1e-104  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0719  aminotransferase, class V  49.87 
 
 
381 aa  377  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  5.47846e-06  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  48.84 
 
 
391 aa  377  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4517  aminotransferase, class V  49.87 
 
 
381 aa  376  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0024603  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4626  aminotransferase, class V  50.4 
 
 
381 aa  377  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.058165  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  47.56 
 
 
391 aa  377  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4292  aminotransferase, class V  50.4 
 
 
381 aa  377  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000991667  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0229  Cysteine desulfurase  50.52 
 
 
405 aa  377  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  48.96 
 
 
417 aa  374  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1360  cysteine desulfurase IscS  49.48 
 
 
408 aa  373  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0673  cysteine desulfurase IscS  49.35 
 
 
407 aa  369  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  47.53 
 
 
388 aa  369  1e-101  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0822  cysteine desulfurase IscS  49.1 
 
 
421 aa  369  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.02372  normal  0.880264 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1607  cysteine desulfurase NifS  48.45 
 
 
388 aa  369  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.76832  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1558  cysteine desulfurase NifS  47.92 
 
 
400 aa  371  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal  0.890663 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  48.05 
 
 
400 aa  367  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  46.88 
 
 
386 aa  366  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1515  aminotransferase, class V:aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  47.15 
 
 
404 aa  367  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.894831  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2290  cysteine desulfurase IscS  48.06 
 
 
405 aa  364  1e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00326388  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2178  cysteine desulfurase IscS  47.03 
 
 
405 aa  364  2e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000963732  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2243  aminotransferase class V  47.89 
 
 
380 aa  364  2e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2142  cysteine desulfurase IscS  48.32 
 
 
406 aa  363  4e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2163  cysteine desulfurase  47.53 
 
 
407 aa  362  6e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675105  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2036  cysteine desulfurase  47.53 
 
 
407 aa  362  6e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639443  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3062  cysteine desulfurase IscS  47.56 
 
 
403 aa  362  8e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.635367  unclonable  8.59331e-07 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2217  cysteine desulfurase  47.79 
 
 
407 aa  361  1e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1708  cysteine desulfurase  47.79 
 
 
407 aa  361  1e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1489  cysteine desulfurase  47.79 
 
 
407 aa  361  1e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.71249  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  47.79 
 
 
407 aa  361  1e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3103  cysteine desulfurase  47.79 
 
 
407 aa  361  1e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412431  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  47.53 
 
 
407 aa  360  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6331  cysteine desulfurase IscS  46.7 
 
 
405 aa  360  2e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.134755  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>