24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2901 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2901  hypothetical protein  100 
 
 
297 aa  612  1e-174  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  1.20399e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08350  hypothetical protein  41.22 
 
 
265 aa  216  3e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0617  hypothetical protein  38.98 
 
 
273 aa  201  9e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1913  hypothetical protein  34.71 
 
 
265 aa  180  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  3.12193e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3042  hypothetical protein  36.82 
 
 
273 aa  165  9e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  1.44784e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0198  hypothetical protein  33.33 
 
 
261 aa  161  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0181  hypothetical protein  33.33 
 
 
261 aa  161  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.93703e-12 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1426  hypothetical protein  32.57 
 
 
276 aa  157  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0599  AN1-type Zinc finger protein  31.01 
 
 
321 aa  58.5  1e-07  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.715069  normal  0.614872 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0066  rhomboid family protein  28.25 
 
 
244 aa  54.7  2e-06  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.167584  normal  0.0382417 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2907  Rhomboid family protein  32.23 
 
 
273 aa  53.9  3e-06  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0276  Rhomboid family protein  29.8 
 
 
220 aa  53.1  6e-06  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2516  Rhomboid family protein  31.4 
 
 
276 aa  51.2  2e-05  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.258607  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1588  Rhomboid family protein  25.93 
 
 
296 aa  49.7  5e-05  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.186801  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2735  rhomboid family protein  30.4 
 
 
278 aa  49.3  9e-05  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.77359  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2277  Rhomboid family protein  28.66 
 
 
283 aa  48.5  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0043  hypothetical protein  23.33 
 
 
264 aa  48.5  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0498442  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2019  rhomboid family protein  28.5 
 
 
226 aa  47.4  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.334479  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1812  hypothetical protein  27.52 
 
 
278 aa  47  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.515033  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1220  Rhomboid family protein  27.43 
 
 
228 aa  46.2  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2078  rhomboid family protein  26.6 
 
 
226 aa  46.2  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.347543  normal  0.269308 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0277  Rhomboid family protein  25.26 
 
 
293 aa  44.3  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.499185  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2124  hypothetical protein  29.75 
 
 
273 aa  44.3  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2536  Rhomboid family protein  27.08 
 
 
273 aa  42.4  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>