More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2883 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2883  cobalamin synthesis protein P47K  100 
 
 		 360 aa  721    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00106206  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3006  cobalamin synthesis protein P47K  45.28 
 
 		 310 aa  278  1e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0338  cobalamin synthesis protein P47K  36.57 
 
 		 333 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0046  cobalamin synthesis protein P47K  41.1 
 
 		 345 aa  224  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000730504  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0042  CobW/P47K family protein  46.15 
 
 		 308 aa  189  9e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0043  CobW/P47K family protein  46.67 
 
 		 308 aa  188  1e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.845125  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1570  cobalamin synthesis protein P47K  42.11 
 
 		 340 aa  128  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217746 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26190  predicted GTPase, G3E family  34.33 
 
 		 329 aa  128  2.0000000000000002e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0421  hypothetical protein  29.32 
 
 		 307 aa  126  5e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1227  cobalamin synthesis protein P47K  35.39 
 
 		 341 aa  120  4.9999999999999996e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.381423 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1285  cobalamin synthesis protein P47K  34.67 
 
 		 316 aa  117  3.9999999999999997e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1737  cobalamin synthesis protein, P47K  36.42 
 
 		 351 aa  114  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00683166 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0683  cobalamin synthesis protein P47K  32.76 
 
 		 350 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.609439  normal  0.0145183 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0029  cobalamin synthesis protein P47K  30.83 
 
 		 364 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341587  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1648  cobalamin synthesis protein P47K  31.03 
 
 		 328 aa  109  6e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11533  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  33.93 
 
 		 324 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3607  cobalamin synthesis protein P47K  29.6 
 
 		 375 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.734261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1570  hypothetical protein  27.6 
 
 		 372 aa  108  1e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0281678 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2563  cobalamin synthesis protein, P47K  31.22 
 
 		 328 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00261863  decreased coverage  0.00000585707 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3483  cobalamin synthesis protein P47K  37.11 
 
 		 351 aa  107  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.073261 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0134  cobalamin synthesis protein, P47K  22.13 
 
 		 395 aa  107  3e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2406  cobalamin synthesis protein P47K  30.77 
 
 		 337 aa  106  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000018505 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2361  cobalamin synthesis protein, P47K  30.77 
 
 		 337 aa  106  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000667582  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2452  cobalamin synthesis protein, P47K  30.77 
 
 		 337 aa  106  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00835886  normal  0.742091 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1919  cobalamin synthesis protein P47K  34.15 
 
 		 328 aa  106  6e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.295788  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1456  cobalamin synthesis protein P47K  29.75 
 
 		 384 aa  106  6e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3457  cobalamin synthesis protein P47K  43.08 
 
 		 322 aa  106  7e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1876  cobalamin biosynthesis protein CobW  30.89 
 
 		 349 aa  106  8e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  32.78 
 
 		 343 aa  106  8e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2769  cobalamin synthesis protein, P47K  35.47 
 
 		 328 aa  105  9e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.516201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1503  CobW/P47K family protein  29.19 
 
 		 327 aa  105  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2593  cobalamin synthesis protein, P47K  32.7 
 
 		 347 aa  105  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.404806  hitchhiker  0.000961127 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3001  cobalamin synthesis protein P47K  33.67 
 
 		 378 aa  104  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.696763  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2751  cobalamin synthesis protein, P47K  34.87 
 
 		 372 aa  105  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2829  cobalamin synthesis protein, P47K  34.87 
 
 		 367 aa  105  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2162  cobalamin synthesis protein, P47K  35 
 
 		 331 aa  103  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.608946  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0672  hypothetical protein  29.11 
 
 		 379 aa  104  3e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.177765  normal  0.336631 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2927  cobalamin synthesis protein, P47K  34.87 
 
 		 370 aa  104  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3796  hypothetical protein  33.67 
 
 		 365 aa  103  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213041  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0634  cobalamin synthesis protein/P47K  28.8 
 
 		 369 aa  103  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3241  cobalamin synthesis protein P47K  34.48 
 
 		 324 aa  103  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00520466 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3334  cobalamin synthesis protein, P47K  35.06 
 
 		 351 aa  103  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00186258  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2333  cobalamin synthesis protein P47K  31.03 
 
 		 324 aa  103  6e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2842  cobalamin synthesis protein, P47K  35.71 
 
 		 354 aa  103  6e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2449  cobalamin synthesis protein, P47K  30.32 
 
 		 362 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.566188  decreased coverage  0.0000000416664 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1270  cobalamin biosynthesis protein CobW  32.88 
 
 		 349 aa  102  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1307  cobW protein, putative  32.88 
 
 		 349 aa  102  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.248329  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1255  cobalamin synthesis protein, P47K  34.44 
 
 		 360 aa  102  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1373  cobalamin synthesis protein P47K  32.63 
 
 		 393 aa  102  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1502  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35.53 
 
 		 365 aa  101  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3150  cobalamin synthesis protein P47K  31.46 
 
 		 640 aa  101  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.179732  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0182  cobalamin synthesis protein P47K  37.34 
 
 		 308 aa  101  2e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2795  cobalamin synthesis protein, P47K  33.14 
 
 		 362 aa  101  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5137  cobalamin synthesis protein P47K  32.32 
 
 		 323 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.36371 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02103  predicted enzyme  28.51 
 
 		 328 aa  100  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1484  cobalamin synthesis protein P47K  28.51 
 
 		 328 aa  100  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.176394  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2322  CobW/P47K family protein  28.51 
 
 		 328 aa  101  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.366233  hitchhiker  0.00913363 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1338  cobalamin synthesis protein P47K  33.89 
 
 		 375 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1474  cobalamin synthesis protein P47K  28.51 
 
 		 328 aa  100  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00100223  hitchhiker  0.00332333 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1364  cobalamin synthesis protein P47K  33.89 
 
 		 368 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.99457 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2471  CobW/P47K family protein  28.51 
 
 		 328 aa  100  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.046974  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0785  CobW/P47K family protein  28.51 
 
 		 328 aa  100  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.145  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2311  CobW/P47K family protein  28.51 
 
 		 328 aa  100  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.203993  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02062  hypothetical protein  28.51 
 
 		 328 aa  100  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1328  cobalamin synthesis protein P47K  30.18 
 
 		 368 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3020  cobalamin synthesis protein P47K  30.18 
 
 		 368 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0670  putative cobalamin synthesis protein  35.33 
 
 		 330 aa  100  4e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.486225  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2767  cobalamin synthesis protein P47K  34.01 
 
 		 369 aa  100  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2531  cobalamin biosynthesis protein CobW  33.18 
 
 		 344 aa  100  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2446  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.84 
 
 		 346 aa  100  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0987  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.43 
 
 		 374 aa  100  5e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.32175  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40657  predicted protein  32.6 
 
 		 404 aa  100  5e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15891  normal  0.0463328 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3311  CobW/P47K family protein  33.77 
 
 		 328 aa  100  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.045783 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2705  CobW/P47K family protein  33.99 
 
 		 327 aa  99.8  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7138  cobalamin synthesis protein P47K  34.42 
 
 		 360 aa  100  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.775863  normal  0.480911 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2782  cobalamin synthesis protein P47K  33.99 
 
 		 327 aa  99.8  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0196  cobalamin synthesis protein P47K  36.08 
 
 		 364 aa  99.8  7e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174465  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3384  cobalamin synthesis protein P47K  32.49 
 
 		 360 aa  99.4  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162909  normal  0.200467 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0184  putative cobalamin synthesis protein  31.3 
 
 		 364 aa  99  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1081  cobalamin synthesis protein P47K  28.06 
 
 		 384 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.640909 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08161  putative cobalamin synthesis protein  30.77 
 
 		 351 aa  98.6  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.615787  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3682  cobalamin synthesis protein P47K  32.49 
 
 		 367 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.296986 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0456  cobalamin synthesis protein/P47K  32.28 
 
 		 358 aa  97.4  3e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.576952  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2908  cobalamin synthesis protein, P47K  35.53 
 
 		 340 aa  97.8  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.127945  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2430  cobalamin synthesis protein P47K  29.27 
 
 		 325 aa  97.1  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0460  hypothetical protein  38.36 
 
 		 329 aa  97.1  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.27169  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1753  cobalamin synthesis protein, P47K  32.96 
 
 		 344 aa  97.1  4e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6978  cobalamin synthesis protein P47K  32.6 
 
 		 324 aa  97.1  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227526  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10480  CobW domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G07990)  31.6 
 
 		 409 aa  96.7  6e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0306416  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2386  cobalamin synthesis protein, putative  30.93 
 
 		 293 aa  96.7  6e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1300  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  25.95 
 
 		 356 aa  96.3  8e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2372  cobalamin biosynthesis protein CobW  31.62 
 
 		 349 aa  96.3  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0653093  normal  0.0136743 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  35.96 
 
 		 320 aa  95.9  9e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05440  putative GTPase  35.53 
 
 		 328 aa  95.9  9e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3143  putative cobalamin synthesis protein cobW  44.55 
 
 		 345 aa  95.5  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1056  CobW protein  33.7 
 
 		 428 aa  95.5  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2135  cobalamin synthesis protein P47K  32.6 
 
 		 596 aa  95.5  1e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  33.33 
 
 		 326 aa  95.9  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0956  hypothetical protein  29.41 
 
 		 380 aa  95.9  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.582353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  37.43 
 
 		 350 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>