242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2881 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2881  hypothetical protein  100 
 
 		 292 aa  591  1e-168  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000426445  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1721  hypothetical protein  46.94 
 
 		 294 aa  285  5.999999999999999e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2003  hypothetical protein  46.94 
 
 		 294 aa  285  8e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1317  hypothetical protein  44.9 
 
 		 294 aa  273  2.0000000000000002e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.269981  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1793  hypothetical protein  41.64 
 
 		 293 aa  255  8e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2320  hypothetical protein  40.07 
 
 		 292 aa  236  4e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000274769  hitchhiker  0.00243432 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2328  hypothetical protein  40.07 
 
 		 292 aa  225  5.0000000000000005e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0372766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1239  hypothetical protein  39.38 
 
 		 292 aa  220  1.9999999999999999e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.369152  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1033  domain of unknown function DUF1732  41.08 
 
 		 293 aa  219  6e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3896  hypothetical protein  39.45 
 
 		 289 aa  216  4e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000579804  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1763  hypothetical protein  40.41 
 
 		 290 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1698  hypothetical protein  38.36 
 
 		 292 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.466508  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2239  hypothetical protein  38.7 
 
 		 292 aa  212  7e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0890  hypothetical protein  38.36 
 
 		 292 aa  212  7e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000147276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3163  hypothetical protein  36.99 
 
 		 292 aa  208  8e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0449219  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1056  hypothetical protein  38.7 
 
 		 291 aa  206  3e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000165495  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1599  hypothetical protein  35.96 
 
 		 292 aa  206  4e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000017463  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0011  YicC domain protein  38.36 
 
 		 292 aa  204  1e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.272506  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3972  hypothetical protein  38.44 
 
 		 291 aa  202  6e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00569731  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3921  hypothetical protein  38.44 
 
 		 291 aa  201  9e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.831608  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3632  hypothetical protein  38.44 
 
 		 291 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2287  hypothetical protein  36.86 
 
 		 291 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3916  hypothetical protein  38.44 
 
 		 291 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3724  hypothetical protein  38.44 
 
 		 291 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3614  hypothetical protein  38.44 
 
 		 291 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4011  hypothetical protein  38.44 
 
 		 291 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3887  hypothetical protein  38.44 
 
 		 291 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000222822 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1271  hypothetical protein  38.44 
 
 		 291 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00975001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3696  hypothetical protein  39.32 
 
 		 291 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1284  hypothetical protein  36.99 
 
 		 292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00734721  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3214  hypothetical protein  38.05 
 
 		 292 aa  194  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000193402  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1316  domain of unknown function DUF1732  37.67 
 
 		 292 aa  194  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1946  hypothetical protein  37.33 
 
 		 291 aa  193  3e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1049  hypothetical protein  38.05 
 
 		 292 aa  193  3e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120663 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2525  hypothetical protein  37.29 
 
 		 291 aa  191  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2402  hypothetical protein  36.39 
 
 		 293 aa  187  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0682346  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1327  protein of unknown function DUF1732  36.33 
 
 		 291 aa  187  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0133754  normal  0.451646 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3632  hypothetical protein  35.15 
 
 		 293 aa  185  6e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.101055 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2607  hypothetical protein  35.15 
 
 		 291 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.034124  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0838  YicC domain protein  36.64 
 
 		 293 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.422723  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2788  hypothetical protein  33.9 
 
 		 291 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2693  hypothetical protein  33.9 
 
 		 291 aa  176  3e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1774  hypothetical protein  36.45 
 
 		 295 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.593354  normal  0.167904 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0319  hypothetical protein  33.67 
 
 		 309 aa  169  5e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1488  domain of unknown function DUF1732  32.99 
 
 		 291 aa  168  1e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.283341 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2051  YicC domain protein  32.54 
 
 		 293 aa  167  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.974794  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2959  hypothetical protein  34.01 
 
 		 288 aa  167  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1143  hypothetical protein  34.13 
 
 		 292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.37182  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4257  hypothetical protein  33.56 
 
 		 287 aa  163  3e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0987  hypothetical protein  34.47 
 
 		 292 aa  163  3e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00101858  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0046  hypothetical protein  34.25 
 
 		 288 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3837  hypothetical protein  32.19 
 
 		 287 aa  161  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0455  hypothetical protein  33.22 
 
 		 287 aa  161  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0394  hypothetical protein  33.22 
 
 		 287 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000359441 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0380  hypothetical protein  33.22 
 
 		 287 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0367  hypothetical protein  33.22 
 
 		 287 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0369  hypothetical protein  33.22 
 
 		 287 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0305  hypothetical protein  35.81 
 
 		 295 aa  159  6e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000735483  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0956  hypothetical protein  33.22 
 
 		 288 aa  158  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.253768  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3778  hypothetical protein  32.53 
 
 		 287 aa  157  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0351  hypothetical protein  32.88 
 
 		 287 aa  157  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2690  hypothetical protein  32.65 
 
 		 290 aa  156  4e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.886781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0783  domain of unknown function DUF1732  33.68 
 
 		 291 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000478658  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6111  hypothetical protein  34.25 
 
 		 287 aa  155  7e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70430  hypothetical protein  34.25 
 
 		 287 aa  155  7e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2086  hypothetical protein  36.15 
 
 		 293 aa  155  7e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0249545 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0318  hypothetical protein  31.51 
 
 		 287 aa  155  8e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3605  hypothetical protein  31.85 
 
 		 287 aa  155  9e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4387  hypothetical protein  33.9 
 
 		 287 aa  155  9e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.113802 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3845  hypothetical protein  31.85 
 
 		 287 aa  155  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0407  hypothetical protein  33.89 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.122152  normal  0.436876 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2721  hypothetical protein  32.77 
 
 		 293 aa  154  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.151584  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0676  hypothetical protein  30.48 
 
 		 291 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.106933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3996  hypothetical protein  35.14 
 
 		 287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0048  hypothetical protein  34.69 
 
 		 287 aa  152  4e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0055  hypothetical protein  34.69 
 
 		 287 aa  152  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.926553  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2574  hypothetical protein  31.16 
 
 		 291 aa  152  5e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0448816 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4161  hypothetical protein  34.35 
 
 		 287 aa  152  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.226862  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2475  domain of unknown function DUF1732  32.53 
 
 		 287 aa  152  8.999999999999999e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1404  hypothetical protein  32.54 
 
 		 293 aa  151  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5203  hypothetical protein  33.9 
 
 		 287 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.208712 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4848  hypothetical protein  33.33 
 
 		 287 aa  150  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0744075  hitchhiker  0.0000405788 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0131  hypothetical protein  34.46 
 
 		 287 aa  151  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0855  hypothetical protein  30.06 
 
 		 311 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4196  hypothetical protein  32.06 
 
 		 287 aa  150  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0846841  normal  0.629685 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0377  hypothetical protein  31.85 
 
 		 287 aa  150  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000623436 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5295  hypothetical protein  33.9 
 
 		 287 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.10654  normal  0.478685 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3026  hypothetical protein  33.89 
 
 		 289 aa  149  4e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.439015  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0474  hypothetical protein  34.11 
 
 		 288 aa  149  4e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1457  hypothetical protein  34.23 
 
 		 295 aa  149  4e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000500736  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0549  hypothetical protein  33.9 
 
 		 289 aa  149  4e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.829174  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3489  hypothetical protein  31.29 
 
 		 287 aa  149  5e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0403  hypothetical protein  33.78 
 
 		 295 aa  148  8e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0196247  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03501  hypothetical protein  33.67 
 
 		 287 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.137526  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5014  hypothetical protein  33.67 
 
 		 287 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4069  hypothetical protein  33.67 
 
 		 287 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.105197  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3853  hypothetical protein  33.67 
 
 		 287 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.349633  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4145  hypothetical protein  33.67 
 
 		 287 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0120633  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4122  hypothetical protein  33.67 
 
 		 287 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.970694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0067  hypothetical protein  33.67 
 
 		 287 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0211389  hitchhiker  0.00000185241 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>